MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 14458

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017291	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453057
2	NC_017291	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453057
3	NC_017291	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453057
4	NC_017291	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453057
5	NC_017291	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453057
6	NC_017291	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453057
7	NC_017291	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453057
8	NC_017291	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453057
9	NC_017291	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453057
10	NC_017291	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453057
11	NC_017291	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453057
12	NC_017291	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453057
13	NC_017291	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453057
14	NC_017291	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453057
15	NC_017291	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453057
16	NC_017291	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
17	NC_017291	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453058
18	NC_017291	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
19	NC_017291	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453058
20	NC_017291	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
21	NC_017291	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
22	NC_017291	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453058
23	NC_017291	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
24	NC_017291	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453058
25	NC_017291	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
26	NC_017291	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453058
27	NC_017291	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
28	NC_017291	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453058
29	NC_017291	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453058
30	NC_017291	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453058
31	NC_017291	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453058
32	NC_017291	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453058
33	NC_017291	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453059
34	NC_017291	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
35	NC_017291	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453059
36	NC_017291	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453059
37	NC_017291	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
38	NC_017291	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453059
39	NC_017291	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
40	NC_017291	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453059
41	NC_017291	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
42	NC_017291	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
43	NC_017291	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
44	NC_017291	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453060
45	NC_017291	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453060
46	NC_017291	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
47	NC_017291	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453060
48	NC_017291	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453060
49	NC_017291	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
50	NC_017291	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453060
51	NC_017291	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
52	NC_017291	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453060
53	NC_017291	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453060
54	NC_017291	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
55	NC_017291	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453060
56	NC_017291	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
57	NC_017291	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453060
58	NC_017291	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453060
59	NC_017291	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
60	NC_017291	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
61	NC_017291	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453060
62	NC_017291	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
63	NC_017291	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453060
64	NC_017291	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453060
65	NC_017291	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453060
66	NC_017291	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453061
67	NC_017291	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453061
68	NC_017291	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453061
69	NC_017291	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
70	NC_017291	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
71	NC_017291	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
72	NC_017291	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
73	NC_017291	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453061
74	NC_017291	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
75	NC_017291	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
76	NC_017291	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
77	NC_017291	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
78	NC_017291	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
79	NC_017291	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453061
80	NC_017291	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453061
81	NC_017291	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453061
82	NC_017291	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453061
83	NC_017291	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453061
84	NC_017291	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453061
85	NC_017291	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453061
86	NC_017291	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453061
87	NC_017291	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453061
88	NC_017291	ACA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
89	NC_017291	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453061
90	NC_017291	CAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453061
91	NC_017291	GAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453062
92	NC_017291	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453062
93	NC_017291	ACA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384453062
94	NC_017291	GTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384453062
95	NC_017291	TGT	2	6	7013	7018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453062
96	NC_017291	TTC	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453062
97	NC_017291	GTT	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453062
98	NC_017291	CAT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453062
99	NC_017291	AGA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453062
100	NC_017291	TAA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384453062
101	NC_017291	TTG	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453062
102	NC_017291	CTC	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453062
103	NC_017291	GGA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453062
104	NC_017291	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453062
105	NC_017291	ATT	2	6	7779	7784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453062
106	NC_017291	TGC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453062
107	NC_017291	TTC	2	6	7892	7897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453062
108	NC_017291	TTG	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453063
109	NC_017291	TGC	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384453063
110	NC_017291	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453063
111	NC_017291	TTA	2	6	8253	8258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453063
112	NC_017291	CTT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453063
113	NC_017291	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453063
114	NC_017291	TTC	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453063
115	NC_017291	TTC	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453063
116	NC_017291	AGG	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453063
117	NC_017291	CCT	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384453063
118	NC_017291	AAG	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453063
119	NC_017291	GTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453063
120	NC_017291	GAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453063
121	NC_017291	CAT	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384453063
122	NC_017291	TTC	2	6	9023	9028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453063
123	NC_017291	GAA	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453063
124	NC_017291	GAG	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384453063
125	NC_017291	AGT	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384453063
126	NC_017291	TTA	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384453063
127	NC_017291	AGA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384453063
128	NC_017291	GTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384453063
129	NC_017291	CTT	2	6	9976	9981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384453063
130	NC_017291	GCA	2	6	9997	10002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384453063
131	NC_017291	CCA	2	6	10040	10045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384453063
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