MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 14233

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017285	TTG	2	6	63	68	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448989
2	NC_017285	GAA	2	6	138	143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448989
3	NC_017285	ATT	2	6	246	251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448989
4	NC_017285	TGA	2	6	254	259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
5	NC_017285	CTC	2	6	284	289	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384448989
6	NC_017285	ATG	2	6	397	402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
7	NC_017285	ATG	2	6	430	435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
8	NC_017285	ATG	2	6	510	515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448989
9	NC_017285	CTT	2	6	601	606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448989
10	NC_017285	TCT	2	6	711	716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448989
11	NC_017285	GAG	3	9	723	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448989
12	NC_017285	CAA	2	6	864	869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448989
13	NC_017285	ATT	2	6	939	944	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448989
14	NC_017285	CAC	2	6	1138	1143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448990
15	NC_017285	AAT	2	6	1259	1264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448990
16	NC_017285	AAC	2	6	1386	1391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448990
17	NC_017285	TTG	2	6	1399	1404	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448990
18	NC_017285	GTA	2	6	1560	1565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448990
19	NC_017285	TTC	2	6	1633	1638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448990
20	NC_017285	CTT	2	6	1696	1701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448990
21	NC_017285	CTT	2	6	1900	1905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448990
22	NC_017285	TGA	2	6	1972	1977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448990
23	NC_017285	GTT	2	6	2026	2031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448990
24	NC_017285	ATG	2	6	2142	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448990
25	NC_017285	CGT	2	6	2175	2180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448990
26	NC_017285	ACT	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448990
27	NC_017285	AAG	2	6	2633	2638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448991
28	NC_017285	ATT	2	6	2688	2693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448991
29	NC_017285	AGG	2	6	2840	2845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448991
30	NC_017285	TAT	2	6	2858	2863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448991
31	NC_017285	TAT	2	6	2892	2897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448991
32	NC_017285	AGA	2	6	3066	3071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
33	NC_017285	GAG	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448992
34	NC_017285	TTG	2	6	3143	3148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
35	NC_017285	CGT	2	6	3210	3215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448992
36	NC_017285	TTC	2	6	3260	3265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
37	NC_017285	GAA	2	6	3349	3354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
38	NC_017285	GTT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
39	NC_017285	CAG	2	6	3514	3519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448992
40	NC_017285	GCG	2	6	3602	3607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384448992
41	NC_017285	ACG	2	6	3621	3626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448992
42	NC_017285	GGT	2	6	3776	3781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448992
43	NC_017285	TTA	2	6	3950	3955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448992
44	NC_017285	TAA	2	6	4038	4043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448992
45	NC_017285	CTT	2	6	4069	4074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
46	NC_017285	AGA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
47	NC_017285	GTC	2	6	4148	4153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448992
48	NC_017285	TTG	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
49	NC_017285	CAA	2	6	4228	4233	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448992
50	NC_017285	TTC	2	6	4247	4252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
51	NC_017285	ACC	2	6	4258	4263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448992
52	NC_017285	ATG	2	6	4363	4368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448992
53	NC_017285	ACT	2	6	4535	4540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448992
54	NC_017285	TGG	2	6	4541	4546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448992
55	NC_017285	GAT	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448992
56	NC_017285	CCA	2	6	4622	4627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448992
57	NC_017285	TCT	2	6	4642	4647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448992
58	NC_017285	GTT	2	6	4681	4686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
59	NC_017285	AGA	3	9	4719	4727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
60	NC_017285	TTG	2	6	4787	4792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448992
61	NC_017285	AAG	2	6	4901	4906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
62	NC_017285	GAA	2	6	4924	4929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
63	NC_017285	GAA	2	6	5115	5120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
64	NC_017285	GAA	2	6	5185	5190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448992
65	NC_017285	CGG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384448993
66	NC_017285	GAA	3	9	5513	5521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448993
67	NC_017285	AGG	2	6	5632	5637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448993
68	NC_017285	CTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448993
69	NC_017285	TTA	2	6	5773	5778	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448993
70	NC_017285	GTT	2	6	5865	5870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448993
71	NC_017285	GCT	2	6	6050	6055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448993
72	NC_017285	TCA	2	6	6056	6061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448993
