MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 plasmid pVir

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017284	CAAAA	2	10	1725	1734	80 %	0 %	0 %	20 %	384448936
2	NC_017284	TTACC	2	10	3322	3331	20 %	40 %	0 %	40 %	384448939
3	NC_017284	AGCAC	2	10	3354	3363	40 %	0 %	20 %	40 %	384448939
4	NC_017284	AAATA	2	10	4828	4837	80 %	20 %	0 %	0 %	384448941
5	NC_017284	GTTTA	2	10	6420	6429	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017284	AACAA	2	10	7585	7594	80 %	0 %	0 %	20 %	384448943
7	NC_017284	GGTTT	2	10	7620	7629	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017284	TGTTT	2	10	8527	8536	0 %	80 %	20 %	0 %	384448945
9	NC_017284	AGCCA	2	10	10317	10326	40 %	0 %	20 %	40 %	384448946
10	NC_017284	GAATT	2	10	11385	11394	40 %	40 %	20 %	0 %	384448947
11	NC_017284	CAAAT	2	10	12120	12129	60 %	20 %	0 %	20 %	384448948
12	NC_017284	ATTTT	2	10	12372	12381	20 %	80 %	0 %	0 %	384448949
13	NC_017284	GCAAA	2	10	13037	13046	60 %	0 %	20 %	20 %	384448950
14	NC_017284	AGCAG	2	10	13128	13137	40 %	0 %	40 %	20 %	384448951
15	NC_017284	GAAAA	2	10	14553	14562	80 %	0 %	20 %	0 %	384448953
16	NC_017284	AAAAT	2	10	15775	15784	80 %	20 %	0 %	0 %	384448957
17	NC_017284	ACAAA	2	10	16132	16141	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_017284	TTTTG	2	10	16325	16334	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017284	ATTCT	2	10	16353	16362	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017284	TATAA	2	10	16385	16394	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017284	AAAAC	2	10	16735	16744	80 %	0 %	0 %	20 %	384448958
22	NC_017284	TCTTT	2	10	17938	17947	0 %	80 %	0 %	20 %	384448960
23	NC_017284	AAAAT	2	10	18764	18773	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017284	ATTTT	2	10	19303	19312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017284	TTTGT	2	10	19659	19668	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017284	AAAAG	2	10	20055	20064	80 %	0 %	20 %	0 %	384448961
27	NC_017284	AAATT	2	10	20551	20560	60 %	40 %	0 %	0 %	384448961
28	NC_017284	CTTTT	2	10	20928	20937	0 %	80 %	0 %	20 %	384448962
29	NC_017284	AATTC	2	10	21624	21633	40 %	40 %	0 %	20 %	384448962
30	NC_017284	TAGTT	2	10	22257	22266	20 %	60 %	20 %	0 %	384448963
31	NC_017284	AGCAG	2	10	23083	23092	40 %	0 %	40 %	20 %	384448964
32	NC_017284	TGATA	2	10	23543	23552	40 %	40 %	20 %	0 %	384448965
33	NC_017284	ACTTT	2	10	24228	24237	20 %	60 %	0 %	20 %	384448965
34	NC_017284	TATAT	2	10	26823	26832	40 %	60 %	0 %	0 %	384448971
35	NC_017284	TAGCC	2	10	27183	27192	20 %	20 %	20 %	40 %	384448972
36	NC_017284	AAAAT	2	10	27221	27230	80 %	20 %	0 %	0 %	384448972
37	NC_017284	AAATA	2	10	27425	27434	80 %	20 %	0 %	0 %	384448973
38	NC_017284	CAAAA	2	10	28228	28237	80 %	0 %	0 %	20 %	384448974
39	NC_017284	CAAAA	2	10	28410	28419	80 %	0 %	0 %	20 %	384448975
40	NC_017284	AATAA	2	10	28438	28447	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017284	TTAAA	2	10	29189	29198	60 %	40 %	0 %	0 %	384448976
42	NC_017284	ATTAA	2	10	29211	29220	60 %	40 %	0 %	0 %	384448976
43	NC_017284	AAAAT	2	10	29423	29432	80 %	20 %	0 %	0 %	384448977
44	NC_017284	TTAAG	2	10	29826	29835	40 %	40 %	20 %	0 %	384448978
45	NC_017284	AAACT	2	10	30456	30465	60 %	20 %	0 %	20 %	384448979
46	NC_017284	AATTT	2	10	31011	31020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017284	CTTTC	2	10	32468	32477	0 %	60 %	0 %	40 %	384448982
48	NC_017284	TATGA	2	10	33502	33511	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017284	AAAAT	2	10	33512	33521	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017284	AATAA	2	10	34662	34671	80 %	20 %	0 %	0 %	384448986
51	NC_017284	ATCTT	2	10	34850	34859	20 %	60 %	0 %	20 %	384448986
52	NC_017284	GAATT	2	10	34930	34939	40 %	40 %	20 %	0 %	384448986
53	NC_017284	AACAA	2	10	35088	35097	80 %	0 %	0 %	20 %	384448986
54	NC_017284	TATTT	2	10	35348	35357	20 %	80 %	0 %	0 %	384448986
55	NC_017284	AAAAG	2	10	35501	35510	80 %	0 %	20 %	0 %	384448986
56	NC_017284	TAATG	2	10	36929	36938	40 %	40 %	20 %	0 %	384448986

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.