MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 3179

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017285	GGTT	2	8	870	877	0 %	50 %	50 %	0 %	384448989
2	NC_017285	TAAT	2	8	1495	1502	50 %	50 %	0 %	0 %	384448990
3	NC_017285	GATT	2	8	1528	1535	25 %	50 %	25 %	0 %	384448990
4	NC_017285	AGCT	2	8	1546	1553	25 %	25 %	25 %	25 %	384448990
5	NC_017285	GTAG	2	8	1806	1813	25 %	25 %	50 %	0 %	384448990
6	NC_017285	TTCA	2	8	2466	2473	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017285	GCCA	2	8	2656	2663	25 %	0 %	25 %	50 %	384448991
8	NC_017285	CTGT	2	8	2726	2733	0 %	50 %	25 %	25 %	384448991
9	NC_017285	AATT	2	8	3266	3273	50 %	50 %	0 %	0 %	384448992
10	NC_017285	TTTC	2	8	3563	3570	0 %	75 %	0 %	25 %	384448992
11	NC_017285	AGTT	2	8	3737	3744	25 %	50 %	25 %	0 %	384448992
12	NC_017285	CTTC	2	8	4217	4224	0 %	50 %	0 %	50 %	384448992
13	NC_017285	TGTT	2	8	4379	4386	0 %	75 %	25 %	0 %	384448992
14	NC_017285	TCCC	2	8	4588	4595	0 %	25 %	0 %	75 %	384448992
15	NC_017285	CTTT	2	8	5077	5084	0 %	75 %	0 %	25 %	384448992
16	NC_017285	AATC	2	8	5302	5309	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_017285	GAAG	2	8	5827	5834	50 %	0 %	50 %	0 %	384448993
18	NC_017285	GAAA	2	8	5932	5939	75 %	0 %	25 %	0 %	384448993
19	NC_017285	GTGG	2	8	7218	7225	0 %	25 %	75 %	0 %	384448994
20	NC_017285	TAGA	2	8	7703	7710	50 %	25 %	25 %	0 %	384448995
21	NC_017285	ATCA	2	8	7804	7811	50 %	25 %	0 %	25 %	384448995
22	NC_017285	AAAT	2	8	8287	8294	75 %	25 %	0 %	0 %	384448995
23	NC_017285	TAGG	2	8	8412	8419	25 %	25 %	50 %	0 %	384448995
24	NC_017285	GCAA	2	8	8443	8450	50 %	0 %	25 %	25 %	384448995
25	NC_017285	AAAT	2	8	8825	8832	75 %	25 %	0 %	0 %	384448995
26	NC_017285	AAAG	2	8	8867	8874	75 %	0 %	25 %	0 %	384448995
27	NC_017285	TAGG	2	8	9234	9241	25 %	25 %	50 %	0 %	384448995
28	NC_017285	TAGG	2	8	9377	9384	25 %	25 %	50 %	0 %	384448995
29	NC_017285	TTGG	2	8	10035	10042	0 %	50 %	50 %	0 %	384448995
30	NC_017285	TAGT	2	8	10166	10173	25 %	50 %	25 %	0 %	384448995
31	NC_017285	TCAA	2	8	10517	10524	50 %	25 %	0 %	25 %	384448995
32	NC_017285	ATAA	2	8	11107	11114	75 %	25 %	0 %	0 %	384448996
33	NC_017285	AAAG	2	8	11178	11185	75 %	0 %	25 %	0 %	384448996
34	NC_017285	AGTA	2	8	11314	11321	50 %	25 %	25 %	0 %	384448996
35	NC_017285	CATT	2	8	11382	11389	25 %	50 %	0 %	25 %	384448996
36	NC_017285	AAGG	2	8	11577	11584	50 %	0 %	50 %	0 %	384448996
37	NC_017285	CAGG	2	8	11707	11714	25 %	0 %	50 %	25 %	384448996
38	NC_017285	TGAA	2	8	12240	12247	50 %	25 %	25 %	0 %	384448996
39	NC_017285	TTTG	2	8	12756	12763	0 %	75 %	25 %	0 %	384448996
40	NC_017285	GTGG	2	8	13329	13336	0 %	25 %	75 %	0 %	384448996
41	NC_017285	TCTT	2	8	14400	14407	0 %	75 %	0 %	25 %	384448997
42	NC_017285	GGTT	2	8	14865	14872	0 %	50 %	50 %	0 %	384448997
43	NC_017285	AGAA	2	8	15343	15350	75 %	0 %	25 %	0 %	384448997
44	NC_017285	ATCT	2	8	15480	15487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017285	AGAT	2	8	15847	15854	50 %	25 %	25 %	0 %	384448998
46	NC_017285	AGAA	2	8	17775	17782	75 %	0 %	25 %	0 %	384449000
47	NC_017285	CTTT	2	8	18046	18053	0 %	75 %	0 %	25 %	384449000
48	NC_017285	GTTC	2	8	18505	18512	0 %	50 %	25 %	25 %	384449001
