MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC plasmid pCps6BC

Total Repeats: 83

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017288	AGA	2	6	89	94	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451099
2	NC_017288	ATA	3	9	224	232	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451099
3	NC_017288	TGT	2	6	252	257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451099
4	NC_017288	AAC	2	6	519	524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451099
5	NC_017288	TAA	2	6	616	621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451099
6	NC_017288	TGC	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451099
7	NC_017288	CTA	2	6	811	816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451099
8	NC_017288	GCT	2	6	882	887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451099
9	NC_017288	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451099
10	NC_017288	TGG	2	6	918	923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451099
11	NC_017288	AGA	2	6	1243	1248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451100
12	NC_017288	AGA	2	6	1327	1332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451100
13	NC_017288	AGG	2	6	1339	1344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451100
14	NC_017288	TGT	2	6	1588	1593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451100
15	NC_017288	GTT	2	6	1662	1667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451100
16	NC_017288	TAT	2	6	1719	1724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451100
17	NC_017288	TTC	2	6	1726	1731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451100
18	NC_017288	ACT	2	6	1754	1759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451100
19	NC_017288	CTT	2	6	1881	1886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451100
20	NC_017288	TCA	2	6	1924	1929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451101
21	NC_017288	GCT	2	6	1978	1983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451101
22	NC_017288	TGA	2	6	2010	2015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451101
23	NC_017288	TAA	2	6	2022	2027	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451101
24	NC_017288	CTG	2	6	2032	2037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451101
25	NC_017288	TTG	2	6	2180	2185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451101
26	NC_017288	CTT	2	6	2273	2278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451101
27	NC_017288	AGG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384451101
28	NC_017288	TCT	2	6	2404	2409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451101
29	NC_017288	ATC	2	6	2511	2516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451101
30	NC_017288	TAC	2	6	2606	2611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451101
31	NC_017288	GTT	2	6	2629	2634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451101
32	NC_017288	ACC	2	6	2643	2648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384451101
33	NC_017288	TTA	2	6	3109	3114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451102
34	NC_017288	ACC	2	6	3226	3231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384451102
35	NC_017288	GTT	2	6	3268	3273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451102
36	NC_017288	TGA	2	6	3310	3315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451102
37	NC_017288	ATG	2	6	3398	3403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451102
38	NC_017288	CAG	2	6	3405	3410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451102
39	NC_017288	ATT	2	6	3581	3586	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451102
40	NC_017288	CTT	2	6	3597	3602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451102
41	NC_017288	TGG	2	6	3708	3713	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451102
42	NC_017288	GCT	2	6	3773	3778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451102
43	NC_017288	GTT	2	6	3807	3812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451102
44	NC_017288	TGT	2	6	3974	3979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451103
45	NC_017288	TTG	2	6	3997	4002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451103
46	NC_017288	CTT	2	6	4039	4044	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451103
47	NC_017288	CTA	2	6	4381	4386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451103
48	NC_017288	ATG	2	6	4404	4409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451103
49	NC_017288	TTC	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451103
50	NC_017288	CTT	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451103
51	NC_017288	CTT	2	6	4633	4638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451103
52	NC_017288	TTG	2	6	4801	4806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451103
53	NC_017288	GCT	2	6	4827	4832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384451103
54	NC_017288	TCT	2	6	4920	4925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451103
55	NC_017288	CTT	2	6	5007	5012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451104
56	NC_017288	GTT	2	6	5054	5059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384451104
57	NC_017288	CTA	2	6	5088	5093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451104
58	NC_017288	AAT	2	6	5127	5132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451104
59	NC_017288	ACA	2	6	5202	5207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451104
60	NC_017288	TCT	2	6	5228	5233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451104
61	NC_017288	AAG	2	6	5553	5558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451104
62	NC_017288	GCA	2	6	5702	5707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451104
63	NC_017288	AAC	2	6	5710	5715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451104
64	NC_017288	ATA	2	6	5730	5735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451104
65	NC_017288	GAA	2	6	5756	5761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384451104
66	NC_017288	ATG	2	6	6070	6075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451104
67	NC_017288	TCT	2	6	6151	6156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451104
68	NC_017288	GTG	2	6	6256	6261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384451104
69	NC_017288	AAC	3	9	6277	6285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451104
70	NC_017288	AAT	2	6	6300	6305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451104
71	NC_017288	TCT	2	6	6353	6358	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451104
72	NC_017288	AAC	2	6	6542	6547	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451105
73	NC_017288	TCT	2	6	6641	6646	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451105
74	NC_017288	AGT	2	6	6793	6798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384451105
75	NC_017288	AGC	2	6	6829	6834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384451105
76	NC_017288	AAT	2	6	6880	6885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384451105
77	NC_017288	TCA	2	6	6904	6909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451105
78	NC_017288	TAT	2	6	6981	6986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451105
79	NC_017288	TTC	2	6	7041	7046	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384451105
80	NC_017288	ACA	2	6	7082	7087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451105
81	NC_017288	ACA	2	6	7154	7159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384451105
82	NC_017288	ATT	2	6	7160	7165	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384451105
83	NC_017288	CTA	2	6	7443	7448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384451105

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.