MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 790

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017289	GAAAA	2	10	3356	3365	80 %	0 %	20 %	0 %	384451110
2	NC_017289	AGGAG	2	10	4413	4422	40 %	0 %	60 %	0 %	384451110
3	NC_017289	TGTTT	2	10	6761	6770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017289	AACAT	2	10	7325	7334	60 %	20 %	0 %	20 %	384451112
5	NC_017289	ATAAA	2	10	13046	13055	80 %	20 %	0 %	0 %	384451114
6	NC_017289	AACTC	2	10	13490	13499	40 %	20 %	0 %	40 %	384451114
7	NC_017289	GTTTT	2	10	13560	13569	0 %	80 %	20 %	0 %	384451114
8	NC_017289	GAAAC	2	10	14328	14337	60 %	0 %	20 %	20 %	384451115
9	NC_017289	AACAA	2	10	15357	15366	80 %	0 %	0 %	20 %	384451115
10	NC_017289	AATAG	2	10	17069	17078	60 %	20 %	20 %	0 %	384451117
11	NC_017289	GCCTA	2	10	19904	19913	20 %	20 %	20 %	40 %	384451119
12	NC_017289	AGTGT	2	10	21118	21127	20 %	40 %	40 %	0 %	384451120
13	NC_017289	GCCAC	2	10	29447	29456	20 %	0 %	20 %	60 %	384451124
14	NC_017289	ATAAA	2	10	34287	34296	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017289	AAGGA	2	10	38579	38588	60 %	0 %	40 %	0 %	384451134
16	NC_017289	CCATA	2	10	38786	38795	40 %	20 %	0 %	40 %	384451134
17	NC_017289	CTTTA	2	10	38952	38961	20 %	60 %	0 %	20 %	384451134
18	NC_017289	CTTTC	2	10	43215	43224	0 %	60 %	0 %	40 %	384451140
19	NC_017289	ACAAA	2	10	43877	43886	80 %	0 %	0 %	20 %	384451141
20	NC_017289	TATGG	2	10	44287	44296	20 %	40 %	40 %	0 %	384451142
21	NC_017289	TCTTT	2	10	46095	46104	0 %	80 %	0 %	20 %	384451144
22	NC_017289	AGCCC	2	10	47092	47101	20 %	0 %	20 %	60 %	384451145
23	NC_017289	TCAAA	2	10	47447	47456	60 %	20 %	0 %	20 %	384451145
24	NC_017289	TCTAT	2	10	49566	49575	20 %	60 %	0 %	20 %	384451147
25	NC_017289	TTTGG	2	10	51480	51489	0 %	60 %	40 %	0 %	384451147
26	NC_017289	TTTTG	2	10	52489	52498	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017289	TTTTC	2	10	55349	55358	0 %	80 %	0 %	20 %	384451150
28	NC_017289	GTAAG	2	10	57397	57406	40 %	20 %	40 %	0 %	384451153
29	NC_017289	TTAAT	2	10	57969	57978	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017289	TCTTT	2	10	59413	59422	0 %	80 %	0 %	20 %	384451155
31	NC_017289	AAAAT	2	10	60219	60228	80 %	20 %	0 %	0 %	384451156
32	NC_017289	TAGTT	2	10	62821	62830	20 %	60 %	20 %	0 %	384451156
33	NC_017289	GAATG	2	10	62837	62846	40 %	20 %	40 %	0 %	384451156
34	NC_017289	TTGTT	2	10	63823	63832	0 %	80 %	20 %	0 %	384451157
35	NC_017289	TCCTA	2	10	64887	64896	20 %	40 %	0 %	40 %	384451158
36	NC_017289	AGAAA	2	10	70143	70152	80 %	0 %	20 %	0 %	384451162
37	NC_017289	GGATA	2	10	70951	70960	40 %	20 %	40 %	0 %	384451163
38	NC_017289	CACTT	2	10	71134	71143	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017289	ATAGC	2	10	74390	74399	40 %	20 %	20 %	20 %	384451167
40	NC_017289	GCACA	2	10	77223	77232	40 %	0 %	20 %	40 %	384451169
41	NC_017289	AATTT	2	10	77747	77756	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017289	AAAGA	2	10	78176	78185	80 %	0 %	20 %	0 %	384451170
43	NC_017289	AGTTC	2	10	79181	79190	20 %	40 %	20 %	20 %	384451170
44	NC_017289	CGTAT	2	10	81550	81559	20 %	40 %	20 %	20 %	384451172
45	NC_017289	GAAAA	2	10	82760	82769	80 %	0 %	20 %	0 %	384451173
46	NC_017289	AGGAA	2	10	84759	84768	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017289	CTTTT	2	10	85648	85657	0 %	80 %	0 %	20 %	384451176
