MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 14389

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017289	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451107
2	NC_017289	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451107
3	NC_017289	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451107
4	NC_017289	TCT	2	6	331	336	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451107
5	NC_017289	TAT	2	6	553	558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451107
6	NC_017289	ATG	2	6	579	584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451107
7	NC_017289	TGT	2	6	640	645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451107
8	NC_017289	ATG	2	6	659	664	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451107
9	NC_017289	ACA	2	6	950	955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451107
10	NC_017289	AGC	2	6	964	969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451107
11	NC_017289	GTG	2	6	981	986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451107
12	NC_017289	AGC	3	9	1000	1008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451107
13	NC_017289	CTA	2	6	1011	1016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451107
14	NC_017289	GGT	2	6	1020	1025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451107
15	NC_017289	CTT	2	6	1128	1133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451107
16	NC_017289	CTT	2	6	1225	1230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451108
17	NC_017289	ACA	2	6	1365	1370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451108
18	NC_017289	ATG	2	6	1413	1418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451108
19	NC_017289	TTA	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451108
20	NC_017289	TAG	2	6	1576	1581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451108
21	NC_017289	TAG	2	6	1714	1719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451108
22	NC_017289	CTA	2	6	1768	1773	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451108
23	NC_017289	TTC	2	6	1789	1794	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451108
24	NC_017289	ATA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451108
25	NC_017289	CTT	2	6	2056	2061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451108
26	NC_017289	GAA	2	6	2067	2072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451108
27	NC_017289	TGA	2	6	2128	2133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451108
28	NC_017289	GAT	2	6	2146	2151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451108
29	NC_017289	GTT	2	6	2182	2187	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451108
30	NC_017289	CTT	2	6	2206	2211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451108
31	NC_017289	TAA	2	6	2368	2373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451108
32	NC_017289	GAA	2	6	2415	2420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451108
33	NC_017289	AGT	2	6	2643	2648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451109
34	NC_017289	TTA	2	6	2656	2661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451109
35	NC_017289	TCC	2	6	2685	2690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451109
36	NC_017289	TTC	2	6	2778	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451109
37	NC_017289	TTA	2	6	2803	2808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451109
38	NC_017289	AGA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451109
39	NC_017289	TAT	2	6	2972	2977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451109
40	NC_017289	TAT	2	6	3006	3011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451109
41	NC_017289	GAA	2	6	3217	3222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
42	NC_017289	ATG	2	6	3422	3427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451110
43	NC_017289	AGT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451110
44	NC_017289	CTT	2	6	3543	3548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451110
45	NC_017289	CAA	2	6	3628	3633	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451110
46	NC_017289	ATG	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451110
47	NC_017289	ATC	2	6	3779	3784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451110
48	NC_017289	TGG	2	6	3892	3897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451110
49	NC_017289	AGA	2	6	4143	4148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
50	NC_017289	TAA	2	6	4209	4214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451110
51	NC_017289	GAA	2	6	4246	4251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
52	NC_017289	AGC	2	6	4284	4289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451110
53	NC_017289	TAA	2	6	4313	4318	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451110
54	NC_017289	AGA	2	6	4433	4438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
55	NC_017289	CTT	2	6	4450	4455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451110
56	NC_017289	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451110
57	NC_017289	GAT	2	6	4525	4530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451110
58	NC_017289	GCT	2	6	4579	4584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451110
59	NC_017289	GAA	2	6	4809	4814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
60	NC_017289	AAG	2	6	4832	4837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
61	NC_017289	TGG	2	6	4910	4915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451110
62	NC_017289	AAG	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
63	NC_017289	AGA	2	6	5112	5117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451110
64	NC_017289	TTA	2	6	5132	5137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451110
65	NC_017289	CAA	2	6	5220	5225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451110
66	NC_017289	AGA	2	6	5520	5525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451111
