MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 907

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017285	TTTTG	2	10	2542	2551	0 %	80 %	20 %	0 %	384448991
2	NC_017285	AAAGT	2	10	3160	3169	60 %	20 %	20 %	0 %	384448992
3	NC_017285	AAAGA	2	10	4329	4338	80 %	0 %	20 %	0 %	384448992
4	NC_017285	AGAGA	2	10	4881	4890	60 %	0 %	40 %	0 %	384448992
5	NC_017285	AAGGA	2	10	5144	5153	60 %	0 %	40 %	0 %	384448992
6	NC_017285	AGATG	2	10	5566	5575	40 %	20 %	40 %	0 %	384448993
7	NC_017285	TGTAA	2	10	12481	12490	40 %	40 %	20 %	0 %	384448996
8	NC_017285	AAGGG	2	10	13407	13416	40 %	0 %	60 %	0 %	384448996
9	NC_017285	CCCTT	2	10	13864	13873	0 %	40 %	0 %	60 %	384448997
10	NC_017285	CTTGC	2	10	14161	14170	0 %	40 %	20 %	40 %	384448997
11	NC_017285	AATTT	2	10	15881	15890	40 %	60 %	0 %	0 %	384448998
12	NC_017285	GTACA	2	10	16903	16912	40 %	20 %	20 %	20 %	384448999
13	NC_017285	TAATA	2	10	17399	17408	60 %	40 %	0 %	0 %	384448999
14	NC_017285	AGATA	2	10	18628	18637	60 %	20 %	20 %	0 %	384449001
15	NC_017285	GAAAA	2	10	22449	22458	80 %	0 %	20 %	0 %	384449005
16	NC_017285	GTGAT	2	10	24438	24447	20 %	40 %	40 %	0 %	384449006
17	NC_017285	TTTGA	2	10	26371	26380	20 %	60 %	20 %	0 %	384449007
18	NC_017285	TTTGT	2	10	27864	27873	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017285	TAAAT	2	10	28500	28509	60 %	40 %	0 %	0 %	384449008
20	NC_017285	GATTA	2	10	30816	30825	40 %	40 %	20 %	0 %	384449009
21	NC_017285	GATCC	2	10	33606	33615	20 %	20 %	20 %	40 %	384449013
22	NC_017285	ATTTT	2	10	38707	38716	20 %	80 %	0 %	0 %	384449019
23	NC_017285	GGAAG	2	10	40713	40722	40 %	0 %	60 %	0 %	384449021
24	NC_017285	TCGAT	2	10	43198	43207	20 %	40 %	20 %	20 %	384449024
25	NC_017285	CCTTT	2	10	43966	43975	0 %	60 %	0 %	40 %	384449024
26	NC_017285	CTTTG	2	10	45242	45251	0 %	60 %	20 %	20 %	384449026
27	NC_017285	AGAGA	2	10	48978	48987	60 %	0 %	40 %	0 %	384449030
28	NC_017285	CTAAC	2	10	49930	49939	40 %	20 %	0 %	40 %	384449031
29	NC_017285	CTCCC	2	10	49984	49993	0 %	20 %	0 %	80 %	384449031
30	NC_017285	GGTTA	2	10	51187	51196	20 %	40 %	40 %	0 %	384449032
31	NC_017285	AAAGT	2	10	53586	53595	60 %	20 %	20 %	0 %	384449033
32	NC_017285	GCAAG	2	10	54836	54845	40 %	0 %	40 %	20 %	384449034
33	NC_017285	GAAAA	2	10	56657	56666	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017285	TGATG	2	10	59898	59907	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017285	ATTGC	2	10	61895	61904	20 %	40 %	20 %	20 %	384449041
36	NC_017285	TTATG	2	10	63077	63086	20 %	60 %	20 %	0 %	384449041
37	NC_017285	TTTTC	2	10	63124	63133	0 %	80 %	0 %	20 %	384449041
38	NC_017285	GTTTT	2	10	71925	71934	0 %	80 %	20 %	0 %	384449048
39	NC_017285	TGGGG	2	10	72469	72478	0 %	20 %	80 %	0 %	384449050
40	NC_017285	TTTGA	2	10	72952	72961	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017285	TTTTC	2	10	73084	73093	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017285	TTTTG	2	10	74341	74350	0 %	80 %	20 %	0 %	384449053
43	NC_017285	TCTTT	2	10	76019	76028	0 %	80 %	0 %	20 %	384449055
