MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017290	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	384452086
2	NC_017290	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	384452086
3	NC_017290	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	384452088
4	NC_017290	ATAAA	2	10	13046	13055	80 %	20 %	0 %	0 %	384452090
5	NC_017290	AACTC	2	10	13490	13499	40 %	20 %	0 %	40 %	384452090
6	NC_017290	GTTTT	2	10	13560	13569	0 %	80 %	20 %	0 %	384452090
7	NC_017290	GAAAC	2	10	14328	14337	60 %	0 %	20 %	20 %	384452091
8	NC_017290	AACAA	2	10	15357	15366	80 %	0 %	0 %	20 %	384452091
9	NC_017290	AATAG	2	10	17069	17078	60 %	20 %	20 %	0 %	384452093
10	NC_017290	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	384452095
11	NC_017290	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	384452096
12	NC_017290	GCCAC	2	10	29447	29456	20 %	0 %	20 %	60 %	384452100
13	NC_017290	AAGGA	2	10	38579	38588	60 %	0 %	40 %	0 %	384452110
14	NC_017290	CCATA	2	10	38786	38795	40 %	20 %	0 %	40 %	384452110
15	NC_017290	CTTTA	2	10	38952	38961	20 %	60 %	0 %	20 %	384452110
16	NC_017290	CTTTC	2	10	43215	43224	0 %	60 %	0 %	40 %	384452116
17	NC_017290	ACAAA	2	10	43877	43886	80 %	0 %	0 %	20 %	384452117
18	NC_017290	TATGG	2	10	44287	44296	20 %	40 %	40 %	0 %	384452118
19	NC_017290	TCTTT	2	10	46095	46104	0 %	80 %	0 %	20 %	384452120
20	NC_017290	AGCCC	2	10	47092	47101	20 %	0 %	20 %	60 %	384452121
21	NC_017290	TCAAA	2	10	47447	47456	60 %	20 %	0 %	20 %	384452121
22	NC_017290	TCTAT	2	10	49566	49575	20 %	60 %	0 %	20 %	384452123
23	NC_017290	TTTGG	2	10	51480	51489	0 %	60 %	40 %	0 %	384452123
24	NC_017290	TTTTC	2	10	55349	55358	0 %	80 %	0 %	20 %	384452126
25	NC_017290	GTAAG	2	10	57397	57406	40 %	20 %	40 %	0 %	384452129
26	NC_017290	TCTTT	2	10	59413	59422	0 %	80 %	0 %	20 %	384452131
27	NC_017290	AAAAT	2	10	60219	60228	80 %	20 %	0 %	0 %	384452132
28	NC_017290	TAGTT	2	10	62821	62830	20 %	60 %	20 %	0 %	384452132
29	NC_017290	GAATG	2	10	62837	62846	40 %	20 %	40 %	0 %	384452132
30	NC_017290	TTGTT	2	10	63823	63832	0 %	80 %	20 %	0 %	384452133
31	NC_017290	TCCTA	2	10	64887	64896	20 %	40 %	0 %	40 %	384452134
32	NC_017290	AGAAA	2	10	70143	70152	80 %	0 %	20 %	0 %	384452138
33	NC_017290	GGATA	2	10	70951	70960	40 %	20 %	40 %	0 %	384452139
34	NC_017290	ATAGC	2	10	74390	74399	40 %	20 %	20 %	20 %	384452143
35	NC_017290	GCACA	2	10	77223	77232	40 %	0 %	20 %	40 %	384452145
36	NC_017290	AAAGA	2	10	78176	78185	80 %	0 %	20 %	0 %	384452146
37	NC_017290	AGTTC	2	10	79181	79190	20 %	40 %	20 %	20 %	384452146
38	NC_017290	CGTAT	2	10	81550	81559	20 %	40 %	20 %	20 %	384452148
39	NC_017290	GAAAA	2	10	82760	82769	80 %	0 %	20 %	0 %	384452149
40	NC_017290	CTTTT	2	10	85648	85657	0 %	80 %	0 %	20 %	384452152
41	NC_017290	CAAAG	2	10	87119	87128	60 %	0 %	20 %	20 %	384452154
42	NC_017290	AACAA	2	10	87286	87295	80 %	0 %	0 %	20 %	384452154
43	NC_017290	AAAGA	2	10	89192	89201	80 %	0 %	20 %	0 %	384452156
44	NC_017290	TTTTC	2	10	90207	90216	0 %	80 %	0 %	20 %	384452156
45	NC_017290	AGGAT	2	10	90730	90739	40 %	20 %	40 %	0 %	384452156
