MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 787

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017287	GAAAA	2	10	3264	3273	80 %	0 %	20 %	0 %	384450099
2	NC_017287	AGGAG	2	10	4321	4330	40 %	0 %	60 %	0 %	384450099
3	NC_017287	TGTTT	2	10	6669	6678	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017287	AACAT	2	10	7233	7242	60 %	20 %	0 %	20 %	384450101
5	NC_017287	ATAAA	2	10	12954	12963	80 %	20 %	0 %	0 %	384450103
6	NC_017287	AACTC	2	10	13398	13407	40 %	20 %	0 %	40 %	384450103
7	NC_017287	GTTTT	2	10	13468	13477	0 %	80 %	20 %	0 %	384450103
8	NC_017287	GAAAC	2	10	14236	14245	60 %	0 %	20 %	20 %	384450104
9	NC_017287	AACAA	2	10	15265	15274	80 %	0 %	0 %	20 %	384450104
10	NC_017287	AATAG	2	10	16977	16986	60 %	20 %	20 %	0 %	384450106
11	NC_017287	GCCTA	2	10	19812	19821	20 %	20 %	20 %	40 %	384450108
12	NC_017287	AGTGT	2	10	21026	21035	20 %	40 %	40 %	0 %	384450109
13	NC_017287	GCCAC	2	10	29355	29364	20 %	0 %	20 %	60 %	384450114
14	NC_017287	ATAAA	2	10	34195	34204	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017287	AAGGA	2	10	38487	38496	60 %	0 %	40 %	0 %	384450124
16	NC_017287	CCATA	2	10	38694	38703	40 %	20 %	0 %	40 %	384450124
17	NC_017287	CTTTA	2	10	38860	38869	20 %	60 %	0 %	20 %	384450124
18	NC_017287	CTTTC	2	10	43123	43132	0 %	60 %	0 %	40 %	384450129
19	NC_017287	ACAAA	2	10	43785	43794	80 %	0 %	0 %	20 %	384450130
20	NC_017287	TATGG	2	10	44195	44204	20 %	40 %	40 %	0 %	384450131
21	NC_017287	TCTTT	2	10	46003	46012	0 %	80 %	0 %	20 %	384450133
22	NC_017287	AGCCC	2	10	47000	47009	20 %	0 %	20 %	60 %	384450134
23	NC_017287	TCAAA	2	10	47355	47364	60 %	20 %	0 %	20 %	384450134
24	NC_017287	TCTAT	2	10	49474	49483	20 %	60 %	0 %	20 %	384450136
25	NC_017287	TTTGG	2	10	51388	51397	0 %	60 %	40 %	0 %	384450136
26	NC_017287	TTTTG	2	10	52397	52406	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017287	TTTTC	2	10	55257	55266	0 %	80 %	0 %	20 %	384450140
28	NC_017287	GTAAG	2	10	57305	57314	40 %	20 %	40 %	0 %	384450143
29	NC_017287	TTAAT	2	10	57877	57886	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017287	TCTTT	2	10	59321	59330	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_017287	AAAAT	2	10	60127	60136	80 %	20 %	0 %	0 %	384450145
32	NC_017287	TAGTT	2	10	62729	62738	20 %	60 %	20 %	0 %	384450145
33	NC_017287	GAATG	2	10	62745	62754	40 %	20 %	40 %	0 %	384450145
34	NC_017287	TTGTT	2	10	63731	63740	0 %	80 %	20 %	0 %	384450146
35	NC_017287	TCCTA	2	10	64795	64804	20 %	40 %	0 %	40 %	384450147
36	NC_017287	AGAAA	2	10	70051	70060	80 %	0 %	20 %	0 %	384450151
37	NC_017287	GGATA	2	10	70859	70868	40 %	20 %	40 %	0 %	384450153
38	NC_017287	CACTT	2	10	71042	71051	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
39	NC_017287	ATAGC	2	10	74298	74307	40 %	20 %	20 %	20 %	384450157
40	NC_017287	GCACA	2	10	77131	77140	40 %	0 %	20 %	40 %	384450159
41	NC_017287	AATTT	2	10	77655	77664	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017287	AAAGA	2	10	78084	78093	80 %	0 %	20 %	0 %	384450160
43	NC_017287	AGTTC	2	10	79089	79098	20 %	40 %	20 %	20 %	384450160
44	NC_017287	CGTAT	2	10	81458	81467	20 %	40 %	20 %	20 %	384450162
45	NC_017287	GAAAA	2	10	82668	82677	80 %	0 %	20 %	0 %	384450163
46	NC_017287	AGGAA	2	10	84667	84676	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017287	CTTTT	2	10	85556	85565	0 %	80 %	0 %	20 %	384450167
