MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 1456

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017290	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017290	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017290	TTC	2	6	1146	1151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017290	GAA	2	6	1152	1157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017290	TAT	2	6	3058	3063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017290	ATT	3	9	3073	3081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017290	TGT	2	6	3086	3091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017290	CAA	2	6	5338	5343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017290	TTG	2	6	5349	5354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017290	GAA	2	6	6881	6886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017290	AAT	2	6	16851	16856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017290	TTA	2	6	16931	16936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017290	AAT	2	6	17009	17014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017290	GTT	2	6	20323	20328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017290	TCC	2	6	20329	20334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_017290	TTA	2	6	20339	20344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017290	TCT	2	6	20387	20392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017290	AAT	2	6	20400	20405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017290	TAA	2	6	21723	21728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017290	TAA	2	6	21787	21792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017290	AGA	2	6	23902	23907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017290	ATT	2	6	26536	26541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017290	TTC	2	6	26615	26620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017290	AGG	2	6	31746	31751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017290	AGA	2	6	31969	31974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017290	CTT	2	6	31984	31989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017290	AAT	2	6	32409	32414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017290	TTA	2	6	33430	33435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017290	AAG	2	6	33451	33456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017290	TGT	3	9	33530	33538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017290	AAG	2	6	33575	33580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017290	TGG	2	6	34232	34237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017290	TTC	2	6	37591	37596	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017290	TTC	2	6	37632	37637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017290	TGC	2	6	37680	37685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017290	AGA	2	6	37870	37875	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017290	TAT	2	6	38105	38110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017290	GAA	2	6	39481	39486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017290	TTA	2	6	42387	42392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017290	GAA	2	6	42409	42414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017290	AGT	2	6	42698	42703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017290	CAA	2	6	42773	42778	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017290	GTT	2	6	43450	43455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017290	GAC	2	6	44142	44147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_017290	ACG	2	6	44177	44182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017290	GTC	2	6	44218	44223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017290	GAA	2	6	49513	49518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017290	GAT	2	6	52232	52237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017290	TCG	2	6	52299	52304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017290	TTG	2	6	52314	52319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017290	GTC	2	6	52418	52423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017290	AAG	2	6	52518	52523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017290	CCT	2	6	52736	52741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017290	TGC	2	6	52814	52819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_017290	CCT	2	6	52820	52825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_017290	TGC	2	6	52826	52831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017290	AGG	2	6	52845	52850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017290	AAT	2	6	54534	54539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017290	TGG	2	6	57865	57870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017290	GGT	2	6	58094	58099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017290	ATT	2	6	59560	59565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017290	TTA	2	6	59587	59592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017290	TAA	2	6	59661	59666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017290	AGA	2	6	59737	59742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017290	CTA	2	6	59976	59981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017290	CAA	2	6	63300	63305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017290	TTG	2	6	64381	64386	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017290	GAA	2	6	64409	64414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017290	TCC	2	6	64494	64499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_017290	AAT	2	6	64640	64645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017290	GTC	2	6	70294	70299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017290	AGA	2	6	70338	70343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017290	ATA	2	6	71242	71247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017290	TTA	3	9	74094	74102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017290	ATC	2	6	76091	76096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017290	TCA	2	6	77416	77421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_017290	TTC	2	6	77493	77498	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_017290	TAT	2	6	77525	77530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017290	TAT	2	6	77784	77789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017290	AGA	2	6	80497	80502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017290	AAT	2	6	80593	80598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017290	TGT	2	6	81814	81819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017290	CAA	2	6	81899	81904	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017290	TCC	2	6	81914	81919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_017290	CAA	2	6	83152	83157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_017290	AGA	2	6	83165	83170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017290	TGT	2	6	83237	83242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017290	TCT	2	6	83243	83248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017290	ACT	2	6	83252	83257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017290	AAG	2	6	83280	83285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017290	GTA	2	6	83321	83326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017290	TCC	2	6	83348	83353	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017290	TTA	2	6	83427	83432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017290	AAT	2	6	83434	83439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017290	AGT	2	6	83447	83452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017290	ATC	2	6	84795	84800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017290	GTT	2	6	87385	87390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017290	AGA	2	6	93518	93523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017290	AAG	2	6	93555	93560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017290	TAA	2	6	93562	93567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017290	AAT	2	6	93641	93646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017290	TTG	2	6	93679	93684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017290	GGT	2	6	93688	93693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017290	GTT	2	6	93958	93963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017290	AAG	2	6	98670	98675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017290	TCT	2	6	98942	98947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017290	GCT	2	6	99216	99221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017290	ACA	2	6	99272	99277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017290	ATG	2	6	99374	99379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017290	ATA	2	6	99427	99432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017290	GTT	2	6	99460	99465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017290	ACT	2	6	99532	99537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_017290	ATC	2	6	99554	99559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017290	TAG	2	6	99588	99593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017290	TTC	2	6	99693	99698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_017290	ACT	2	6	101731	101736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017290	CAA	2	6	101781	101786	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017290	TTA	2	6	108237	108242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017290	TCT	2	6	108316	108321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017290	AAC	2	6	108436	108441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017290	AGA	2	6	109135	109140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017290	GAA	2	6	110186	110191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017290	ATT	2	6	112377	112382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017290	TAC	2	6	118337	118342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017290	GAG	2	6	119158	119163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017290	ACT	2	6	120759	120764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017290	TCT	2	6	122643	122648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_017290	AGT	2	6	122674	122679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017290	AAT	2	6	122771	122776	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017290	ATT	2	6	122791	122796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017290	TGG	2	6	122804	122809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017290	TCC	2	6	125293	125298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_017290	TAC	2	6	125305	125310	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017290	TGT	2	6	125312	125317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017290	AAT	2	6	125768	125773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017290	ATT	2	6	128311	128316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017290	TTA	2	6	128346	128351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017290	TGT	2	6	128542	128547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017290	ACA	2	6	128614	128619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_017290	TAC	2	6	128630	128635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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