MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN plasmid unnamed

Total Repeats: 20

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017286	TC	3	6	60	65	0 %	50 %	0 %	50 %	384450087
2	NC_017286	AT	3	6	1046	1051	50 %	50 %	0 %	0 %	384450088
3	NC_017286	AG	3	6	1058	1063	50 %	0 %	50 %	0 %	384450088
4	NC_017286	GA	3	6	1348	1353	50 %	0 %	50 %	0 %	384450088
5	NC_017286	TC	3	6	2262	2267	0 %	50 %	0 %	50 %	384450089
6	NC_017286	AT	3	6	2462	2467	50 %	50 %	0 %	0 %	384450089
7	NC_017286	CT	3	6	3181	3186	0 %	50 %	0 %	50 %	384450090
8	NC_017286	AT	3	6	3397	3402	50 %	50 %	0 %	0 %	384450090
9	NC_017286	AT	3	6	3517	3522	50 %	50 %	0 %	0 %	384450090
10	NC_017286	AG	3	6	3527	3532	50 %	0 %	50 %	0 %	384450090
11	NC_017286	TG	4	8	3581	3588	0 %	50 %	50 %	0 %	384450090
12	NC_017286	AT	4	8	3652	3659	50 %	50 %	0 %	0 %	384450090
13	NC_017286	AG	3	6	4647	4652	50 %	0 %	50 %	0 %	384450091
14	NC_017286	GA	3	6	4710	4715	50 %	0 %	50 %	0 %	384450091
15	NC_017286	GA	3	6	5040	5045	50 %	0 %	50 %	0 %	384450091
16	NC_017286	AT	3	6	6041	6046	50 %	50 %	0 %	0 %	384450092
17	NC_017286	TG	3	6	7008	7013	0 %	50 %	50 %	0 %	384450093
18	NC_017286	AT	3	6	7130	7135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017286	TA	3	6	7164	7169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017286	GA	3	6	7192	7197	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.