49	NC_017285	GGAG	2	8	19263	19270	25 %	0 %	75 %	0 %	384449001
50	NC_017285	TTTA	2	8	19693	19700	25 %	75 %	0 %	0 %	384449003
51	NC_017285	GATT	2	8	20082	20089	25 %	50 %	25 %	0 %	384449004
52	NC_017285	GTTC	2	8	20719	20726	0 %	50 %	25 %	25 %	384449004
53	NC_017285	TGCT	2	8	21165	21172	0 %	50 %	25 %	25 %	384449004
54	NC_017285	TGTT	2	8	21446	21453	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017285	CTTT	2	8	21470	21477	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_017285	ATTA	2	8	22850	22857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017285	CCAC	2	8	23234	23241	25 %	0 %	0 %	75 %	384449006
58	NC_017285	CTTC	2	8	23508	23515	0 %	50 %	0 %	50 %	384449006
59	NC_017285	CAGA	2	8	23645	23652	50 %	0 %	25 %	25 %	384449006
60	NC_017285	GTTT	2	8	24756	24763	0 %	75 %	25 %	0 %	384449006
61	NC_017285	AATA	2	8	24969	24976	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017285	TGAT	2	8	25072	25079	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017285	TTCT	2	8	25116	25123	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017285	CTTT	2	8	26076	26083	0 %	75 %	0 %	25 %	384449007
65	NC_017285	TCAT	2	8	27089	27096	25 %	50 %	0 %	25 %	384449007
66	NC_017285	ATGT	2	8	27129	27136	25 %	50 %	25 %	0 %	384449007
67	NC_017285	AGCT	2	8	27555	27562	25 %	25 %	25 %	25 %	384449007
68	NC_017285	ATAA	2	8	27834	27841	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017285	TTAA	2	8	27991	27998	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017285	GCGA	2	8	28204	28211	25 %	0 %	50 %	25 %	384449008
71	NC_017285	GGCA	2	8	28659	28666	25 %	0 %	50 %	25 %	384449008
72	NC_017285	AAAC	2	8	29564	29571	75 %	0 %	0 %	25 %	384449008
73	NC_017285	GATC	2	8	29775	29782	25 %	25 %	25 %	25 %	384449008
74	NC_017285	TTAC	2	8	30201	30208	25 %	50 %	0 %	25 %	384449008
75	NC_017285	CTCG	2	8	30669	30676	0 %	25 %	25 %	50 %	384449009
76	NC_017285	GCTT	2	8	31033	31040	0 %	50 %	25 %	25 %	384449010
77	NC_017285	TTTG	2	8	32739	32746	0 %	75 %	25 %	0 %	384449012
78	NC_017285	TCTG	2	8	33106	33113	0 %	50 %	25 %	25 %	384449013
79	NC_017285	TAGA	2	8	33128	33135	50 %	25 %	25 %	0 %	384449013
80	NC_017285	GTAA	2	8	33259	33266	50 %	25 %	25 %	0 %	384449013
81	NC_017285	TTTA	2	8	33294	33301	25 %	75 %	0 %	0 %	384449013
82	NC_017285	TGCT	2	8	34210	34217	0 %	50 %	25 %	25 %	384449014
83	NC_017285	ATAA	2	8	34307	34314	75 %	25 %	0 %	0 %	384449014
84	NC_017285	TAAT	2	8	34465	34472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017285	AAAT	2	8	34489	34496	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017285	TTTA	2	8	34545	34552	25 %	75 %	0 %	0 %	384449015
87	NC_017285	TCCT	2	8	34784	34791	0 %	50 %	0 %	50 %	384449015
88	NC_017285	GTTT	2	8	34895	34902	0 %	75 %	25 %	0 %	384449015
89	NC_017285	TGGA	2	8	35178	35185	25 %	25 %	50 %	0 %	384449015
90	NC_017285	TCAG	2	8	35422	35429	25 %	25 %	25 %	25 %	384449015
91	NC_017285	TACA	2	8	35459	35466	50 %	25 %	0 %	25 %	384449015
92	NC_017285	CTTT	2	8	35504	35511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017285	GAAA	2	8	35555	35562	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017285	TGAA	2	8	36193	36200	50 %	25 %	25 %	0 %	384449017