48	NC_017289	CAAAG	2	10	87119	87128	60 %	0 %	20 %	20 %	384451178
49	NC_017289	AACAA	2	10	87286	87295	80 %	0 %	0 %	20 %	384451178
50	NC_017289	AGAAA	2	10	87356	87365	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017289	AAAGA	2	10	89192	89201	80 %	0 %	20 %	0 %	384451180
52	NC_017289	TTTTC	2	10	90207	90216	0 %	80 %	0 %	20 %	384451180
53	NC_017289	AGGAT	2	10	90730	90739	40 %	20 %	40 %	0 %	384451180
54	NC_017289	ATAAC	2	10	90816	90825	60 %	20 %	0 %	20 %	384451180
55	NC_017289	TGGCA	2	10	93301	93310	20 %	20 %	40 %	20 %	384451181
56	NC_017289	AATTA	2	10	93965	93974	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017289	TGTTT	2	10	95026	95035	0 %	80 %	20 %	0 %	384451183
58	NC_017289	TCACC	2	10	96600	96609	20 %	20 %	0 %	60 %	384451184
59	NC_017289	AAAAT	2	10	96735	96744	80 %	20 %	0 %	0 %	384451184
60	NC_017289	TTAAT	2	10	97779	97788	40 %	60 %	0 %	0 %	384451185
61	NC_017289	ATTTG	2	10	98962	98971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017289	AAAAT	2	10	99683	99692	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017289	ATTAC	2	10	102911	102920	40 %	40 %	0 %	20 %	384451193
64	NC_017289	CTACA	2	10	103285	103294	40 %	20 %	0 %	40 %	384451193
65	NC_017289	AATTA	2	10	104832	104841	60 %	40 %	0 %	0 %	384451195
66	NC_017289	CTATA	2	10	105822	105831	40 %	40 %	0 %	20 %	384451196
67	NC_017289	CTTTT	2	10	108365	108374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017289	AGCTT	2	10	108476	108485	20 %	40 %	20 %	20 %	384451199
69	NC_017289	GTTTG	2	10	108783	108792	0 %	60 %	40 %	0 %	384451199
70	NC_017289	AGTTA	2	10	115589	115598	40 %	40 %	20 %	0 %	384451214
71	NC_017289	AGTTT	2	10	116079	116088	20 %	60 %	20 %	0 %	384451215
72	NC_017289	TTTGC	2	10	116994	117003	0 %	60 %	20 %	20 %	384451217
73	NC_017289	TTTAC	2	10	119191	119200	20 %	60 %	0 %	20 %	384451220
74	NC_017289	AATTA	2	10	122084	122093	60 %	40 %	0 %	0 %	384451223
75	NC_017289	CTTTT	2	10	122882	122891	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017289	GAGAT	2	10	123438	123447	40 %	20 %	40 %	0 %	384451224
77	NC_017289	GTCAA	2	10	124757	124766	40 %	20 %	20 %	20 %	384451226
78	NC_017289	TAGGG	2	10	127229	127238	20 %	20 %	60 %	0 %	384451229
79	NC_017289	AACTT	2	10	128161	128170	40 %	40 %	0 %	20 %	384451229
80	NC_017289	TTCTT	2	10	131365	131374	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017289	TGTCA	2	10	132046	132055	20 %	40 %	20 %	20 %	384451232
82	NC_017289	AAAAG	2	10	135452	135461	80 %	0 %	20 %	0 %	384451234
83	NC_017289	TAAAA	2	10	135733	135742	80 %	20 %	0 %	0 %	384451234
84	NC_017289	GATTT	2	10	137992	138001	20 %	60 %	20 %	0 %	384451236
85	NC_017289	TTGTT	2	10	138334	138343	0 %	80 %	20 %	0 %	384451236
86	NC_017289	AAGAA	2	10	138815	138824	80 %	0 %	20 %	0 %	384451236
87	NC_017289	TTCTT	2	10	139408	139417	0 %	80 %	0 %	20 %	384451237
88	NC_017289	CTTTG	2	10	141313	141322	0 %	60 %	20 %	20 %	384451239
89	NC_017289	AGAAA	2	10	143350	143359	80 %	0 %	20 %	0 %	384451242
90	NC_017289	AAAGA	2	10	146015	146024	80 %	0 %	20 %	0 %	384451244
91	NC_017289	TTTTA	2	10	148194	148203	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017289	TACTC	2	10	149646	149655	20 %	40 %	0 %	40 %	384451250
93	NC_017289	CGTTT	2	10	149693	149702	0 %	60 %	20 %	20 %	384451250