44	NC_017285	TCTTT	2	10	77620	77629	0 %	80 %	0 %	20 %	384449057
45	NC_017285	AATAG	2	10	79968	79977	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017285	TTAAT	2	10	80028	80037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017285	TGCAA	2	10	81242	81251	40 %	20 %	20 %	20 %	384449061
48	NC_017285	AAAAC	2	10	82484	82493	80 %	0 %	0 %	20 %	384449062
49	NC_017285	AGAAA	2	10	84399	84408	80 %	0 %	20 %	0 %	384449063
50	NC_017285	GAGAG	2	10	86188	86197	40 %	0 %	60 %	0 %	384449065
51	NC_017285	ACAAT	2	10	88094	88103	60 %	20 %	0 %	20 %	384449067
52	NC_017285	ACGTC	2	10	90534	90543	20 %	20 %	20 %	40 %	384449071
53	NC_017285	TAAAG	2	10	92128	92137	60 %	20 %	20 %	0 %	384449072
54	NC_017285	TTTTC	2	10	93144	93153	0 %	80 %	0 %	20 %	384449072
55	NC_017285	AAATC	2	10	93710	93719	60 %	20 %	0 %	20 %	384449072
56	NC_017285	GGATT	2	10	96114	96123	20 %	40 %	40 %	0 %	384449073
57	NC_017285	CACTT	2	10	97288	97297	20 %	40 %	0 %	40 %	384449075
58	NC_017285	TTCTT	2	10	97501	97510	0 %	80 %	0 %	20 %	384449075
59	NC_017285	GCTTT	2	10	97667	97676	0 %	60 %	20 %	20 %	384449075
60	NC_017285	CGATA	2	10	97754	97763	40 %	20 %	20 %	20 %	384449075
61	NC_017285	TTAAA	2	10	99367	99376	60 %	40 %	0 %	0 %	384449076
62	NC_017285	GGGTG	2	10	102604	102613	0 %	20 %	80 %	0 %	384449080
63	NC_017285	TCAAA	2	10	103793	103802	60 %	20 %	0 %	20 %	384449083
64	NC_017285	TTAAC	2	10	106187	106196	40 %	40 %	0 %	20 %	384449085
65	NC_017285	CTTTT	2	10	111004	111013	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017285	TTGGA	2	10	111422	111431	20 %	40 %	40 %	0 %	384449091
67	NC_017285	AAATA	2	10	111827	111836	80 %	20 %	0 %	0 %	384449092
68	NC_017285	GCAAT	2	10	114747	114756	40 %	20 %	20 %	20 %	384449097
69	NC_017285	ATGCA	2	10	115133	115142	40 %	20 %	20 %	20 %	384449098
70	NC_017285	TGCTT	2	10	119621	119630	0 %	60 %	20 %	20 %	384449109
71	NC_017285	AGTTT	2	10	120531	120540	20 %	60 %	20 %	0 %	384449109
72	NC_017285	TATGT	2	10	120547	120556	20 %	60 %	20 %	0 %	384449109
73	NC_017285	TGAAA	2	10	120623	120632	60 %	20 %	20 %	0 %	384449109
74	NC_017285	ACAAT	2	10	121472	121481	60 %	20 %	0 %	20 %	384449111
75	NC_017285	TGCTT	2	10	121961	121970	0 %	60 %	20 %	20 %	384449112
76	NC_017285	TTGAC	2	10	124125	124134	20 %	40 %	20 %	20 %	384449114
77	NC_017285	TAAAA	2	10	127931	127940	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017285	GTTTA	2	10	128401	128410	20 %	60 %	20 %	0 %	384449119
79	NC_017285	ACGTA	2	10	128547	128556	40 %	20 %	20 %	20 %	384449120
80	NC_017285	TTGGT	2	10	130667	130676	0 %	60 %	40 %	0 %	384449121
81	NC_017285	CAACT	2	10	130790	130799	40 %	20 %	0 %	40 %	384449121
82	NC_017285	GTTAT	2	10	132733	132742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017285	GAAAA	2	10	134834	134843	80 %	0 %	20 %	0 %	384449125
84	NC_017285	TCCTA	2	10	134919	134928	20 %	40 %	0 %	40 %	384449125
85	NC_017285	CTGGA	2	10	135235	135244	20 %	20 %	40 %	20 %	384449125
86	NC_017285	CTTTG	2	10	136836	136845	0 %	60 %	20 %	20 %	384449127
87	NC_017285	AGAGA	2	10	137149	137158	60 %	0 %	40 %	0 %	384449127
