MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Chlamydophila pneumoniae LPCoLN chromosome

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017285	TA	3	6	19559	19564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017285	GA	3	6	24902	24907	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017285	AC	3	6	24950	24955	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017285	TA	3	6	33852	33857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017285	GA	3	6	44929	44934	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017285	AG	4	8	45202	45209	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017285	TA	3	6	54482	54487	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017285	TC	3	6	54697	54702	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_017285	AT	3	6	54710	54715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017285	TC	3	6	56607	56612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_017285	CT	3	6	56631	56636	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_017285	TA	5	10	61491	61500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017285	TG	3	6	66415	66420	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017285	AT	3	6	74414	74419	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017285	CT	3	6	79770	79775	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017285	TC	3	6	80784	80789	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017285	TC	3	6	80811	80816	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_017285	CT	3	6	84665	84670	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017285	GC	3	6	97056	97061	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_017285	AG	3	6	111783	111788	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017285	AG	3	6	112828	112833	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017285	AT	3	6	132748	132753	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017285	CT	3	6	133053	133058	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017285	AT	3	6	133139	133144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017285	GC	3	6	145401	145406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_017285	CT	3	6	149134	149139	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017285	CT	3	6	149216	149221	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_017285	AG	3	6	160176	160181	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017285	TC	3	6	161918	161923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_017285	AC	3	6	161947	161952	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_017285	TC	3	6	165396	165401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_017285	GA	4	8	170882	170889	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017285	TC	3	6	173702	173707	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_017285	TC	3	6	174438	174443	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_017285	AG	3	6	196454	196459	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017285	TC	3	6	196499	196504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_017285	TA	3	6	198102	198107	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017285	TC	4	8	198176	198183	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_017285	TA	3	6	204290	204295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017285	TC	3	6	205340	205345	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017285	AG	3	6	205491	205496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017285	CT	3	6	210591	210596	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017285	AG	3	6	210622	210627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017285	AG	3	6	211238	211243	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017285	GA	3	6	213207	213212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017285	GA	3	6	215151	215156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017285	GT	3	6	215191	215196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017285	CT	3	6	215228	215233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_017285	AT	3	6	220479	220484	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017285	TC	3	6	223550	223555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_017285	GA	3	6	223557	223562	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017285	AG	3	6	234472	234477	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017285	CT	3	6	234813	234818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_017285	AT	3	6	238223	238228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017285	TC	3	6	238328	238333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017285	GA	3	6	239924	239929	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017285	CT	3	6	241320	241325	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017285	TC	3	6	247501	247506	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_017285	AG	3	6	247580	247585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017285	AT	3	6	266662	266667	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017285	CT	3	6	267448	267453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017285	GA	3	6	271067	271072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017285	TC	3	6	271116	271121	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_017285	TA	3	6	274218	274223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017285	TC	3	6	296600	296605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_017285	TG	3	6	296792	296797	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017285	TA	3	6	297082	297087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017285	TC	3	6	297347	297352	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_017285	AG	3	6	297715	297720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017285	GA	3	6	298072	298077	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017285	AT	3	6	299075	299080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017285	AT	3	6	303099	303104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017285	GA	3	6	303132	303137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017285	TA	3	6	311542	311547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017285	CG	3	6	312006	312011	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
76	NC_017285	CT	3	6	312257	312262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017285	TG	3	6	312285	312290	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017285	GT	3	6	313010	313015	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017285	TG	4	8	313544	313551	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017285	AC	3	6	313656	313661	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_017285	CT	3	6	318556	318561	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_017285	AG	3	6	323221	323226	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017285	GA	3	6	323408	323413	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017285	TG	3	6	329701	329706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017285	TC	3	6	337338	337343	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_017285	GA	4	8	337360	337367	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017285	GA	3	6	337416	337421	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017285	GA	3	6	342165	342170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017285	GA	3	6	352507	352512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017285	GA	3	6	354737	354742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017285	GA	3	6	370460	370465	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017285	CT	3	6	373052	373057	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_017285	CT	3	6	377835	377840	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_017285	AG	3	6	377844	377849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017285	TG	3	6	378002	378007	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017285	TA	3	6	388653	388658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017285	AG	3	6	388727	388732	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017285	AT	3	6	395333	395338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017285	GA	3	6	396981	396986	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017285	TA	3	6	403565	403570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017285	TC	3	6	420562	420567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017285	GA	3	6	424568	424573	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017285	AG	3	6	425918	425923	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017285	CT	3	6	425975	425980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_017285	GA	3	6	425997	426002	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017285	GC	3	6	429958	429963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_017285	CA	3	6	430002	430007	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_017285	AT	3	6	430193	430198	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017285	AT	3	6	433179	433184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017285	AG	3	6	441379	441384	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017285	AC	3	6	441575	441580	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_017285	AG	4	8	442926	442933	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017285	GA	4	8	444378	444385	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017285	TC	3	6	449210	449215	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_017285	AG	3	6	450299	450304	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017285	TA	3	6	463833	463838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017285	TA	3	6	463902	463907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017285	TA	3	6	468039	468044	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017285	TA	3	6	486218	486223	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017285	GA	3	6	489656	489661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017285	TA	3	6	493973	493978	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017285	CT	3	6	494077	494082	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_017285	CT	3	6	494090	494095	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_017285	AG	3	6	505738	505743	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017285	CT	3	6	506411	506416	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_017285	GT	3	6	528243	528248	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017285	GT	3	6	528366	528371	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017285	TA	3	6	528409	528414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017285	AT	3	6	528631	528636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017285	TC	3	6	532095	532100	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017285	GT	3	6	540836	540841	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017285	AT	3	6	544372	544377	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017285	AG	3	6	544622	544627	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017285	TA	3	6	544659	544664	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017285	GA	3	6	547077	547082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017285	TG	3	6	547183	547188	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017285	TG	3	6	549235	549240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017285	TA	3	6	550019	550024	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017285	AG	4	8	550121	550128	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017285	CT	3	6	559866	559871	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017285	AG	3	6	562475	562480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017285	AT	3	6	562584	562589	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017285	GA	4	8	581891	581898	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017285	TA	3	6	582712	582717	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017285	AG	3	6	583722	583727	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017285	CT	3	6	589924	589929	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_017285	TC	3	6	590221	590226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_017285	TC	3	6	593940	593945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_017285	TA	3	6	594112	594117	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017285	CT	3	6	595530	595535	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
151	NC_017285	AG	3	6	597633	597638	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017285	TA	3	6	597724	597729	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017285	GA	3	6	601807	601812	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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327	NC_017285	AT	4	8	1240976	1240983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.