67	NC_017289	TGG	2	6	5586	5591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451111
68	NC_017289	TAT	2	6	5621	5626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451111
69	NC_017289	GTT	2	6	5667	5672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451111
70	NC_017289	CAA	2	6	5683	5688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451111
71	NC_017289	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451111
72	NC_017289	TGT	2	6	5730	5735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451111
73	NC_017289	GGA	2	6	5752	5757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451111
74	NC_017289	CAA	2	6	5863	5868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451111
75	NC_017289	TGA	2	6	5925	5930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451111
76	NC_017289	GAT	2	6	5931	5936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451111
77	NC_017289	TGT	3	9	5983	5991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451111
78	NC_017289	TGA	2	6	6047	6052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451111
79	NC_017289	GCT	2	6	6063	6068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451111
80	NC_017289	TGC	2	6	6222	6227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451111
81	NC_017289	TGA	2	6	6243	6248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451111
82	NC_017289	GAA	2	6	6274	6279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451111
83	NC_017289	GAG	2	6	6287	6292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451111
84	NC_017289	TTC	2	6	6297	6302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451111
85	NC_017289	CCT	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451111
86	NC_017289	CTT	2	6	6350	6355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451111
87	NC_017289	GTT	2	6	6392	6397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451111
88	NC_017289	ACA	2	6	6550	6555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451111
89	NC_017289	ATA	2	6	6590	6595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451111
90	NC_017289	CAA	2	6	6634	6639	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451111
91	NC_017289	GAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451112
92	NC_017289	CAT	2	6	6916	6921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451112
93	NC_017289	ACA	2	6	6934	6939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451112
94	NC_017289	GTG	2	6	6988	6993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451112
95	NC_017289	TGT	2	6	7013	7018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451112
96	NC_017289	TTC	2	6	7104	7109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451112
97	NC_017289	GTT	2	6	7115	7120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451112
98	NC_017289	CAT	2	6	7140	7145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451112
99	NC_017289	AGA	2	6	7170	7175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451112
100	NC_017289	TAA	2	6	7253	7258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451112
101	NC_017289	TTG	2	6	7302	7307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451112
102	NC_017289	CTC	2	6	7344	7349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451112
103	NC_017289	GGA	2	6	7462	7467	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451112
104	NC_017289	TGA	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451112
105	NC_017289	ATT	2	6	7779	7784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451112
106	NC_017289	TGC	2	6	7857	7862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451112
107	NC_017289	TTC	2	6	7892	7897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451112
108	NC_017289	TTG	2	6	8054	8059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451113
109	NC_017289	TGC	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451113
110	NC_017289	AAG	2	6	8169	8174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451113
111	NC_017289	TTA	2	6	8253	8258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451113
112	NC_017289	CTT	2	6	8272	8277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451113
113	NC_017289	GAA	2	6	8343	8348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451113
114	NC_017289	TTC	2	6	8378	8383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451113
115	NC_017289	TTC	2	6	8503	8508	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451113
116	NC_017289	AGG	2	6	8710	8715	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451113
117	NC_017289	CCT	2	6	8767	8772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384451113
118	NC_017289	AAG	2	6	8815	8820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451113
119	NC_017289	GTT	2	6	8839	8844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451113
120	NC_017289	GAA	2	6	8889	8894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451113
121	NC_017289	CAT	2	6	8938	8943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451113
122	NC_017289	TTC	2	6	9023	9028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451113
123	NC_017289	GAA	2	6	9084	9089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451113
124	NC_017289	GAG	2	6	9145	9150	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451113
125	NC_017289	AGT	2	6	9250	9255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451113
126	NC_017289	TTA	2	6	9442	9447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451113
127	NC_017289	AGA	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451113
128	NC_017289	GTT	2	6	9737	9742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451113
129	NC_017289	CTT	2	6	9976	9981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451113
130	NC_017289	GCA	2	6	9997	10002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451113
131	NC_017289	CCA	2	6	10040	10045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384451113
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