MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 plasmid pVir

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017284	CAAGGG	2	12	864	875	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	384448936
2	NC_017284	GACAAA	2	12	1560	1571	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384448936
3	NC_017284	AAATAA	2	12	2992	3003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384448938
4	NC_017284	AGAGAA	2	12	3032	3043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448938
5	NC_017284	ATTTGT	2	12	3388	3399	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384448939
6	NC_017284	TAAAAA	2	12	3501	3512	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384448939
7	NC_017284	TGAAGA	2	12	5324	5335	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384448941
8	NC_017284	TCATTT	2	12	6662	6673	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_017284	GGTAAG	2	12	7968	7979	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	384448944
10	NC_017284	TATAAT	2	12	11341	11352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017284	AACAAA	2	12	11353	11364	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_017284	GATTGC	2	12	13395	13406	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384448951
13	NC_017284	CTATAT	2	12	15596	15607	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384448956
14	NC_017284	GCTTTA	2	12	16808	16819	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384448958
15	NC_017284	GCTTAT	2	12	17669	17680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384448959
16	NC_017284	GTAAAA	2	12	17965	17976	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384448960
17	NC_017284	CCTTGT	2	12	17992	18003	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	384448960
18	NC_017284	TCTTTT	2	12	18013	18024	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384448960
19	NC_017284	CTTTGT	3	18	18679	18696	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017284	TTTATA	2	12	18880	18891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017284	TTTATT	2	12	18974	18985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017284	TATTTT	2	12	19686	19697	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017284	AGAAAC	2	12	19860	19871	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384448961
24	NC_017284	AGAAAA	2	12	19884	19895	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384448961
25	NC_017284	AAAAGA	2	12	20502	20513	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384448961
26	NC_017284	CAAGGA	2	12	20884	20895	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384448961
27	NC_017284	TTCAAA	2	12	21415	21426	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384448962
28	NC_017284	AAATGG	2	12	21713	21724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384448962
29	NC_017284	TCGGCT	2	12	22012	22023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384448963
30	NC_017284	TATAAT	2	12	25592	25603	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017284	AACAAA	2	12	25604	25615	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_017284	ACGCTT	2	12	25714	25725	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384448968
33	NC_017284	TAAAAG	2	12	27632	27643	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384448973
34	NC_017284	TATAAT	2	12	28814	28825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017284	AACAAA	2	12	28826	28837	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017284	ATATTG	2	12	29387	29398	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384448977
37	NC_017284	TATAAT	2	12	29749	29760	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017284	AACAAA	2	12	29761	29772	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017284	AAAATA	2	12	30039	30050	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384448978
40	NC_017284	TTTATA	2	12	31576	31587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017284	TAGAAA	2	12	31821	31832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384448982
42	NC_017284	AAGAAA	2	12	33590	33601	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384448983
43	NC_017284	TGATAT	2	12	36041	36052	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384448986

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.