MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 08DC60 chromosome

Total Repeats: 2143

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017290	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017290	GT	3	6	309	314	0 %	50 %	50 %	0 %	384452083
3	NC_017290	TG	3	6	498	503	0 %	50 %	50 %	0 %	384452083
4	NC_017290	TC	3	6	727	732	0 %	50 %	0 %	50 %	384452083
5	NC_017290	AC	3	6	1295	1300	50 %	0 %	0 %	50 %	384452084
6	NC_017290	GT	3	6	1461	1466	0 %	50 %	50 %	0 %	384452084
7	NC_017290	TC	3	6	1584	1589	0 %	50 %	0 %	50 %	384452084
8	NC_017290	TG	3	6	1888	1893	0 %	50 %	50 %	0 %	384452084
9	NC_017290	GA	3	6	2786	2791	50 %	0 %	50 %	0 %	384452085
10	NC_017290	GA	3	6	3340	3345	50 %	0 %	50 %	0 %	384452086
11	NC_017290	AT	3	6	4227	4232	50 %	50 %	0 %	0 %	384452086
12	NC_017290	CT	3	6	4729	4734	0 %	50 %	0 %	50 %	384452086
13	NC_017290	CT	3	6	6469	6474	0 %	50 %	0 %	50 %	384452087
14	NC_017290	GA	3	6	6893	6898	50 %	0 %	50 %	0 %	384452088
15	NC_017290	GT	3	6	7804	7809	0 %	50 %	50 %	0 %	384452088
16	NC_017290	TC	3	6	7875	7880	0 %	50 %	0 %	50 %	384452088
17	NC_017290	AT	3	6	8464	8469	50 %	50 %	0 %	0 %	384452089
18	NC_017290	GT	3	6	8687	8692	0 %	50 %	50 %	0 %	384452089
19	NC_017290	AG	3	6	9231	9236	50 %	0 %	50 %	0 %	384452089
20	NC_017290	TG	3	6	10493	10498	0 %	50 %	50 %	0 %	384452089
21	NC_017290	TC	3	6	11263	11268	0 %	50 %	0 %	50 %	384452090
22	NC_017290	AC	3	6	11279	11284	50 %	0 %	0 %	50 %	384452090
23	NC_017290	AT	3	6	11523	11528	50 %	50 %	0 %	0 %	384452090
24	NC_017290	GA	3	6	11602	11607	50 %	0 %	50 %	0 %	384452090
25	NC_017290	AG	3	6	11790	11795	50 %	0 %	50 %	0 %	384452090
26	NC_017290	TC	3	6	11843	11848	0 %	50 %	0 %	50 %	384452090
27	NC_017290	GT	3	6	12058	12063	0 %	50 %	50 %	0 %	384452090
28	NC_017290	GA	3	6	12446	12451	50 %	0 %	50 %	0 %	384452090
29	NC_017290	AG	3	6	12515	12520	50 %	0 %	50 %	0 %	384452090
30	NC_017290	GA	3	6	12586	12591	50 %	0 %	50 %	0 %	384452090
31	NC_017290	GT	3	6	12867	12872	0 %	50 %	50 %	0 %	384452090
32	NC_017290	TA	3	6	13807	13812	50 %	50 %	0 %	0 %	384452090
33	NC_017290	TA	3	6	13827	13832	50 %	50 %	0 %	0 %	384452090
34	NC_017290	AT	3	6	14111	14116	50 %	50 %	0 %	0 %	384452091
35	NC_017290	CT	3	6	14791	14796	0 %	50 %	0 %	50 %	384452091
36	NC_017290	TA	3	6	15121	15126	50 %	50 %	0 %	0 %	384452091
37	NC_017290	TG	4	8	15659	15666	0 %	50 %	50 %	0 %	384452091
38	NC_017290	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017290	TC	3	6	18953	18958	0 %	50 %	0 %	50 %	384452095
40	NC_017290	GT	3	6	19394	19399	0 %	50 %	50 %	0 %	384452095
41	NC_017290	TA	3	6	19438	19443	50 %	50 %	0 %	0 %	384452095
42	NC_017290	TC	3	6	19544	19549	0 %	50 %	0 %	50 %	384452095
43	NC_017290	GT	3	6	19673	19678	0 %	50 %	50 %	0 %	384452095
44	NC_017290	AC	3	6	20114	20119	50 %	0 %	0 %	50 %	384452095
45	NC_017290	TC	3	6	21145	21150	0 %	50 %	0 %	50 %	384452096
46	NC_017290	GA	3	6	22447	22452	50 %	0 %	50 %	0 %	384452097
