MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 3014

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017291	AAGG	2	8	266	273	50 %	0 %	50 %	0 %	384453057
2	NC_017291	GCGT	2	8	588	595	0 %	25 %	50 %	25 %	384453057
3	NC_017291	TTAA	2	8	1353	1360	50 %	50 %	0 %	0 %	384453058
4	NC_017291	AGAT	2	8	2543	2550	50 %	25 %	25 %	0 %	384453058
5	NC_017291	TGTT	2	8	2841	2848	0 %	75 %	25 %	0 %	384453059
6	NC_017291	GAAG	2	8	2952	2959	50 %	0 %	50 %	0 %	384453059
7	NC_017291	AGTA	2	8	2982	2989	50 %	25 %	25 %	0 %	384453059
8	NC_017291	TTTG	2	8	3300	3307	0 %	75 %	25 %	0 %	384453060
9	NC_017291	TCCT	2	8	3326	3333	0 %	50 %	0 %	50 %	384453060
10	NC_017291	GAAA	2	8	5255	5262	75 %	0 %	25 %	0 %	384453060
11	NC_017291	AATC	2	8	5414	5421	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017291	CGAG	2	8	5526	5533	25 %	0 %	50 %	25 %	384453061
13	NC_017291	TAAT	2	8	6732	6739	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017291	GAAT	2	8	6852	6859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017291	AGAA	2	8	6964	6971	75 %	0 %	25 %	0 %	384453062
16	NC_017291	TCCC	2	8	7281	7288	0 %	25 %	0 %	75 %	384453062
17	NC_017291	GTAG	2	8	7315	7322	25 %	25 %	50 %	0 %	384453062
18	NC_017291	AATA	2	8	8012	8019	75 %	25 %	0 %	0 %	384453063
19	NC_017291	ATGA	2	8	8483	8490	50 %	25 %	25 %	0 %	384453063
20	NC_017291	TGGA	2	8	8671	8678	25 %	25 %	50 %	0 %	384453063
21	NC_017291	CTGT	2	8	8681	8688	0 %	50 %	25 %	25 %	384453063
22	NC_017291	ATTT	2	8	9403	9410	25 %	75 %	0 %	0 %	384453063
23	NC_017291	AAAG	2	8	10227	10234	75 %	0 %	25 %	0 %	384453063
24	NC_017291	AAGT	2	8	10526	10533	50 %	25 %	25 %	0 %	384453063
25	NC_017291	AGGG	2	8	10765	10772	25 %	0 %	75 %	0 %	384453063
26	NC_017291	TAAG	2	8	10775	10782	50 %	25 %	25 %	0 %	384453063
27	NC_017291	AAAG	2	8	11068	11075	75 %	0 %	25 %	0 %	384453064
28	NC_017291	AGTA	2	8	11726	11733	50 %	25 %	25 %	0 %	384453064
29	NC_017291	TCTT	2	8	12007	12014	0 %	75 %	0 %	25 %	384453064
30	NC_017291	TAAT	2	8	12148	12155	50 %	50 %	0 %	0 %	384453064
31	NC_017291	CAAA	2	8	12459	12466	75 %	0 %	0 %	25 %	384453064
32	NC_017291	AGAT	2	8	12569	12576	50 %	25 %	25 %	0 %	384453064
33	NC_017291	AAGA	2	8	12580	12587	75 %	0 %	25 %	0 %	384453064
34	NC_017291	ACTT	2	8	12702	12709	25 %	50 %	0 %	25 %	384453064
35	NC_017291	CACT	2	8	12799	12806	25 %	25 %	0 %	50 %	384453064
36	NC_017291	GCAA	2	8	13327	13334	50 %	0 %	25 %	25 %	384453064
37	NC_017291	GAAA	2	8	13747	13754	75 %	0 %	25 %	0 %	384453064
38	NC_017291	AGAT	2	8	14316	14323	50 %	25 %	25 %	0 %	384453065
39	NC_017291	TTGT	2	8	14366	14373	0 %	75 %	25 %	0 %	384453065
40	NC_017291	GGAT	2	8	14950	14957	25 %	25 %	50 %	0 %	384453065
41	NC_017291	CCCA	2	8	15421	15428	25 %	0 %	0 %	75 %	384453065
42	NC_017291	TAAA	2	8	17025	17032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017291	AGAA	2	8	17165	17172	75 %	0 %	25 %	0 %	384453067
44	NC_017291	TCTT	2	8	17435	17442	0 %	75 %	0 %	25 %	384453067
45	NC_017291	TTTC	2	8	17682	17689	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_017291	GTCA	2	8	17837	17844	25 %	25 %	25 %	25 %	384453068
47	NC_017291	AAGC	2	8	18228	18235	50 %	0 %	25 %	25 %	384453068