48	NC_017287	CAAAG	2	10	87027	87036	60 %	0 %	20 %	20 %	384450169
49	NC_017287	AACAA	2	10	87194	87203	80 %	0 %	0 %	20 %	384450169
50	NC_017287	AGAAA	2	10	87264	87273	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017287	AAAGA	2	10	89100	89109	80 %	0 %	20 %	0 %	384450171
52	NC_017287	TTTTC	2	10	90115	90124	0 %	80 %	0 %	20 %	384450171
53	NC_017287	AGGAT	2	10	90638	90647	40 %	20 %	40 %	0 %	384450171
54	NC_017287	ATAAC	2	10	90724	90733	60 %	20 %	0 %	20 %	384450171
55	NC_017287	TGGCA	2	10	93209	93218	20 %	20 %	40 %	20 %	384450172
56	NC_017287	AATTA	2	10	93873	93882	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017287	TGTTT	2	10	94934	94943	0 %	80 %	20 %	0 %	384450174
58	NC_017287	TCACC	2	10	96508	96517	20 %	20 %	0 %	60 %	384450175
59	NC_017287	AAAAT	2	10	96643	96652	80 %	20 %	0 %	0 %	384450175
60	NC_017287	TTAAT	2	10	97687	97696	40 %	60 %	0 %	0 %	384450176
61	NC_017287	ATTTG	2	10	98870	98879	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017287	AAAAT	2	10	99591	99600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017287	ATTAC	2	10	102819	102828	40 %	40 %	0 %	20 %	384450185
64	NC_017287	CTACA	2	10	103193	103202	40 %	20 %	0 %	40 %	384450185
65	NC_017287	AATTA	2	10	104740	104749	60 %	40 %	0 %	0 %	384450187
66	NC_017287	CTATA	2	10	105730	105739	40 %	40 %	0 %	20 %	384450188
67	NC_017287	CTTTT	2	10	108273	108282	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017287	AGCTT	2	10	108384	108393	20 %	40 %	20 %	20 %	384450191
69	NC_017287	GTTTG	2	10	108691	108700	0 %	60 %	40 %	0 %	384450191
70	NC_017287	AGTTA	2	10	115496	115505	40 %	40 %	20 %	0 %	384450206
71	NC_017287	AGTTT	2	10	115986	115995	20 %	60 %	20 %	0 %	384450207
72	NC_017287	TTTGC	2	10	116901	116910	0 %	60 %	20 %	20 %	384450209
73	NC_017287	TTTAC	2	10	119098	119107	20 %	60 %	0 %	20 %	384450212
74	NC_017287	AATTA	2	10	121991	122000	60 %	40 %	0 %	0 %	384450215
75	NC_017287	CTTTT	2	10	122789	122798	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017287	GAGAT	2	10	123345	123354	40 %	20 %	40 %	0 %	384450217
77	NC_017287	GTCAA	2	10	124664	124673	40 %	20 %	20 %	20 %	384450219
78	NC_017287	TAGGG	2	10	127136	127145	20 %	20 %	60 %	0 %	384450222
79	NC_017287	AACTT	2	10	128068	128077	40 %	40 %	0 %	20 %	384450222
80	NC_017287	TTCTT	2	10	131272	131281	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_017287	TGTCA	2	10	131953	131962	20 %	40 %	20 %	20 %	384450225
82	NC_017287	AAAAG	2	10	135359	135368	80 %	0 %	20 %	0 %	384450227
83	NC_017287	TAAAA	2	10	135640	135649	80 %	20 %	0 %	0 %	384450227
84	NC_017287	GATTT	2	10	137899	137908	20 %	60 %	20 %	0 %	384450229
85	NC_017287	TTGTT	2	10	138241	138250	0 %	80 %	20 %	0 %	384450229
86	NC_017287	AAGAA	2	10	138722	138731	80 %	0 %	20 %	0 %	384450229
87	NC_017287	TTCTT	2	10	139315	139324	0 %	80 %	0 %	20 %	384450231
88	NC_017287	CTTTG	2	10	141219	141228	0 %	60 %	20 %	20 %	384450233
89	NC_017287	AGAAA	2	10	143256	143265	80 %	0 %	20 %	0 %	384450236
90	NC_017287	AAAGA	2	10	145921	145930	80 %	0 %	20 %	0 %	384450238
91	NC_017287	TTTTA	2	10	148100	148109	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017287	TACTC	2	10	149552	149561	20 %	40 %	0 %	40 %	384450244
93	NC_017287	CGTTT	2	10	149599	149608	0 %	60 %	20 %	20 %	384450244
