MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN plasmid unnamed

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017286	GTTG	2	8	69	76	0 %	50 %	50 %	0 %	384450087
2	NC_017286	TTGT	2	8	436	443	0 %	75 %	25 %	0 %	384450087
3	NC_017286	AAAG	2	8	512	519	75 %	0 %	25 %	0 %	384450087
4	NC_017286	GGAA	2	8	558	565	50 %	0 %	50 %	0 %	384450087
5	NC_017286	ATCT	2	8	599	606	25 %	50 %	0 %	25 %	384450087
6	NC_017286	AAAG	2	8	958	965	75 %	0 %	25 %	0 %	384450088
7	NC_017286	CAAG	2	8	1182	1189	50 %	0 %	25 %	25 %	384450088
8	NC_017286	GAAA	2	8	1262	1269	75 %	0 %	25 %	0 %	384450088
9	NC_017286	ACAA	2	8	3009	3016	75 %	0 %	0 %	25 %	384450090
10	NC_017286	ATCC	2	8	4472	4479	25 %	25 %	0 %	50 %	384450091
11	NC_017286	AATC	2	8	4806	4813	50 %	25 %	0 %	25 %	384450091
12	NC_017286	GTTT	2	8	4972	4979	0 %	75 %	25 %	0 %	384450091
13	NC_017286	GAAA	2	8	5732	5739	75 %	0 %	25 %	0 %	384450092
14	NC_017286	GAAT	2	8	6031	6038	50 %	25 %	25 %	0 %	384450092
15	NC_017286	ATTA	2	8	6242	6249	50 %	50 %	0 %	0 %	384450092
16	NC_017286	GGAA	2	8	6834	6841	50 %	0 %	50 %	0 %	384450093
17	NC_017286	GTTA	2	8	6855	6862	25 %	50 %	25 %	0 %	384450093
18	NC_017286	CAAA	2	8	7093	7100	75 %	0 %	0 %	25 %	384450093
19	NC_017286	TTAA	2	8	7104	7111	50 %	50 %	0 %	0 %	384450093

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.