MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila psittaci 6BC chromosome

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017287	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017287	AG	3	6	17606	17611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017287	TC	3	6	31760	31765	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017287	TC	3	6	37650	37655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017287	TA	3	6	52124	52129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017287	TG	3	6	63217	63222	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017287	GA	3	6	96980	96985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017287	GA	3	6	98889	98894	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017287	AG	3	6	101700	101705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017287	TC	3	6	108184	108189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017287	AG	3	6	112274	112279	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017287	TA	4	8	123968	123975	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017287	TA	4	8	125236	125243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017287	TG	3	6	128339	128344	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017287	AC	3	6	128473	128478	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017287	AT	3	6	130150	130155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017287	TA	3	6	130433	130438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017287	CT	3	6	130529	130534	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017287	CT	3	6	130660	130665	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017287	GA	3	6	134272	134277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017287	AG	3	6	157994	157999	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017287	TA	3	6	173084	173089	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017287	AG	3	6	173128	173133	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017287	AT	3	6	175323	175328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017287	AG	3	6	179383	179388	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017287	CT	3	6	193624	193629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017287	AG	3	6	198260	198265	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017287	TA	4	8	198281	198288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017287	AC	3	6	199149	199154	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017287	AG	3	6	203056	203061	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017287	AT	3	6	203397	203402	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017287	AT	3	6	210273	210278	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017287	AT	3	6	215349	215354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017287	GA	3	6	215409	215414	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017287	GT	3	6	215449	215454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017287	CT	3	6	215486	215491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017287	AG	3	6	215713	215718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017287	TC	3	6	215772	215777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017287	AG	3	6	222831	222836	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017287	TA	4	8	232166	232173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017287	AG	3	6	236912	236917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017287	AT	3	6	236982	236987	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017287	AG	3	6	241009	241014	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017287	AG	3	6	243975	243980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017287	GT	3	6	261518	261523	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017287	TC	3	6	266630	266635	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_017287	AT	4	8	266668	266675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017287	TC	3	6	267772	267777	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017287	TG	3	6	267918	267923	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017287	TG	3	6	276702	276707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017287	GT	3	6	277544	277549	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017287	TC	3	6	282046	282051	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017287	TA	3	6	282095	282100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017287	CA	3	6	299802	299807	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_017287	AT	3	6	301274	301279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017287	TC	3	6	301580	301585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017287	AC	3	6	310678	310683	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017287	TA	3	6	310985	310990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017287	AT	3	6	311129	311134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017287	TA	3	6	311434	311439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017287	AG	3	6	312206	312211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017287	GA	3	6	312648	312653	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017287	AG	3	6	313539	313544	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017287	AG	3	6	313655	313660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017287	GA	3	6	313705	313710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017287	AC	3	6	319210	319215	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_017287	TC	3	6	327629	327634	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_017287	AT	3	6	327882	327887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017287	TG	3	6	327898	327903	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017287	AG	3	6	328315	328320	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017287	AG	3	6	328553	328558	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017287	AT	3	6	329721	329726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017287	TG	3	6	329985	329990	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017287	GA	3	6	330031	330036	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017287	AG	3	6	332949	332954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017287	TG	3	6	333727	333732	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017287	TC	3	6	334658	334663	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_017287	GT	3	6	334739	334744	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017287	GT	3	6	335110	335115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017287	AC	3	6	335782	335787	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017287	AG	3	6	336264	336269	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017287	GT	4	8	336904	336911	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017287	TC	3	6	342410	342415	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_017287	TA	3	6	345404	345409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017287	GT	3	6	347832	347837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_017287	TA	3	6	350980	350985	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017287	TA	3	6	356559	356564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017287	CT	4	8	359175	359182	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017287	TA	3	6	362666	362671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017287	AT	3	6	367857	367862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017287	TA	3	6	370498	370503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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95	NC_017287	AT	3	6	374898	374903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017287	TG	3	6	375147	375152	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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98	NC_017287	TA	3	6	387019	387024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017287	TA	3	6	401619	401624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017287	CT	3	6	413692	413697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_017287	TG	3	6	413791	413796	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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106	NC_017287	GA	3	6	440632	440637	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017287	TC	3	6	445165	445170	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017287	AG	3	6	447149	447154	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017287	CT	3	6	447220	447225	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_017287	AG	3	6	447794	447799	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017287	TA	3	6	448337	448342	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017287	CT	3	6	449620	449625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_017287	TC	3	6	455250	455255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_017287	TG	3	6	460576	460581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017287	AG	3	6	460725	460730	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017287	CT	4	8	463607	463614	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_017287	AG	3	6	470436	470441	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017287	AG	3	6	477007	477012	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017287	AC	3	6	479780	479785	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017287	AG	3	6	481342	481347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017287	TA	3	6	481422	481427	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017287	CT	3	6	487839	487844	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017287	AG	4	8	489827	489834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017287	TC	3	6	491400	491405	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_017287	TA	3	6	494162	494167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017287	GA	3	6	504683	504688	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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128	NC_017287	AT	3	6	513911	513916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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132	NC_017287	CT	4	8	545875	545882	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_017287	AT	3	6	556940	556945	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017287	GT	3	6	564897	564902	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_017287	GA	3	6	590142	590147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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138	NC_017287	AC	3	6	590394	590399	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_017287	AG	3	6	590618	590623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017287	AC	3	6	601075	601080	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017287	GT	3	6	601095	601100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017287	AG	3	6	601206	601211	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017287	TC	3	6	601390	601395	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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145	NC_017287	TA	4	8	604190	604197	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017287	GA	5	10	621321	621330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_017287	TA	3	6	629519	629524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017287	AT	3	6	629539	629544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017287	CT	3	6	631862	631867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.