95	NC_017285	AGAT	2	8	36523	36530	50 %	25 %	25 %	0 %	384449018
96	NC_017285	TAAA	2	8	38411	38418	75 %	25 %	0 %	0 %	384449019
97	NC_017285	GTAG	2	8	39181	39188	25 %	25 %	50 %	0 %	384449019
98	NC_017285	CCCG	2	8	39681	39688	0 %	0 %	25 %	75 %	384449019
99	NC_017285	AAAG	2	8	39714	39721	75 %	0 %	25 %	0 %	384449019
100	NC_017285	TGCT	2	8	39724	39731	0 %	50 %	25 %	25 %	384449019
101	NC_017285	GCCT	2	8	40052	40059	0 %	25 %	25 %	50 %	384449020
102	NC_017285	GAAA	2	8	40338	40345	75 %	0 %	25 %	0 %	384449021
103	NC_017285	TTAC	2	8	40435	40442	25 %	50 %	0 %	25 %	384449021
104	NC_017285	GAAA	2	8	41097	41104	75 %	0 %	25 %	0 %	384449021
105	NC_017285	TTTA	2	8	41120	41127	25 %	75 %	0 %	0 %	384449021
106	NC_017285	TAAA	2	8	41186	41193	75 %	25 %	0 %	0 %	384449021
107	NC_017285	TTCC	2	8	41291	41298	0 %	50 %	0 %	50 %	384449021
108	NC_017285	GTGC	2	8	41788	41795	0 %	25 %	50 %	25 %	384449023
109	NC_017285	TTCT	2	8	42367	42374	0 %	75 %	0 %	25 %	384449024
110	NC_017285	GAAA	2	8	42853	42860	75 %	0 %	25 %	0 %	384449024
111	NC_017285	AAGG	2	8	42944	42951	50 %	0 %	50 %	0 %	384449024
112	NC_017285	GTTT	2	8	43626	43633	0 %	75 %	25 %	0 %	384449024
113	NC_017285	TGTT	2	8	43737	43744	0 %	75 %	25 %	0 %	384449024
114	NC_017285	ATCA	2	8	43850	43857	50 %	25 %	0 %	25 %	384449024
115	NC_017285	GCAT	2	8	44070	44077	25 %	25 %	25 %	25 %	384449024
116	NC_017285	TGAT	2	8	44532	44539	25 %	50 %	25 %	0 %	384449024
117	NC_017285	GAAG	2	8	44584	44591	50 %	0 %	50 %	0 %	384449024
118	NC_017285	AATA	2	8	44615	44622	75 %	25 %	0 %	0 %	384449024
119	NC_017285	ATTA	2	8	44640	44647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017285	TTAA	2	8	46071	46078	50 %	50 %	0 %	0 %	384449027
121	NC_017285	ATTG	2	8	46164	46171	25 %	50 %	25 %	0 %	384449027
122	NC_017285	GAGT	2	8	46610	46617	25 %	25 %	50 %	0 %	384449028
123	NC_017285	TAAA	2	8	47698	47705	75 %	25 %	0 %	0 %	384449028
124	NC_017285	TAGA	2	8	47767	47774	50 %	25 %	25 %	0 %	384449029
125	NC_017285	TGCT	2	8	48016	48023	0 %	50 %	25 %	25 %	384449029
126	NC_017285	GGAA	2	8	48341	48348	50 %	0 %	50 %	0 %	384449030
127	NC_017285	TCAT	2	8	49791	49798	25 %	50 %	0 %	25 %	384449031
128	NC_017285	CAGT	2	8	50038	50045	25 %	25 %	25 %	25 %	384449031
129	NC_017285	AAAG	2	8	50194	50201	75 %	0 %	25 %	0 %	384449031
130	NC_017285	CTTT	2	8	50847	50854	0 %	75 %	0 %	25 %	384449032
131	NC_017285	TCTT	2	8	50863	50870	0 %	75 %	0 %	25 %	384449032
132	NC_017285	TAGA	2	8	51277	51284	50 %	25 %	25 %	0 %	384449032
133	NC_017285	GAAA	2	8	51368	51375	75 %	0 %	25 %	0 %	384449032
134	NC_017285	GTAA	2	8	52553	52560	50 %	25 %	25 %	0 %	384449033
135	NC_017285	GAAC	2	8	52569	52576	50 %	0 %	25 %	25 %	384449033
136	NC_017285	TATC	2	8	52720	52727	25 %	50 %	0 %	25 %	384449033
137	NC_017285	GAAC	2	8	53109	53116	50 %	0 %	25 %	25 %	384449033
138	NC_017285	TCCC	2	8	53655	53662	0 %	25 %	0 %	75 %	384449033
139	NC_017285	TTTA	2	8	54238	54245	25 %	75 %	0 %	0 %	384449033
140	NC_017285	AAGG	2	8	54341	54348	50 %	0 %	50 %	0 %	384449033
141	NC_017285	GGAA	2	8	55681	55688	50 %	0 %	50 %	0 %	384449034
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