MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 plasmid pVir

Total Repeats: 121

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017284	CGAT	2	8	461	468	25 %	25 %	25 %	25 %	384448935
2	NC_017284	CTTA	2	8	559	566	25 %	50 %	0 %	25 %	384448935
3	NC_017284	TACT	2	8	932	939	25 %	50 %	0 %	25 %	384448936
4	NC_017284	TACA	2	8	1350	1357	50 %	25 %	0 %	25 %	384448936
5	NC_017284	TTAA	2	8	1377	1384	50 %	50 %	0 %	0 %	384448936
6	NC_017284	TATG	2	8	1701	1708	25 %	50 %	25 %	0 %	384448936
7	NC_017284	AAGA	2	8	2133	2140	75 %	0 %	25 %	0 %	384448937
8	NC_017284	ATTT	2	8	2195	2202	25 %	75 %	0 %	0 %	384448937
9	NC_017284	AATC	2	8	2984	2991	50 %	25 %	0 %	25 %	384448938
10	NC_017284	CTTA	2	8	3131	3138	25 %	50 %	0 %	25 %	384448939
11	NC_017284	TCTT	2	8	3309	3316	0 %	75 %	0 %	25 %	384448939
12	NC_017284	ATAA	2	8	3703	3710	75 %	25 %	0 %	0 %	384448939
13	NC_017284	AATG	2	8	4448	4455	50 %	25 %	25 %	0 %	384448940
14	NC_017284	TTTA	2	8	4522	4529	25 %	75 %	0 %	0 %	384448941
15	NC_017284	ATTT	2	8	4918	4925	25 %	75 %	0 %	0 %	384448941
16	NC_017284	CAAG	2	8	5433	5440	50 %	0 %	25 %	25 %	384448941
17	NC_017284	TATG	2	8	5588	5595	25 %	50 %	25 %	0 %	384448941
18	NC_017284	TTTA	2	8	5657	5664	25 %	75 %	0 %	0 %	384448941
19	NC_017284	GAAT	2	8	5899	5906	50 %	25 %	25 %	0 %	384448941
20	NC_017284	ACAA	2	8	7208	7215	75 %	0 %	0 %	25 %	384448943
21	NC_017284	AAAG	2	8	7380	7387	75 %	0 %	25 %	0 %	384448943
22	NC_017284	TTTG	2	8	8714	8721	0 %	75 %	25 %	0 %	384448945
23	NC_017284	GAAT	2	8	9385	9392	50 %	25 %	25 %	0 %	384448946
24	NC_017284	TTAT	2	8	9467	9474	25 %	75 %	0 %	0 %	384448946
25	NC_017284	AATG	2	8	9674	9681	50 %	25 %	25 %	0 %	384448946
26	NC_017284	ATTT	2	8	10296	10303	25 %	75 %	0 %	0 %	384448946
27	NC_017284	AATT	2	8	10528	10535	50 %	50 %	0 %	0 %	384448946
28	NC_017284	AAAG	2	8	10566	10573	75 %	0 %	25 %	0 %	384448946
29	NC_017284	TAGA	2	8	10648	10655	50 %	25 %	25 %	0 %	384448946
30	NC_017284	TTTG	2	8	11511	11518	0 %	75 %	25 %	0 %	384448947
31	NC_017284	TTTA	2	8	11550	11557	25 %	75 %	0 %	0 %	384448947
32	NC_017284	AATA	2	8	11669	11676	75 %	25 %	0 %	0 %	384448947
33	NC_017284	TAAA	2	8	12218	12225	75 %	25 %	0 %	0 %	384448948
34	NC_017284	TATT	2	8	12266	12273	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017284	TAGT	2	8	12348	12355	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017284	TTTG	2	8	12654	12661	0 %	75 %	25 %	0 %	384448950
37	NC_017284	ATCA	2	8	12670	12677	50 %	25 %	0 %	25 %	384448950
38	NC_017284	GATT	2	8	12822	12829	25 %	50 %	25 %	0 %	384448950
39	NC_017284	AAAG	2	8	13335	13342	75 %	0 %	25 %	0 %	384448951
40	NC_017284	ATTT	2	8	13431	13438	25 %	75 %	0 %	0 %	384448951
41	NC_017284	TAAT	2	8	13512	13519	50 %	50 %	0 %	0 %	384448952