48	NC_017291	ATTA	2	8	18368	18375	50 %	50 %	0 %	0 %	384453068
49	NC_017291	ATTA	2	8	18990	18997	50 %	50 %	0 %	0 %	384453069
50	NC_017291	GTTT	2	8	19263	19270	0 %	75 %	25 %	0 %	384453069
51	NC_017291	TTTG	2	8	19503	19510	0 %	75 %	25 %	0 %	384453069
52	NC_017291	TGCC	2	8	19535	19542	0 %	25 %	25 %	50 %	384453069
53	NC_017291	GCGT	2	8	19667	19674	0 %	25 %	50 %	25 %	384453069
54	NC_017291	TGGT	2	8	20448	20455	0 %	50 %	50 %	0 %	384453070
55	NC_017291	TAAA	2	8	21088	21095	75 %	25 %	0 %	0 %	384453070
56	NC_017291	TATG	2	8	21587	21594	25 %	50 %	25 %	0 %	384453070
57	NC_017291	CAAT	2	8	22282	22289	50 %	25 %	0 %	25 %	384453071
58	NC_017291	AGAA	2	8	22699	22706	75 %	0 %	25 %	0 %	384453071
59	NC_017291	TGAT	2	8	22906	22913	25 %	50 %	25 %	0 %	384453071
60	NC_017291	AGCT	2	8	24167	24174	25 %	25 %	25 %	25 %	384453072
61	NC_017291	AAAT	2	8	24504	24511	75 %	25 %	0 %	0 %	384453072
62	NC_017291	AATT	2	8	24629	24636	50 %	50 %	0 %	0 %	384453072
63	NC_017291	ATAA	2	8	24696	24703	75 %	25 %	0 %	0 %	384453072
64	NC_017291	TTCT	2	8	24927	24934	0 %	75 %	0 %	25 %	384453072
65	NC_017291	TAGT	2	8	24985	24992	25 %	50 %	25 %	0 %	384453072
66	NC_017291	GAAC	2	8	25444	25451	50 %	0 %	25 %	25 %	384453072
67	NC_017291	ATTC	2	8	25883	25890	25 %	50 %	0 %	25 %	384453072
68	NC_017291	TTTC	2	8	26015	26022	0 %	75 %	0 %	25 %	384453072
69	NC_017291	ATAG	2	8	26110	26117	50 %	25 %	25 %	0 %	384453072
70	NC_017291	TAAA	2	8	26474	26481	75 %	25 %	0 %	0 %	384453072
71	NC_017291	ATTT	2	8	26656	26663	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017291	ATTA	2	8	26667	26674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017291	CTGG	2	8	27187	27194	0 %	25 %	50 %	25 %	384453073
74	NC_017291	AATT	2	8	27960	27967	50 %	50 %	0 %	0 %	384453073
75	NC_017291	AAAT	2	8	28809	28816	75 %	25 %	0 %	0 %	384453073
76	NC_017291	GGCA	2	8	29087	29094	25 %	0 %	50 %	25 %	384453073
77	NC_017291	AGGG	2	8	29432	29439	25 %	0 %	75 %	0 %	384453074
78	NC_017291	GAAT	2	8	29626	29633	50 %	25 %	25 %	0 %	384453075
79	NC_017291	AGAA	2	8	29791	29798	75 %	0 %	25 %	0 %	384453075
80	NC_017291	ACCA	2	8	30241	30248	50 %	0 %	0 %	50 %	384453075
81	NC_017291	GTTT	2	8	31412	31419	0 %	75 %	25 %	0 %	384453077
82	NC_017291	TTTC	2	8	31652	31659	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017291	TCTA	2	8	32056	32063	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017291	AATT	2	8	32380	32387	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017291	TTAA	2	8	32420	32427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017291	ATTT	2	8	32435	32442	25 %	75 %	0 %	0 %	384453079
87	NC_017291	TTGT	2	8	32461	32468	0 %	75 %	25 %	0 %	384453079
88	NC_017291	TAGA	2	8	32667	32674	50 %	25 %	25 %	0 %	384453079
89	NC_017291	TTTA	2	8	33121	33128	25 %	75 %	0 %	0 %	384453079
90	NC_017291	TTAA	2	8	33516	33523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017291	AGAT	2	8	33559	33566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017291	TGAA	2	8	34018	34025	50 %	25 %	25 %	0 %	384453081
93	NC_017291	GTAC	2	8	34096	34103	25 %	25 %	25 %	25 %	384453081
94	NC_017291	GATA	2	8	34132	34139	50 %	25 %	25 %	0 %	384453081
95	NC_017291	TCTT	2	8	34392	34399	0 %	75 %	0 %	25 %	384453082