46	NC_017290	ATAAC	2	10	90816	90825	60 %	20 %	0 %	20 %	384452156
47	NC_017290	TGGCA	2	10	93301	93310	20 %	20 %	40 %	20 %	384452157
48	NC_017290	TGTTT	2	10	95026	95035	0 %	80 %	20 %	0 %	384452159
49	NC_017290	TCACC	2	10	96600	96609	20 %	20 %	0 %	60 %	384452160
50	NC_017290	AAAAT	2	10	96735	96744	80 %	20 %	0 %	0 %	384452160
51	NC_017290	TTAAT	2	10	97779	97788	40 %	60 %	0 %	0 %	384452161
52	NC_017290	ATTAC	2	10	102911	102920	40 %	40 %	0 %	20 %	384452169
53	NC_017290	CTACA	2	10	103285	103294	40 %	20 %	0 %	40 %	384452169
54	NC_017290	AATTA	2	10	104832	104841	60 %	40 %	0 %	0 %	384452171
55	NC_017290	CTATA	2	10	105822	105831	40 %	40 %	0 %	20 %	384452172
56	NC_017290	GTTTG	2	10	108783	108792	0 %	60 %	40 %	0 %	384452175
57	NC_017290	AGTTA	2	10	115588	115597	40 %	40 %	20 %	0 %	384452190
58	NC_017290	AGTTT	2	10	116078	116087	20 %	60 %	20 %	0 %	384452191
59	NC_017290	TTTGC	2	10	116993	117002	0 %	60 %	20 %	20 %	384452193
60	NC_017290	TTTAC	2	10	119190	119199	20 %	60 %	0 %	20 %	384452196
61	NC_017290	AATTA	2	10	122083	122092	60 %	40 %	0 %	0 %	384452199
62	NC_017290	GAGAT	2	10	123437	123446	40 %	20 %	40 %	0 %	384452200
63	NC_017290	GTCAA	2	10	124756	124765	40 %	20 %	20 %	20 %	384452202
64	NC_017290	TAGGG	2	10	127228	127237	20 %	20 %	60 %	0 %	384452205
65	NC_017290	AACTT	2	10	128160	128169	40 %	40 %	0 %	20 %	384452205
66	NC_017290	TGTCA	2	10	132045	132054	20 %	40 %	20 %	20 %	384452208
67	NC_017290	AAAAG	2	10	135451	135460	80 %	0 %	20 %	0 %	384452210
68	NC_017290	TAAAA	2	10	135732	135741	80 %	20 %	0 %	0 %	384452210
69	NC_017290	GATTT	2	10	137991	138000	20 %	60 %	20 %	0 %	384452212
70	NC_017290	TTGTT	2	10	138333	138342	0 %	80 %	20 %	0 %	384452212
71	NC_017290	AAGAA	2	10	138814	138823	80 %	0 %	20 %	0 %	384452212
72	NC_017290	TTCTT	2	10	139407	139416	0 %	80 %	0 %	20 %	384452213
73	NC_017290	CTTTG	2	10	141312	141321	0 %	60 %	20 %	20 %	384452215
74	NC_017290	AGAAA	2	10	143349	143358	80 %	0 %	20 %	0 %	384452218
75	NC_017290	AAAGA	2	10	146014	146023	80 %	0 %	20 %	0 %	384452220
76	NC_017290	TACTC	2	10	149646	149655	20 %	40 %	0 %	40 %	384452226
77	NC_017290	CGTTT	2	10	149693	149702	0 %	60 %	20 %	20 %	384452226
78	NC_017290	ATTTT	2	10	149833	149842	20 %	80 %	0 %	0 %	384452226
79	NC_017290	ACCAT	2	10	151864	151873	40 %	20 %	0 %	40 %	384452227
80	NC_017290	CAGAA	2	10	152829	152838	60 %	0 %	20 %	20 %	384452228
81	NC_017290	TTCAT	2	10	153399	153408	20 %	60 %	0 %	20 %	384452228
82	NC_017290	AAAGG	2	10	154229	154238	60 %	0 %	40 %	0 %	384452229
83	NC_017290	ATAGG	2	10	155921	155930	40 %	20 %	40 %	0 %	384452231
84	NC_017290	TTTGA	2	10	156007	156016	20 %	60 %	20 %	0 %	384452231
85	NC_017290	AAGGT	2	10	160948	160957	40 %	20 %	40 %	0 %	384452234
86	NC_017290	TTTTG	2	10	161887	161896	0 %	80 %	20 %	0 %	384452236
87	NC_017290	GGGGC	2	10	162034	162043	0 %	0 %	80 %	20 %	384452236
88	NC_017290	AGCAT	2	10	163326	163335	40 %	20 %	20 %	20 %	384452238
89	NC_017290	AAATG	2	10	166441	166450	60 %	20 %	20 %	0 %	384452239
90	NC_017290	GGGGA	2	10	168216	168225	20 %	0 %	80 %	0 %	384452240