42	NC_017284	TTTA	2	8	13798	13805	25 %	75 %	0 %	0 %	384448952
43	NC_017284	ATTT	2	8	13833	13840	25 %	75 %	0 %	0 %	384448952
44	NC_017284	AGTA	2	8	13852	13859	50 %	25 %	25 %	0 %	384448952
45	NC_017284	ACGA	2	8	14050	14057	50 %	0 %	25 %	25 %	384448953
46	NC_017284	AAAG	2	8	14267	14274	75 %	0 %	25 %	0 %	384448953
47	NC_017284	ATTT	2	8	14281	14288	25 %	75 %	0 %	0 %	384448953
48	NC_017284	ATTC	2	8	14731	14738	25 %	50 %	0 %	25 %	384448954
49	NC_017284	ATTT	2	8	15036	15043	25 %	75 %	0 %	0 %	384448955
50	NC_017284	TATT	2	8	15201	15208	25 %	75 %	0 %	0 %	384448955
51	NC_017284	AAAC	2	8	15429	15436	75 %	0 %	0 %	25 %	384448956
52	NC_017284	ATCT	2	8	15548	15555	25 %	50 %	0 %	25 %	384448956
53	NC_017284	ATTA	2	8	15725	15732	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017284	ATAA	2	8	16430	16437	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017284	TATC	2	8	16515	16522	25 %	50 %	0 %	25 %	384448958
56	NC_017284	ATTC	2	8	16759	16766	25 %	50 %	0 %	25 %	384448958
57	NC_017284	TAAT	2	8	16938	16945	50 %	50 %	0 %	0 %	384448958
58	NC_017284	AAAG	2	8	17295	17302	75 %	0 %	25 %	0 %	384448959
59	NC_017284	TTTA	2	8	17713	17720	25 %	75 %	0 %	0 %	384448959
60	NC_017284	AGTT	2	8	17829	17836	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017284	AACT	2	8	17841	17848	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_017284	TATT	2	8	18214	18221	25 %	75 %	0 %	0 %	384448960
63	NC_017284	GAAA	2	8	18504	18511	75 %	0 %	25 %	0 %	384448960
64	NC_017284	TTAT	2	8	18649	18656	25 %	75 %	0 %	0 %	384448960
65	NC_017284	ACTT	2	8	18721	18728	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017284	ATTA	2	8	19283	19290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017284	TATT	2	8	19759	19766	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017284	AAAC	2	8	20809	20816	75 %	0 %	0 %	25 %	384448961
69	NC_017284	AATC	2	8	21134	21141	50 %	25 %	0 %	25 %	384448962
70	NC_017284	TCAA	2	8	21355	21362	50 %	25 %	0 %	25 %	384448962
71	NC_017284	TAAA	2	8	21478	21485	75 %	25 %	0 %	0 %	384448962
72	NC_017284	TAAA	2	8	22298	22305	75 %	25 %	0 %	0 %	384448963
73	NC_017284	AGTT	2	8	22599	22606	25 %	50 %	25 %	0 %	384448963
74	NC_017284	GAAA	2	8	22833	22840	75 %	0 %	25 %	0 %	384448964
75	NC_017284	CAAG	2	8	23162	23169	50 %	0 %	25 %	25 %	384448964
76	NC_017284	TACT	2	8	23527	23534	25 %	50 %	0 %	25 %	384448965
77	NC_017284	AGAC	2	8	23643	23650	50 %	0 %	25 %	25 %	384448965
78	NC_017284	AATT	2	8	24497	24504	50 %	50 %	0 %	0 %	384448965
79	NC_017284	TAAA	2	8	25175	25182	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017284	ATTT	2	8	25414	25421	25 %	75 %	0 %	0 %	384448967