88	NC_017285	TTTGG	2	10	138928	138937	0 %	60 %	40 %	0 %	384449127
89	NC_017285	TCTCC	2	10	141908	141917	0 %	40 %	0 %	60 %	384449131
90	NC_017285	AAATT	2	10	142495	142504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017285	GAGGG	2	10	142607	142616	20 %	0 %	80 %	0 %	384449132
92	NC_017285	TACCT	2	10	142750	142759	20 %	40 %	0 %	40 %	384449132
93	NC_017285	GGATA	2	10	144052	144061	40 %	20 %	40 %	0 %	384449133
94	NC_017285	ATCTA	2	10	145053	145062	40 %	40 %	0 %	20 %	384449134
95	NC_017285	GTCCT	2	10	145821	145830	0 %	40 %	20 %	40 %	384449135
96	NC_017285	GACGA	2	10	148964	148973	40 %	0 %	40 %	20 %	384449139
97	NC_017285	TATGG	2	10	151689	151698	20 %	40 %	40 %	0 %	384449141
98	NC_017285	AGAGA	2	10	154049	154058	60 %	0 %	40 %	0 %	384449143
99	NC_017285	TGGAG	2	10	155383	155392	20 %	20 %	60 %	0 %	384449144
100	NC_017285	TTTTC	2	10	157263	157272	0 %	80 %	0 %	20 %	384449146
101	NC_017285	AAGAA	2	10	158173	158182	80 %	0 %	20 %	0 %	384449146
102	NC_017285	TTATT	2	10	159018	159027	20 %	80 %	0 %	0 %	384449147
103	NC_017285	TTGTT	2	10	161342	161351	0 %	80 %	20 %	0 %	384449149
104	NC_017285	AAGCT	2	10	163937	163946	40 %	20 %	20 %	20 %	384449152
105	NC_017285	ATAAA	2	10	164018	164027	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017285	GCTTT	2	10	165178	165187	0 %	60 %	20 %	20 %	384449153
107	NC_017285	TCCAG	2	10	165724	165733	20 %	20 %	20 %	40 %	384449154
108	NC_017285	AAGAG	2	10	168035	168044	60 %	0 %	40 %	0 %	384449155
109	NC_017285	TTTGA	2	10	168861	168870	20 %	60 %	20 %	0 %	384449156
110	NC_017285	TTTGT	2	10	169272	169281	0 %	80 %	20 %	0 %	384449157
111	NC_017285	GGGGA	2	10	169449	169458	20 %	0 %	80 %	0 %	384449157
112	NC_017285	CTTGT	2	10	170306	170315	0 %	60 %	20 %	20 %	384449158
113	NC_017285	TTTGA	2	10	171480	171489	20 %	60 %	20 %	0 %	384449159
114	NC_017285	AGGAG	2	10	172555	172564	40 %	0 %	60 %	0 %	384449160
115	NC_017285	TTAAA	2	10	173166	173175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017285	CAAAA	2	10	173617	173626	80 %	0 %	0 %	20 %	384449162
117	NC_017285	ACTTG	2	10	176909	176918	20 %	40 %	20 %	20 %	384449166
118	NC_017285	TTTGA	2	10	177846	177855	20 %	60 %	20 %	0 %	384449166
119	NC_017285	CGTCC	2	10	178994	179003	0 %	20 %	20 %	60 %	384449166
120	NC_017285	AAAAG	2	10	181729	181738	80 %	0 %	20 %	0 %	384449168
121	NC_017285	CATCG	2	10	182890	182899	20 %	20 %	20 %	40 %	384449168
122	NC_017285	AGATA	2	10	183004	183013	60 %	20 %	20 %	0 %	384449168
123	NC_017285	AAGAA	2	10	184725	184734	80 %	0 %	20 %	0 %	384449171
124	NC_017285	TATTC	2	10	186147	186156	20 %	60 %	0 %	20 %	384449173
125	NC_017285	CAAAA	2	10	188775	188784	80 %	0 %	0 %	20 %	384449177
126	NC_017285	AAATC	2	10	189346	189355	60 %	20 %	0 %	20 %	384449177
127	NC_017285	AAACG	2	10	191428	191437	60 %	0 %	20 %	20 %	384449177
128	NC_017285	ACAAG	2	10	192570	192579	60 %	0 %	20 %	20 %	384449178
129	NC_017285	GGCAT	2	10	193193	193202	20 %	20 %	40 %	20 %	384449178
130	NC_017285	CTCTT	2	10	193451	193460	0 %	60 %	0 %	40 %	384449178