47	NC_017290	GA	3	6	23670	23675	50 %	0 %	50 %	0 %	384452097
48	NC_017290	TA	3	6	25504	25509	50 %	50 %	0 %	0 %	384452098
49	NC_017290	AG	3	6	25611	25616	50 %	0 %	50 %	0 %	384452098
50	NC_017290	TA	3	6	26514	26519	50 %	50 %	0 %	0 %	384452098
51	NC_017290	TA	3	6	27374	27379	50 %	50 %	0 %	0 %	384452099
52	NC_017290	TC	3	6	27459	27464	0 %	50 %	0 %	50 %	384452099
53	NC_017290	TA	3	6	28051	28056	50 %	50 %	0 %	0 %	384452099
54	NC_017290	AG	3	6	29926	29931	50 %	0 %	50 %	0 %	384452101
55	NC_017290	AG	3	6	30587	30592	50 %	0 %	50 %	0 %	384452102
56	NC_017290	GA	3	6	31109	31114	50 %	0 %	50 %	0 %	384452103
57	NC_017290	GA	4	8	31239	31246	50 %	0 %	50 %	0 %	384452103
58	NC_017290	TC	3	6	31852	31857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017290	GT	3	6	33083	33088	0 %	50 %	50 %	0 %	384452105
60	NC_017290	AG	3	6	34612	34617	50 %	0 %	50 %	0 %	384452108
61	NC_017290	AG	3	6	34684	34689	50 %	0 %	50 %	0 %	384452108
62	NC_017290	AT	3	6	34730	34735	50 %	50 %	0 %	0 %	384452108
63	NC_017290	TG	3	6	34819	34824	0 %	50 %	50 %	0 %	384452108
64	NC_017290	CG	3	6	35131	35136	0 %	0 %	50 %	50 %	384452108
65	NC_017290	AT	3	6	35450	35455	50 %	50 %	0 %	0 %	384452108
66	NC_017290	GA	3	6	35931	35936	50 %	0 %	50 %	0 %	384452109
67	NC_017290	TA	3	6	37504	37509	50 %	50 %	0 %	0 %	384452109
68	NC_017290	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017290	GA	3	6	38474	38479	50 %	0 %	50 %	0 %	384452110
70	NC_017290	CG	3	6	38503	38508	0 %	0 %	50 %	50 %	384452110
71	NC_017290	TA	3	6	38509	38514	50 %	50 %	0 %	0 %	384452110
72	NC_017290	GC	3	6	39841	39846	0 %	0 %	50 %	50 %	384452112
73	NC_017290	AG	3	6	39852	39857	50 %	0 %	50 %	0 %	384452112
74	NC_017290	AG	3	6	40732	40737	50 %	0 %	50 %	0 %	384452113
75	NC_017290	GC	3	6	41449	41454	0 %	0 %	50 %	50 %	384452113
76	NC_017290	AT	3	6	41781	41786	50 %	50 %	0 %	0 %	384452113
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80	NC_017290	AG	3	6	45657	45662	50 %	0 %	50 %	0 %	384452119
81	NC_017290	CA	3	6	47065	47070	50 %	0 %	0 %	50 %	384452121
82	NC_017290	TC	4	8	47824	47831	0 %	50 %	0 %	50 %	384452121
83	NC_017290	TA	3	6	48253	48258	50 %	50 %	0 %	0 %	384452122
84	NC_017290	AT	3	6	48267	48272	50 %	50 %	0 %	0 %	384452122
85	NC_017290	AT	3	6	48519	48524	50 %	50 %	0 %	0 %	384452122
86	NC_017290	CT	3	6	48576	48581	0 %	50 %	0 %	50 %	384452122
87	NC_017290	TA	3	6	48879	48884	50 %	50 %	0 %	0 %	384452122
88	NC_017290	AG	3	6	49407	49412	50 %	0 %	50 %	0 %	384452122
89	NC_017290	GC	3	6	49976	49981	0 %	0 %	50 %	50 %	384452123
90	NC_017290	TC	3	6	50381	50386	0 %	50 %	0 %	50 %	384452123
91	NC_017290	TA	3	6	50554	50559	50 %	50 %	0 %	0 %	384452123
92	NC_017290	TA	3	6	52216	52221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017290	GT	3	6	53106	53111	0 %	50 %	50 %	0 %	384452124
94	NC_017290	AT	3	6	53293	53298	50 %	50 %	0 %	0 %	384452124
95	NC_017290	AG	3	6	55436	55441	50 %	0 %	50 %	0 %	384452127