96	NC_017291	AGGA	2	8	35344	35351	50 %	0 %	50 %	0 %	384453082
97	NC_017291	TAAT	2	8	36132	36139	50 %	50 %	0 %	0 %	384453083
98	NC_017291	CGCT	2	8	36848	36855	0 %	25 %	25 %	50 %	384453083
99	NC_017291	TCAA	2	8	37781	37788	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_017291	AAAG	2	8	38203	38210	75 %	0 %	25 %	0 %	384453084
101	NC_017291	TAAT	2	8	38219	38226	50 %	50 %	0 %	0 %	384453084
102	NC_017291	TCAA	2	8	38355	38362	50 %	25 %	0 %	25 %	384453084
103	NC_017291	TTTA	2	8	38688	38695	25 %	75 %	0 %	0 %	384453084
104	NC_017291	CTTT	2	8	38818	38825	0 %	75 %	0 %	25 %	384453084
105	NC_017291	AGCG	2	8	39007	39014	25 %	0 %	50 %	25 %	384453084
106	NC_017291	CCTG	2	8	40303	40310	0 %	25 %	25 %	50 %	384453087
107	NC_017291	GAAA	2	8	41244	41251	75 %	0 %	25 %	0 %	384453087
108	NC_017291	AGCA	2	8	41415	41422	50 %	0 %	25 %	25 %	384453087
109	NC_017291	CTGT	2	8	41883	41890	0 %	50 %	25 %	25 %	384453087
110	NC_017291	TCTT	2	8	41923	41930	0 %	75 %	0 %	25 %	384453087
111	NC_017291	GAAG	2	8	42334	42341	50 %	0 %	50 %	0 %	384453087
112	NC_017291	AATA	2	8	42365	42372	75 %	25 %	0 %	0 %	384453087
113	NC_017291	GAAA	2	8	43502	43509	75 %	0 %	25 %	0 %	384453091
114	NC_017291	GTCG	2	8	44200	44207	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017291	TTAA	2	8	44230	44237	50 %	50 %	0 %	0 %	384453092
116	NC_017291	ATCA	2	8	44819	44826	50 %	25 %	0 %	25 %	384453092
117	NC_017291	ATGA	2	8	45097	45104	50 %	25 %	25 %	0 %	384453092
118	NC_017291	TAAA	2	8	45996	46003	75 %	25 %	0 %	0 %	384453093
119	NC_017291	GAAA	2	8	46978	46985	75 %	0 %	25 %	0 %	384453095
120	NC_017291	TCTT	2	8	47084	47091	0 %	75 %	0 %	25 %	384453095
121	NC_017291	GCTT	2	8	47613	47620	0 %	50 %	25 %	25 %	384453095
122	NC_017291	AAGA	2	8	48055	48062	75 %	0 %	25 %	0 %	384453096
123	NC_017291	TGTT	2	8	48465	48472	0 %	75 %	25 %	0 %	384453096
124	NC_017291	ATAA	2	8	49533	49540	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017291	TAAA	2	8	49702	49709	75 %	25 %	0 %	0 %	384453097
126	NC_017291	AAGC	2	8	49731	49738	50 %	0 %	25 %	25 %	384453097
127	NC_017291	CCAA	2	8	49755	49762	50 %	0 %	0 %	50 %	384453097
128	NC_017291	TTCC	2	8	49902	49909	0 %	50 %	0 %	50 %	384453097
129	NC_017291	AACA	2	8	50879	50886	75 %	0 %	0 %	25 %	384453097
130	NC_017291	AAAG	2	8	52613	52620	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017291	TTTA	2	8	52623	52630	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017291	GAAG	2	8	52726	52733	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017291	ATCC	2	8	53032	53039	25 %	25 %	0 %	50 %	384453098
134	NC_017291	AGCA	2	8	53324	53331	50 %	0 %	25 %	25 %	384453098
135	NC_017291	TTCA	2	8	53484	53491	25 %	50 %	0 %	25 %	384453098
136	NC_017291	GTAT	2	8	54137	54144	25 %	50 %	25 %	0 %	384453099
137	NC_017291	CATA	2	8	54332	54339	50 %	25 %	0 %	25 %	384453099
138	NC_017291	AAAG	2	8	54791	54798	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017291	TAGC	2	8	55863	55870	25 %	25 %	25 %	25 %	384453101
140	NC_017291	CTGT	2	8	56042	56049	0 %	50 %	25 %	25 %	384453101
141	NC_017291	CTTT	2	8	56432	56439	0 %	75 %	0 %	25 %	384453102
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