MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 01DC11 chromosome

Total Repeats: 282

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017289	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017289	AG	3	6	17698	17703	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017289	TC	3	6	31852	31857	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017289	TC	3	6	37742	37747	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017289	TA	3	6	52216	52221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017289	TG	3	6	63309	63314	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017289	AG	3	6	70239	70244	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017289	AT	3	6	94016	94021	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017289	GA	3	6	97072	97077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017289	GA	3	6	98981	98986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017289	AG	3	6	101792	101797	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017289	TC	3	6	108276	108281	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_017289	AG	3	6	112366	112371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017289	TA	4	8	124061	124068	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017289	TA	4	8	125329	125336	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017289	TG	3	6	128432	128437	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017289	AC	3	6	128566	128571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017289	AT	3	6	130243	130248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017289	TA	3	6	130526	130531	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017289	CT	3	6	130622	130627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017289	CT	3	6	130753	130758	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_017289	GA	3	6	134365	134370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017289	GT	3	6	148831	148836	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017289	GT	3	6	148855	148860	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017289	AG	3	6	158088	158093	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017289	TA	3	6	173180	173185	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017289	AG	3	6	173224	173229	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017289	AT	3	6	175419	175424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017289	AG	3	6	179479	179484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017289	CT	3	6	193720	193725	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017289	AG	3	6	198356	198361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017289	TA	4	8	198377	198384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017289	AC	3	6	199245	199250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017289	AT	3	6	210369	210374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017289	AT	3	6	215445	215450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017289	GA	3	6	215505	215510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017289	GT	3	6	215545	215550	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017289	CT	3	6	215582	215587	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017289	AG	3	6	215809	215814	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017289	TC	3	6	215868	215873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017289	AG	3	6	222927	222932	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017289	TA	4	8	232262	232269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017289	AG	3	6	237008	237013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017289	AT	3	6	237078	237083	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017289	GA	3	6	239896	239901	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017289	AG	3	6	241105	241110	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017289	AG	3	6	244071	244076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017289	GT	3	6	261614	261619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017289	AG	3	6	263062	263067	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017289	TC	3	6	266726	266731	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017289	AT	4	8	266764	266771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017289	TC	3	6	267868	267873	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017289	TG	3	6	276798	276803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017289	GT	3	6	277640	277645	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017289	TC	3	6	281962	281967	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017289	TA	3	6	282011	282016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017289	AT	3	6	301192	301197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017289	TC	3	6	301498	301503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017289	TG	3	6	307751	307756	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017289	AC	3	6	310597	310602	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_017289	AG	3	6	313574	313579	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017289	GA	3	6	313624	313629	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017289	AC	3	6	319129	319134	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017289	TG	3	6	329905	329910	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017289	GA	3	6	329951	329956	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017289	AG	3	6	332869	332874	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017289	TC	3	6	342331	342336	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017289	TA	3	6	345325	345330	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017289	GT	3	6	347753	347758	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017289	TG	3	6	349277	349282	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017289	CT	3	6	350828	350833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_017289	TA	3	6	350901	350906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017289	TA	3	6	352313	352318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017289	TA	3	6	356480	356485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017289	CT	4	8	359097	359104	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017289	TA	3	6	362588	362593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017289	AT	3	6	367779	367784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017289	TA	3	6	370420	370425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017289	AG	3	6	371426	371431	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017289	AT	3	6	374820	374825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017289	CT	3	6	376396	376401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017289	TA	3	6	386941	386946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017289	TA	3	6	401541	401546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017289	TC	3	6	421604	421609	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_017289	AT	3	6	425488	425493	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017289	GA	3	6	429820	429825	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017289	GA	3	6	440555	440560	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017289	TC	3	6	445088	445093	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_017289	AG	3	6	447072	447077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017289	CT	3	6	447143	447148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017289	AG	3	6	447717	447722	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017289	TA	3	6	448260	448265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017289	CT	3	6	449543	449548	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017289	TC	3	6	455173	455178	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_017289	TG	3	6	460499	460504	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017289	AG	3	6	460648	460653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017289	CT	4	8	463530	463537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017289	AG	3	6	470359	470364	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017289	AG	3	6	476930	476935	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017289	TA	3	6	478244	478249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017289	AC	3	6	479702	479707	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017289	AG	3	6	479763	479768	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017289	AG	3	6	481228	481233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017289	TA	3	6	481308	481313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017289	AT	3	6	481851	481856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017289	AG	3	6	481883	481888	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017289	CT	3	6	487725	487730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017289	AG	4	8	489713	489720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017289	TC	3	6	491286	491291	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017289	TA	3	6	494048	494053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017289	AT	3	6	499392	499397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017289	GA	3	6	504569	504574	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017289	TC	3	6	506021	506026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017289	AT	3	6	513759	513764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017289	AT	3	6	513797	513802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017289	AG	3	6	520482	520487	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017289	GT	3	6	529496	529501	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017289	CT	4	8	545760	545767	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_017289	AT	3	6	556825	556830	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017289	GT	3	6	564782	564787	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017289	GA	3	6	590027	590032	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017289	TG	3	6	590133	590138	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017289	AC	3	6	590279	590284	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017289	AG	3	6	590503	590508	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017289	AC	3	6	600960	600965	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017289	GT	3	6	600980	600985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017289	AG	3	6	601091	601096	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017289	TC	3	6	601275	601280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_017289	AT	3	6	603931	603936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017289	TA	4	8	604075	604082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017289	GA	5	10	621202	621211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017289	CT	3	6	621247	621252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017289	CT	3	6	622631	622636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_017289	AC	3	6	627605	627610	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017289	TA	3	6	629400	629405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017289	AT	3	6	629420	629425	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017289	CT	3	6	631743	631748	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_017289	TC	4	8	645469	645476	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017289	TA	3	6	645477	645482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017289	TA	3	6	645575	645580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017289	AT	3	6	646728	646733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017289	CA	3	6	654245	654250	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_017289	AT	3	6	655326	655331	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017289	TA	3	6	655585	655590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017289	TA	3	6	656262	656267	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017289	TC	3	6	658070	658075	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017289	AG	3	6	661797	661802	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017289	TA	3	6	661853	661858	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017289	CA	3	6	664563	664568	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_017289	CT	4	8	664631	664638	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017289	AT	3	6	675797	675802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017289	CT	3	6	676001	676006	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_017289	CT	3	6	688139	688144	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.