96	NC_017290	AG	4	8	56050	56057	50 %	0 %	50 %	0 %	384452127
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101	NC_017290	GA	3	6	59330	59335	50 %	0 %	50 %	0 %	384452130
102	NC_017290	AG	3	6	60308	60313	50 %	0 %	50 %	0 %	384452132
103	NC_017290	AG	3	6	60609	60614	50 %	0 %	50 %	0 %	384452132
104	NC_017290	GA	3	6	61853	61858	50 %	0 %	50 %	0 %	384452132
105	NC_017290	AG	3	6	62141	62146	50 %	0 %	50 %	0 %	384452132
106	NC_017290	TC	3	6	62593	62598	0 %	50 %	0 %	50 %	384452132
107	NC_017290	AG	3	6	63236	63241	50 %	0 %	50 %	0 %	384452132
108	NC_017290	TG	3	6	63309	63314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017290	TC	3	6	64789	64794	0 %	50 %	0 %	50 %	384452134
110	NC_017290	TG	3	6	65554	65559	0 %	50 %	50 %	0 %	384452134
111	NC_017290	CA	4	8	65841	65848	50 %	0 %	0 %	50 %	384452134
112	NC_017290	GA	4	8	66580	66587	50 %	0 %	50 %	0 %	384452135
113	NC_017290	AT	3	6	67359	67364	50 %	50 %	0 %	0 %	384452136
114	NC_017290	GA	4	8	67466	67473	50 %	0 %	50 %	0 %	384452136
115	NC_017290	AG	3	6	67579	67584	50 %	0 %	50 %	0 %	384452136
116	NC_017290	TG	3	6	67928	67933	0 %	50 %	50 %	0 %	384452136
117	NC_017290	GT	3	6	68172	68177	0 %	50 %	50 %	0 %	384452136
118	NC_017290	TA	3	6	68613	68618	50 %	50 %	0 %	0 %	384452137
119	NC_017290	TA	3	6	69316	69321	50 %	50 %	0 %	0 %	384452137
120	NC_017290	AG	3	6	70239	70244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017290	GA	3	6	71762	71767	50 %	0 %	50 %	0 %	384452140
122	NC_017290	GT	3	6	72038	72043	0 %	50 %	50 %	0 %	384452140
123	NC_017290	GT	3	6	73700	73705	0 %	50 %	50 %	0 %	384452142
124	NC_017290	GA	3	6	74642	74647	50 %	0 %	50 %	0 %	384452143
125	NC_017290	TC	3	6	75230	75235	0 %	50 %	0 %	50 %	384452144
126	NC_017290	TC	3	6	76035	76040	0 %	50 %	0 %	50 %	384452144
127	NC_017290	GC	3	6	76267	76272	0 %	0 %	50 %	50 %	384452145
128	NC_017290	TC	3	6	76334	76339	0 %	50 %	0 %	50 %	384452145
129	NC_017290	TC	3	6	76437	76442	0 %	50 %	0 %	50 %	384452145
130	NC_017290	CA	3	6	76572	76577	50 %	0 %	0 %	50 %	384452145
131	NC_017290	CT	3	6	76760	76765	0 %	50 %	0 %	50 %	384452145
132	NC_017290	CG	3	6	76870	76875	0 %	0 %	50 %	50 %	384452145
133	NC_017290	GA	3	6	78861	78866	50 %	0 %	50 %	0 %	384452146
134	NC_017290	AG	3	6	79195	79200	50 %	0 %	50 %	0 %	384452146
135	NC_017290	AC	3	6	80176	80181	50 %	0 %	0 %	50 %	384452147
136	NC_017290	AC	3	6	80330	80335	50 %	0 %	0 %	50 %	384452147
137	NC_017290	AG	3	6	81219	81224	50 %	0 %	50 %	0 %	384452148
138	NC_017290	CT	3	6	81399	81404	0 %	50 %	0 %	50 %	384452148
139	NC_017290	AC	3	6	81746	81751	50 %	0 %	0 %	50 %	384452148
140	NC_017290	AC	3	6	81948	81953	50 %	0 %	0 %	50 %	384452149
141	NC_017290	GT	3	6	82062	82067	0 %	50 %	50 %	0 %	384452149
142	NC_017290	AC	3	6	82326	82331	50 %	0 %	0 %	50 %	384452149
143	NC_017290	TG	3	6	82805	82810	0 %	50 %	50 %	0 %	384452149
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