MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC plasmid pCps6BC

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017288	TGAT	2	8	237	244	25 %	50 %	25 %	0 %	384451099
2	NC_017288	TTCT	2	8	840	847	0 %	75 %	0 %	25 %	384451099
3	NC_017288	TCTG	2	8	1319	1326	0 %	50 %	25 %	25 %	384451100
4	NC_017288	AGTA	2	8	1690	1697	50 %	25 %	25 %	0 %	384451100
5	NC_017288	TTTC	2	8	2125	2132	0 %	75 %	0 %	25 %	384451101
6	NC_017288	ATAC	2	8	2314	2321	50 %	25 %	0 %	25 %	384451101
7	NC_017288	TATG	2	8	2456	2463	25 %	50 %	25 %	0 %	384451101
8	NC_017288	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017288	TCAT	2	8	3010	3017	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017288	TTAA	2	8	3089	3096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017288	TTTG	2	8	3119	3126	0 %	75 %	25 %	0 %	384451102
12	NC_017288	AACA	2	8	3291	3298	75 %	0 %	0 %	25 %	384451102
13	NC_017288	TAAA	2	8	3501	3508	75 %	25 %	0 %	0 %	384451102
14	NC_017288	TAAA	2	8	4028	4035	75 %	25 %	0 %	0 %	384451103
15	NC_017288	GTTT	2	8	4078	4085	0 %	75 %	25 %	0 %	384451103
16	NC_017288	ATAA	2	8	4768	4775	75 %	25 %	0 %	0 %	384451103
17	NC_017288	AATC	2	8	5787	5794	50 %	25 %	0 %	25 %	384451104
18	NC_017288	TTTC	2	8	6563	6570	0 %	75 %	0 %	25 %	384451105
19	NC_017288	AGAA	2	8	6694	6701	75 %	0 %	25 %	0 %	384451105
20	NC_017288	CTAA	2	8	6848	6855	50 %	25 %	0 %	25 %	384451105
21	NC_017288	GAAA	2	8	7211	7218	75 %	0 %	25 %	0 %	384451105

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.