131	NC_017285	TTTTA	2	10	195291	195300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017285	GAAAA	2	10	195392	195401	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017285	ATTAA	2	10	196408	196417	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017285	ACCTC	2	10	197634	197643	20 %	20 %	0 %	60 %	384449181
135	NC_017285	ATTTC	2	10	198385	198394	20 %	60 %	0 %	20 %	384449182
136	NC_017285	TGATT	2	10	198445	198454	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017285	CGTAA	2	10	200022	200031	40 %	20 %	20 %	20 %	384449184
138	NC_017285	CAATC	2	10	201061	201070	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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144	NC_017285	TTTAG	2	10	204350	204359	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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147	NC_017285	TAACC	2	10	212613	212622	40 %	20 %	0 %	40 %	384449197
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150	NC_017285	ATCTT	2	10	216512	216521	20 %	60 %	0 %	20 %	384449200
151	NC_017285	TTGTG	2	10	219727	219736	0 %	60 %	40 %	0 %	384449200
152	NC_017285	TTTTC	2	10	221590	221599	0 %	80 %	0 %	20 %	384449201
153	NC_017285	TTTTA	2	10	224357	224366	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017285	AAAAT	2	10	225888	225897	80 %	20 %	0 %	0 %	384449205
155	NC_017285	TTGCT	2	10	227399	227408	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_017285	TACTC	2	10	227428	227437	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_017285	GCCTT	2	10	228877	228886	0 %	40 %	20 %	40 %	384449209
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159	NC_017285	AGTCG	2	10	230202	230211	20 %	20 %	40 %	20 %	384449211
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161	NC_017285	GCATG	2	10	231584	231593	20 %	20 %	40 %	20 %	384449212
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163	NC_017285	GCAAT	2	10	233560	233569	40 %	20 %	20 %	20 %	384449214
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177	NC_017285	TTTAG	2	10	261564	261573	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_017285	CTTAA	2	10	261632	261641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
179	NC_017285	GCGTG	2	10	263496	263505	0 %	20 %	60 %	20 %	384449241
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224	NC_017285	TATTT	2	10	335016	335025	20 %	80 %	0 %	0 %	384449286
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252	NC_017285	CCCAT	2	10	373089	373098	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
253	NC_017285	TTATG	2	10	377881	377890	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
254	NC_017285	TTGCG	2	10	379190	379199	0 %	40 %	40 %	20 %	384449322
255	NC_017285	CCCTG	2	10	379274	379283	0 %	20 %	20 %	60 %	384449322
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260	NC_017285	TATGT	2	10	382900	382909	20 %	60 %	20 %	0 %	384449326
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266	NC_017285	TGAGG	2	10	395490	395499	20 %	20 %	60 %	0 %	384449339
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