73	NC_017285	TGA	2	6	6124	6129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448993
74	NC_017285	AGA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448993
75	NC_017285	CAC	2	6	6183	6188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448993
76	NC_017285	AGA	2	6	6241	6246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448993
77	NC_017285	AAC	2	6	6414	6419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448993
78	NC_017285	ACA	2	6	6431	6436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448993
79	NC_017285	GAA	2	6	6444	6449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448993
80	NC_017285	TAT	3	9	6557	6565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448994
81	NC_017285	CTT	2	6	6676	6681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448994
82	NC_017285	CTT	2	6	6733	6738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448994
83	NC_017285	AGA	2	6	6740	6745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448994
84	NC_017285	CTC	2	6	6778	6783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384448994
85	NC_017285	TTG	2	6	6872	6877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448994
86	NC_017285	TAG	2	6	6940	6945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448994
87	NC_017285	TGG	2	6	7047	7052	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448994
88	NC_017285	AAG	2	6	7237	7242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448994
89	NC_017285	ACA	2	6	7317	7322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448994
90	NC_017285	TGG	2	6	7354	7359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448994
91	NC_017285	CTC	2	6	7381	7386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384448994
92	NC_017285	GAA	2	6	7428	7433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448994
93	NC_017285	GCT	2	6	7543	7548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448995
94	NC_017285	CAT	3	9	7614	7622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448995
95	NC_017285	AAT	2	6	7768	7773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448995
96	NC_017285	GTA	2	6	7774	7779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448995
97	NC_017285	AGT	2	6	7940	7945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448995
98	NC_017285	TGT	2	6	8099	8104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448995
99	NC_017285	AGA	2	6	8542	8547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448995
100	NC_017285	AAG	2	6	8589	8594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448995
101	NC_017285	TTC	3	9	8605	8613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448995
102	NC_017285	GAA	2	6	8646	8651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448995
103	NC_017285	TGG	2	6	8654	8659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448995
104	NC_017285	AAG	2	6	8667	8672	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448995
105	NC_017285	TCA	2	6	8763	8768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448995
106	NC_017285	ATG	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448995
107	NC_017285	TCT	2	6	8840	8845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448995
108	NC_017285	GAA	2	6	8928	8933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448995
109	NC_017285	TAG	2	6	8941	8946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448995
110	NC_017285	AGA	2	6	9159	9164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448995
111	NC_017285	ACT	2	6	9202	9207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448995
112	NC_017285	ATT	2	6	9322	9327	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448995
113	NC_017285	TCT	2	6	9347	9352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448995
114	NC_017285	TTG	2	6	9490	9495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448995
115	NC_017285	TCA	2	6	9515	9520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448995
116	NC_017285	GCA	2	6	9749	9754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448995
117	NC_017285	ATG	2	6	9862	9867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448995
118	NC_017285	ATC	2	6	9871	9876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448995
119	NC_017285	GCT	2	6	9891	9896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448995
120	NC_017285	TTG	2	6	9973	9978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448995
121	NC_017285	AGG	2	6	10026	10031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448995
122	NC_017285	CCA	2	6	10065	10070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448995
123	NC_017285	TGA	2	6	10178	10183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448995
124	NC_017285	AAG	2	6	10374	10379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448995
125	NC_017285	CTT	2	6	10756	10761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448996
126	NC_017285	TGA	2	6	10785	10790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448996
127	NC_017285	TTC	2	6	10796	10801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448996
128	NC_017285	AGG	2	6	10910	10915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384448996
129	NC_017285	TGG	2	6	10917	10922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448996
130	NC_017285	TTA	2	6	10951	10956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448996
131	NC_017285	AGA	2	6	11036	11041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448996
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255	NC_017285	TAT	2	6	20101	20106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449004
256	NC_017285	TTC	2	6	20142	20147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449004
257	NC_017285	ATG	2	6	20219	20224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384449004
258	NC_017285	TAT	2	6	20353	20358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449004
259	NC_017285	TTC	2	6	20390	20395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449004
260	NC_017285	TTA	2	6	20480	20485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449004
261	NC_017285	CTT	2	6	20534	20539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384449004
262	NC_017285	TCC	2	6	20655	20660	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384449004
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265	NC_017285	TAT	2	6	21080	21085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384449004
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