MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017290	ATTTAA	2	12	33598	33609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017290	TTTTAA	2	12	42721	42732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017290	ATTATA	2	12	77761	77772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017290	TTTCTT	2	12	123039	123050	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_017290	TTCCGT	2	12	148029	148040	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017290	AGAAAA	2	12	163065	163076	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017290	TAAAGA	2	12	226843	226854	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017290	ATTATA	2	12	239712	239723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017290	TTGAAT	2	12	244025	244036	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017290	ATATAA	2	12	261778	261789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017290	GGGAAA	2	12	267745	267756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017290	TAAGAA	2	12	277664	277675	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017290	TAAAAT	2	12	291672	291683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017290	GTCTTT	2	12	327994	328005	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017290	TGAAAA	2	12	337053	337064	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017290	ATTTTT	2	12	371440	371451	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017290	AAAATC	2	12	396448	396459	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_017290	AAAAAT	2	12	470426	470437	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017290	TATAAT	2	12	489881	489892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017290	TTAATT	2	12	507577	507588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017290	CTTTTG	2	12	656306	656317	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_017290	AAATAC	2	12	661864	661875	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_017290	CAATCT	2	12	662450	662461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017290	TCATTC	2	12	664699	664710	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017290	AAGGGA	2	12	703550	703561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017290	ATTAAT	2	12	706240	706251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017290	TTAGTG	2	12	708397	708408	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017290	AAAGAC	2	12	712551	712562	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017290	TAAAAG	2	12	739794	739805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017290	ATTTTA	2	12	752486	752497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017290	TAACCT	2	12	793867	793878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017290	CTATGT	2	12	813976	813987	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017290	ATTTTA	2	12	951144	951155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017290	ATCTAT	2	12	966437	966448	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017290	ATAAAA	2	12	982885	982896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017290	TGAGAA	2	12	995735	995746	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017290	TTTTCT	2	12	1013841	1013852	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017290	AAATAA	2	12	1019064	1019075	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017290	TCGCTT	2	12	1021924	1021935	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017290	TTATCC	2	12	1022828	1022839	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017290	AAATTT	2	12	1024969	1024980	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017290	CTTTGT	2	12	1036412	1036423	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017290	AAAAAT	2	12	1056687	1056698	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017290	TAATTT	2	12	1103319	1103330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017290	AAAATA	2	12	1141820	1141831	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017290	TACAGA	2	12	1154498	1154509	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_017290	GTTAAA	2	12	1167429	1167440	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017290	CCTTCG	2	12	1170218	1170229	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.