94	NC_017287	ATTTT	2	10	149739	149748	20 %	80 %	0 %	0 %	384450244
95	NC_017287	ACCAT	2	10	151770	151779	40 %	20 %	0 %	40 %	384450245
96	NC_017287	CAGAA	2	10	152735	152744	60 %	0 %	20 %	20 %	384450246
97	NC_017287	TTCAT	2	10	153305	153314	20 %	60 %	0 %	20 %	384450246
98	NC_017287	AAAGG	2	10	154135	154144	60 %	0 %	40 %	0 %	384450247
99	NC_017287	ATAGG	2	10	155827	155836	40 %	20 %	40 %	0 %	384450249
100	NC_017287	TTTGA	2	10	155913	155922	20 %	60 %	20 %	0 %	384450249
101	NC_017287	AAGGT	2	10	160854	160863	40 %	20 %	40 %	0 %	384450253
102	NC_017287	TTTTG	2	10	161793	161802	0 %	80 %	20 %	0 %	384450255
103	NC_017287	GGGGC	2	10	161940	161949	0 %	0 %	80 %	20 %	384450255
104	NC_017287	AGCAT	2	10	163232	163241	40 %	20 %	20 %	20 %	384450257
105	NC_017287	TAAAT	2	10	164419	164428	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017287	AAATG	2	10	166347	166356	60 %	20 %	20 %	0 %	384450258
107	NC_017287	GGGGA	2	10	168122	168131	20 %	0 %	80 %	0 %	384450259
108	NC_017287	TTTTC	2	10	169171	169180	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017287	CTGTT	2	10	169650	169659	0 %	60 %	20 %	20 %	384450261
110	NC_017287	AATGA	2	10	169685	169694	60 %	20 %	20 %	0 %	384450261
111	NC_017287	ATTTT	2	10	173144	173153	20 %	80 %	0 %	0 %	384450266
112	NC_017287	GAGAG	2	10	173161	173170	40 %	0 %	60 %	0 %	384450266
113	NC_017287	CAAAA	2	10	173491	173500	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017287	CGCAT	2	10	173861	173870	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_017287	CTAAG	2	10	181102	181111	40 %	20 %	20 %	20 %	384450273
116	NC_017287	TTTTC	2	10	181702	181711	0 %	80 %	0 %	20 %	384450273
117	NC_017287	GGTAC	2	10	183697	183706	20 %	20 %	40 %	20 %	384450275
118	NC_017287	AGGGA	2	10	186884	186893	40 %	0 %	60 %	0 %	384450279
119	NC_017287	AATGT	2	10	187293	187302	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017287	AGGAA	2	10	187907	187916	60 %	0 %	40 %	0 %	384450280
121	NC_017287	TTCTT	2	10	188286	188295	0 %	80 %	0 %	20 %	384450280
122	NC_017287	GATAA	2	10	190929	190938	60 %	20 %	20 %	0 %	384450280
123	NC_017287	CCCTT	2	10	193133	193142	0 %	40 %	0 %	60 %	384450281
124	NC_017287	TTTTA	2	10	193834	193843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017287	AGTTA	2	10	194124	194133	40 %	40 %	20 %	0 %	384450282
126	NC_017287	TTATT	2	10	194144	194153	20 %	80 %	0 %	0 %	384450282
127	NC_017287	CCCTA	2	10	195197	195206	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
128	NC_017287	AGGGT	2	10	197068	197077	20 %	20 %	60 %	0 %	384450284
129	NC_017287	TGGAT	2	10	197509	197518	20 %	40 %	40 %	0 %	384450284
130	NC_017287	CTAAA	2	10	197566	197575	60 %	20 %	0 %	20 %	384450284
131	NC_017287	CTTTA	2	10	197869	197878	20 %	60 %	0 %	20 %	384450284
132	NC_017287	AAAAT	2	10	198046	198055	80 %	20 %	0 %	0 %	384450284
133	NC_017287	GTTTT	2	10	198549	198558	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017287	ATTAA	2	10	200973	200982	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017287	TTGGT	2	10	201349	201358	0 %	60 %	40 %	0 %	384450287
136	NC_017287	AGCAA	2	10	203826	203835	60 %	0 %	20 %	20 %	384450290
137	NC_017287	TAATG	2	10	204941	204950	40 %	40 %	20 %	0 %	384450291
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