81	NC_017284	ATAA	2	8	25538	25545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017284	GATT	2	8	26040	26047	25 %	50 %	25 %	0 %	384448969
83	NC_017284	TTTA	2	8	26093	26100	25 %	75 %	0 %	0 %	384448969
84	NC_017284	AAAT	2	8	26141	26148	75 %	25 %	0 %	0 %	384448969
85	NC_017284	TTAA	2	8	26287	26294	50 %	50 %	0 %	0 %	384448969
86	NC_017284	TTAT	2	8	26519	26526	25 %	75 %	0 %	0 %	384448970
87	NC_017284	TTTA	2	8	26811	26818	25 %	75 %	0 %	0 %	384448971
88	NC_017284	TTTG	2	8	27193	27200	0 %	75 %	25 %	0 %	384448972
89	NC_017284	ATTA	2	8	27252	27259	50 %	50 %	0 %	0 %	384448972
90	NC_017284	TATT	2	8	27362	27369	25 %	75 %	0 %	0 %	384448972
91	NC_017284	CTTG	2	8	27542	27549	0 %	50 %	25 %	25 %	384448973
92	NC_017284	AAAG	2	8	27669	27676	75 %	0 %	25 %	0 %	384448973
93	NC_017284	AAAC	2	8	28877	28884	75 %	0 %	0 %	25 %	384448976
94	NC_017284	TAAT	2	8	28937	28944	50 %	50 %	0 %	0 %	384448976
95	NC_017284	TTAG	2	8	28990	28997	25 %	50 %	25 %	0 %	384448976
96	NC_017284	ATTT	2	8	29024	29031	25 %	75 %	0 %	0 %	384448976
97	NC_017284	AAAT	2	8	29262	29269	75 %	25 %	0 %	0 %	384448977
98	NC_017284	ATAA	2	8	29589	29596	75 %	25 %	0 %	0 %	384448977
99	NC_017284	TTTG	2	8	29875	29882	0 %	75 %	25 %	0 %	384448978
100	NC_017284	AATA	2	8	30655	30662	75 %	25 %	0 %	0 %	384448979
101	NC_017284	ATAA	2	8	30945	30952	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017284	ATAG	2	8	31281	31288	50 %	25 %	25 %	0 %	384448981
103	NC_017284	TAAT	2	8	31700	31707	50 %	50 %	0 %	0 %	384448982
104	NC_017284	CTTT	2	8	31997	32004	0 %	75 %	0 %	25 %	384448982
105	NC_017284	TTTA	2	8	32221	32228	25 %	75 %	0 %	0 %	384448982
106	NC_017284	TCTA	2	8	32563	32570	25 %	50 %	0 %	25 %	384448982
107	NC_017284	TTTA	2	8	32716	32723	25 %	75 %	0 %	0 %	384448982
108	NC_017284	TGCT	2	8	33058	33065	0 %	50 %	25 %	25 %	384448982
109	NC_017284	TCAA	2	8	33602	33609	50 %	25 %	0 %	25 %	384448983
110	NC_017284	TATT	2	8	33702	33709	25 %	75 %	0 %	0 %	384448983
111	NC_017284	AACT	2	8	33890	33897	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_017284	TAAT	2	8	34151	34158	50 %	50 %	0 %	0 %	384448984
113	NC_017284	GAAA	3	12	34627	34638	75 %	0 %	25 %	0 %	384448986
114	NC_017284	ACTT	2	8	35025	35032	25 %	50 %	0 %	25 %	384448986
115	NC_017284	AAAG	2	8	35127	35134	75 %	0 %	25 %	0 %	384448986
116	NC_017284	GAAA	2	8	35358	35365	75 %	0 %	25 %	0 %	384448986
117	NC_017284	AAAC	2	8	35671	35678	75 %	0 %	0 %	25 %	384448986
118	NC_017284	TAGC	2	8	35815	35822	25 %	25 %	25 %	25 %	384448986
119	NC_017284	GTAT	2	8	36076	36083	25 %	50 %	25 %	0 %	384448986
120	NC_017284	AATC	2	8	36855	36862	50 %	25 %	0 %	25 %	384448986
121	NC_017284	GTGC	2	8	37125	37132	0 %	25 %	50 %	25 %	384448987

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.