91	NC_017290	CTGTT	2	10	169744	169753	0 %	60 %	20 %	20 %	384452242
92	NC_017290	AATGA	2	10	169779	169788	60 %	20 %	20 %	0 %	384452242
93	NC_017290	ATTTT	2	10	173238	173247	20 %	80 %	0 %	0 %	384452247
94	NC_017290	GAGAG	2	10	173255	173264	40 %	0 %	60 %	0 %	384452247
95	NC_017290	GATTT	2	10	177621	177630	20 %	60 %	20 %	0 %	384452252
96	NC_017290	CTAAG	2	10	181196	181205	40 %	20 %	20 %	20 %	384452254
97	NC_017290	TTTTC	2	10	181796	181805	0 %	80 %	0 %	20 %	384452254
98	NC_017290	GGTAC	2	10	183791	183800	20 %	20 %	40 %	20 %	384452256
99	NC_017290	AGGGA	2	10	186978	186987	40 %	0 %	60 %	0 %	384452260
100	NC_017290	AGGAA	2	10	188001	188010	60 %	0 %	40 %	0 %	384452261
101	NC_017290	TTCTT	2	10	188380	188389	0 %	80 %	0 %	20 %	384452261
102	NC_017290	GATAA	2	10	191023	191032	60 %	20 %	20 %	0 %	384452261
103	NC_017290	CCCTT	2	10	193227	193236	0 %	40 %	0 %	60 %	384452262
104	NC_017290	AGTTA	2	10	194218	194227	40 %	40 %	20 %	0 %	384452263
105	NC_017290	TTATT	2	10	194238	194247	20 %	80 %	0 %	0 %	384452263
106	NC_017290	AGGGT	2	10	197162	197171	20 %	20 %	60 %	0 %	384452265
107	NC_017290	TGGAT	2	10	197603	197612	20 %	40 %	40 %	0 %	384452265
108	NC_017290	CTAAA	2	10	197660	197669	60 %	20 %	0 %	20 %	384452265
109	NC_017290	CTTTA	2	10	197963	197972	20 %	60 %	0 %	20 %	384452265
110	NC_017290	AAAAT	2	10	198140	198149	80 %	20 %	0 %	0 %	384452265
111	NC_017290	TTGGT	2	10	201443	201452	0 %	60 %	40 %	0 %	384452268
112	NC_017290	AGCAA	2	10	203920	203929	60 %	0 %	20 %	20 %	384452270
113	NC_017290	TAATG	2	10	205035	205044	40 %	40 %	20 %	0 %	384452271
114	NC_017290	AAAAT	2	10	206981	206990	80 %	20 %	0 %	0 %	384452274
115	NC_017290	TGGTT	2	10	207900	207909	0 %	60 %	40 %	0 %	384452274
116	NC_017290	TCTCT	2	10	208678	208687	0 %	60 %	0 %	40 %	384452276
117	NC_017290	GAAAA	2	10	214211	214220	80 %	0 %	20 %	0 %	384452283
118	NC_017290	TAGCA	2	10	214577	214586	40 %	20 %	20 %	20 %	384452284
119	NC_017290	AAGAA	2	10	215275	215284	80 %	0 %	20 %	0 %	384452284
120	NC_017290	GAAAG	2	10	216575	216584	60 %	0 %	40 %	0 %	384452286
121	NC_017290	GTTAG	2	10	218559	218568	20 %	40 %	40 %	0 %	384452287
122	NC_017290	TGGAT	2	10	218711	218720	20 %	40 %	40 %	0 %	384452287
123	NC_017290	TTGTA	2	10	221375	221384	20 %	60 %	20 %	0 %	384452287
124	NC_017290	GCTTA	2	10	222506	222515	20 %	40 %	20 %	20 %	384452287
125	NC_017290	GCTGA	2	10	227385	227394	20 %	20 %	40 %	20 %	384452291
126	NC_017290	AGGAG	2	10	230695	230704	40 %	0 %	60 %	0 %	384452296
127	NC_017290	TGCCC	2	10	230998	231007	0 %	20 %	20 %	60 %	384452296
128	NC_017290	TACCT	2	10	231864	231873	20 %	40 %	0 %	40 %	384452297
129	NC_017290	CTAGT	2	10	232155	232164	20 %	40 %	20 %	20 %	384452297
130	NC_017290	TGCGT	2	10	234322	234331	0 %	40 %	40 %	20 %	384452299
131	NC_017290	GTTTT	2	10	234367	234376	0 %	80 %	20 %	0 %	384452299
132	NC_017290	TTCAG	2	10	241357	241366	20 %	40 %	20 %	20 %	384452305
133	NC_017290	TTTAG	2	10	242647	242656	20 %	60 %	20 %	0 %	384452305
134	NC_017290	GTTGT	2	10	243452	243461	0 %	60 %	40 %	0 %	384452307
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