MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci C19/98 chromosome

Total Repeats: 272

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017291	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017291	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017291	TC	3	6	31852	31857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017291	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017291	TA	3	6	52216	52221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017291	TG	3	6	63309	63314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017291	AG	3	6	70239	70244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017291	AT	3	6	94016	94021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017291	GA	3	6	97072	97077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017291	GA	3	6	98981	98986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017291	AG	3	6	101792	101797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017291	TC	3	6	108276	108281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017291	TA	3	6	108461	108466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017291	AG	3	6	112366	112371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017291	TA	4	8	124060	124067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017291	TA	4	8	125328	125335	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017291	TG	3	6	128431	128436	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017291	AC	3	6	128565	128570	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017291	AT	3	6	130242	130247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017291	TA	3	6	130525	130530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017291	CT	3	6	130621	130626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017291	CT	3	6	130752	130757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_017291	GA	3	6	134364	134369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017291	AG	3	6	158086	158091	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017291	TA	3	6	173176	173181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017291	AG	3	6	173220	173225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017291	AT	3	6	175415	175420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017291	AG	3	6	179475	179480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017291	CT	3	6	193716	193721	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017291	AG	3	6	198352	198357	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017291	TA	4	8	198373	198380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017291	AC	3	6	199241	199246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_017291	AT	3	6	210365	210370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017291	AT	3	6	215441	215446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017291	GA	3	6	215501	215506	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017291	GT	3	6	215541	215546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017291	CT	3	6	215578	215583	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017291	AG	3	6	215805	215810	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017291	TC	3	6	215864	215869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_017291	AG	3	6	222923	222928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017291	TA	4	8	232258	232265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017291	AG	3	6	237004	237009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017291	AT	3	6	237074	237079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017291	GA	3	6	239892	239897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017291	AG	3	6	241101	241106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017291	AG	3	6	244067	244072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017291	GT	3	6	261610	261615	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017291	TC	3	6	266722	266727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017291	AT	4	8	266760	266767	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017291	TC	3	6	267864	267869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017291	TG	3	6	268010	268015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017291	TG	3	6	276794	276799	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017291	GT	3	6	277636	277641	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017291	TC	3	6	281958	281963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017291	TA	3	6	282007	282012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017291	AT	3	6	301187	301192	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017291	TC	3	6	301493	301498	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017291	TG	3	6	307746	307751	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017291	AC	3	6	310592	310597	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017291	AG	3	6	313576	313581	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017291	GA	3	6	313626	313631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017291	AC	3	6	319131	319136	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017291	TG	3	6	327235	327240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017291	GA	3	6	327281	327286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017291	TA	3	6	330052	330057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017291	AG	3	6	330199	330204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017291	TC	3	6	339661	339666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017291	TA	3	6	342655	342660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017291	GT	3	6	345083	345088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017291	TG	3	6	346607	346612	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017291	CT	3	6	348158	348163	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017291	TA	3	6	348231	348236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017291	TA	3	6	349643	349648	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017291	TA	3	6	353810	353815	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017291	CT	4	8	356426	356433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017291	TA	3	6	359917	359922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017291	AT	3	6	365108	365113	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017291	TA	3	6	367749	367754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017291	AG	3	6	368755	368760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017291	AT	3	6	372149	372154	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017291	CT	3	6	373725	373730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017291	TA	3	6	384270	384275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017291	TA	3	6	398870	398875	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017291	TC	3	6	418933	418938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017291	AT	3	6	422817	422822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017291	GA	3	6	427149	427154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017291	GA	3	6	437884	437889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017291	TC	3	6	442417	442422	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017291	AG	3	6	444401	444406	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017291	CT	3	6	444472	444477	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017291	AG	3	6	445046	445051	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017291	TA	3	6	445589	445594	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017291	CT	3	6	446872	446877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017291	TC	3	6	452502	452507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017291	TG	3	6	457828	457833	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017291	AG	3	6	457977	457982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017291	CT	4	8	460730	460737	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017291	AG	3	6	467559	467564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017291	AG	3	6	474130	474135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017291	TA	3	6	475444	475449	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017291	AC	3	6	476903	476908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017291	AG	3	6	476964	476969	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017291	AG	3	6	478429	478434	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017291	TA	3	6	478509	478514	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017291	AT	3	6	479052	479057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017291	AG	3	6	479084	479089	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017291	CT	3	6	484926	484931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017291	AG	4	8	486914	486921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017291	TC	3	6	488487	488492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017291	TA	3	6	491249	491254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017291	AT	3	6	496593	496598	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017291	GA	3	6	501770	501775	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017291	TC	3	6	503222	503227	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017291	AT	3	6	510961	510966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017291	AT	3	6	510999	511004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017291	AG	3	6	517684	517689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017291	GT	3	6	526698	526703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017291	CT	4	8	542962	542969	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017291	AT	3	6	554027	554032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017291	GT	3	6	561984	561989	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017291	GA	3	6	587229	587234	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017291	TG	3	6	587335	587340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017291	AC	3	6	587481	587486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017291	AG	3	6	587705	587710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017291	AC	3	6	598161	598166	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017291	GT	3	6	598181	598186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017291	AG	3	6	598292	598297	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017291	TC	3	6	598476	598481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017291	AT	3	6	601132	601137	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017291	TA	4	8	601276	601283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017291	GA	5	10	618404	618413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017291	CT	3	6	618449	618454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017291	CT	3	6	619833	619838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017291	AC	3	6	624807	624812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017291	TA	3	6	626602	626607	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017291	AT	3	6	626622	626627	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017291	CT	3	6	628945	628950	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017291	TC	4	8	642667	642674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017291	TA	3	6	642675	642680	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017291	TA	3	6	642773	642778	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017291	AT	3	6	643926	643931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017291	CA	3	6	651443	651448	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017291	AT	3	6	652524	652529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017291	TA	3	6	652783	652788	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017291	TA	3	6	653460	653465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017291	TC	3	6	655270	655275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017291	AG	3	6	658997	659002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017291	TA	3	6	659053	659058	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017291	CA	3	6	661763	661768	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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151	NC_017291	AT	3	6	672997	673002	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017291	CT	3	6	673201	673206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017291	CT	3	6	685339	685344	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.