94	NC_017289	ATTTT	2	10	149833	149842	20 %	80 %	0 %	0 %	384451250
95	NC_017289	ACCAT	2	10	151864	151873	40 %	20 %	0 %	40 %	384451251
96	NC_017289	CAGAA	2	10	152829	152838	60 %	0 %	20 %	20 %	384451252
97	NC_017289	TTCAT	2	10	153399	153408	20 %	60 %	0 %	20 %	384451252
98	NC_017289	AAAGG	2	10	154229	154238	60 %	0 %	40 %	0 %	384451253
99	NC_017289	ATAGG	2	10	155921	155930	40 %	20 %	40 %	0 %	384451255
100	NC_017289	TTTGA	2	10	156007	156016	20 %	60 %	20 %	0 %	384451255
101	NC_017289	AAGGT	2	10	160950	160959	40 %	20 %	40 %	0 %	384451258
102	NC_017289	TTTTG	2	10	161889	161898	0 %	80 %	20 %	0 %	384451260
103	NC_017289	GGGGC	2	10	162036	162045	0 %	0 %	80 %	20 %	384451260
104	NC_017289	AGCAT	2	10	163328	163337	40 %	20 %	20 %	20 %	384451262
105	NC_017289	TAAAT	2	10	164515	164524	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017289	AAATG	2	10	166443	166452	60 %	20 %	20 %	0 %	384451263
107	NC_017289	GGGGA	2	10	168218	168227	20 %	0 %	80 %	0 %	384451264
108	NC_017289	TTTTC	2	10	169267	169276	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017289	CTGTT	2	10	169746	169755	0 %	60 %	20 %	20 %	384451266
110	NC_017289	AATGA	2	10	169781	169790	60 %	20 %	20 %	0 %	384451266
111	NC_017289	ATTTT	2	10	173240	173249	20 %	80 %	0 %	0 %	384451271
112	NC_017289	GAGAG	2	10	173257	173266	40 %	0 %	60 %	0 %	384451271
113	NC_017289	CAAAA	2	10	173587	173596	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017289	CGCAT	2	10	173957	173966	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017289	CTAAG	2	10	181198	181207	40 %	20 %	20 %	20 %	384451278
116	NC_017289	TTTTC	2	10	181798	181807	0 %	80 %	0 %	20 %	384451278
117	NC_017289	GGTAC	2	10	183793	183802	20 %	20 %	40 %	20 %	384451280
118	NC_017289	AGGGA	2	10	186980	186989	40 %	0 %	60 %	0 %	384451284
119	NC_017289	AATGT	2	10	187389	187398	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017289	AGGAA	2	10	188003	188012	60 %	0 %	40 %	0 %	384451285
121	NC_017289	TTCTT	2	10	188382	188391	0 %	80 %	0 %	20 %	384451285
122	NC_017289	GATAA	2	10	191025	191034	60 %	20 %	20 %	0 %	384451285
123	NC_017289	CCCTT	2	10	193229	193238	0 %	40 %	0 %	60 %	384451286
124	NC_017289	TTTTA	2	10	193930	193939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017289	AGTTA	2	10	194220	194229	40 %	40 %	20 %	0 %	384451287
126	NC_017289	TTATT	2	10	194240	194249	20 %	80 %	0 %	0 %	384451287
127	NC_017289	CCCTA	2	10	195293	195302	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017289	AGGGT	2	10	197164	197173	20 %	20 %	60 %	0 %	384451289
129	NC_017289	TGGAT	2	10	197605	197614	20 %	40 %	40 %	0 %	384451289
130	NC_017289	CTAAA	2	10	197662	197671	60 %	20 %	0 %	20 %	384451289
131	NC_017289	CTTTA	2	10	197965	197974	20 %	60 %	0 %	20 %	384451289
132	NC_017289	AAAAT	2	10	198142	198151	80 %	20 %	0 %	0 %	384451289
133	NC_017289	GTTTT	2	10	198645	198654	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017289	ATTAA	2	10	201069	201078	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017289	TTGGT	2	10	201445	201454	0 %	60 %	40 %	0 %	384451292
136	NC_017289	AGCAA	2	10	203922	203931	60 %	0 %	20 %	20 %	384451294
137	NC_017289	TAATG	2	10	205037	205046	40 %	40 %	20 %	0 %	384451295
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