MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 plasmid pVir

Total Repeats: 428

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017284	ATT	2	6	79	84	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
2	NC_017284	AAG	2	6	146	151	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448935
3	NC_017284	TTA	2	6	241	246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
4	NC_017284	GAT	2	6	298	303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448935
5	NC_017284	TAA	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448935
6	NC_017284	ATT	2	6	531	536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
7	NC_017284	ATT	2	6	625	630	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448935
8	NC_017284	TAA	2	6	645	650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448935
9	NC_017284	ACA	2	6	654	659	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448935
10	NC_017284	ACA	2	6	739	744	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448936
11	NC_017284	AAT	2	6	819	824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448936
12	NC_017284	AGA	2	6	1193	1198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448936
13	NC_017284	CTT	2	6	1255	1260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448936
14	NC_017284	CTT	2	6	1336	1341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448936
15	NC_017284	ATT	2	6	1411	1416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448936
16	NC_017284	AAG	2	6	1426	1431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448936
17	NC_017284	CGA	2	6	1499	1504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384448936
18	NC_017284	TTA	2	6	1510	1515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448936
19	NC_017284	GAA	2	6	1518	1523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448936
20	NC_017284	CAA	2	6	1792	1797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
21	NC_017284	AGA	2	6	1807	1812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
22	NC_017284	GAA	2	6	1832	1837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
23	NC_017284	AGA	2	6	1894	1899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
24	NC_017284	GAA	2	6	1982	1987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
25	NC_017284	GAA	2	6	2003	2008	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
26	NC_017284	GAA	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
27	NC_017284	ATA	3	9	2028	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
28	NC_017284	GAA	2	6	2057	2062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
29	NC_017284	TCA	2	6	2110	2115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448937
30	NC_017284	ATA	2	6	2118	2123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
31	NC_017284	TCA	2	6	2154	2159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448937
32	NC_017284	TTC	2	6	2212	2217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448937
33	NC_017284	CAA	2	6	2265	2270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
34	NC_017284	ACA	2	6	2454	2459	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
35	NC_017284	ATT	2	6	2498	2503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448937
36	NC_017284	ATA	2	6	2550	2555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
37	NC_017284	TAA	3	9	2584	2592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
38	NC_017284	CTT	2	6	2648	2653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448937
39	NC_017284	ATA	2	6	2676	2681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448937
40	NC_017284	AAG	2	6	2691	2696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448937
41	NC_017284	GAT	2	6	2735	2740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448937
42	NC_017284	CAA	3	9	2747	2755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
43	NC_017284	CAA	2	6	2769	2774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
44	NC_017284	AAC	2	6	2843	2848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448937
45	NC_017284	GAA	2	6	2934	2939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448938
46	NC_017284	AGA	3	9	2957	2965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448938
47	NC_017284	ATA	2	6	3107	3112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448939
48	NC_017284	TAA	2	6	3165	3170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448939
49	NC_017284	ATG	2	6	3218	3223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448939
50	NC_017284	AGA	2	6	3669	3674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448939
51	NC_017284	ATT	2	6	3735	3740	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
52	NC_017284	AGA	2	6	3837	3842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448939
53	NC_017284	TAT	2	6	3855	3860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
54	NC_017284	ATT	2	6	3868	3873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
55	NC_017284	ATA	2	6	3899	3904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448939
56	NC_017284	TAT	2	6	3942	3947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
57	NC_017284	ATT	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448939
58	NC_017284	TTA	2	6	4133	4138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448940
59	NC_017284	AAT	2	6	4192	4197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448940
60	NC_017284	AGA	2	6	4323	4328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448940
61	NC_017284	TGA	2	6	4419	4424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448940
62	NC_017284	GAA	2	6	4438	4443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448940
63	NC_017284	ATT	2	6	4503	4508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
64	NC_017284	AAT	2	6	4514	4519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
65	NC_017284	ATT	2	6	4542	4547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
66	NC_017284	TTA	2	6	4560	4565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
67	NC_017284	GAA	2	6	4752	4757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
68	NC_017284	ATA	2	6	4812	4817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
69	NC_017284	TGG	2	6	4867	4872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448941
70	NC_017284	CAC	2	6	4876	4881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384448941
71	NC_017284	TAA	2	6	5006	5011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
72	NC_017284	TAT	2	6	5020	5025	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
73	NC_017284	ATA	3	9	5041	5049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
74	NC_017284	ATG	2	6	5106	5111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448941
75	NC_017284	AAG	2	6	5161	5166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
76	NC_017284	ATT	2	6	5278	5283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
77	NC_017284	GAA	2	6	5298	5303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
78	NC_017284	ATG	2	6	5401	5406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448941
79	NC_017284	TGA	2	6	5414	5419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448941
80	NC_017284	TTA	2	6	5718	5723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
81	NC_017284	GAT	2	6	5850	5855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448941
82	NC_017284	ATT	2	6	5862	5867	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448941
83	NC_017284	CAT	3	9	5965	5973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448941
84	NC_017284	TAA	2	6	6002	6007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
85	NC_017284	AAG	2	6	6019	6024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
86	NC_017284	AGA	2	6	6068	6073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
87	NC_017284	TAA	2	6	6137	6142	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
88	NC_017284	AGA	2	6	6176	6181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
89	NC_017284	TAA	2	6	6182	6187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
90	NC_017284	ATG	2	6	6235	6240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448941
91	NC_017284	TAA	2	6	6245	6250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448941
92	NC_017284	TGA	2	6	6251	6256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448941
93	NC_017284	GAA	2	6	6327	6332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448941
94	NC_017284	AGA	2	6	6501	6506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448942
95	NC_017284	AGA	2	6	6564	6569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448942
96	NC_017284	AGA	2	6	6591	6596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448942
97	NC_017284	TCT	2	6	6640	6645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448942
98	NC_017284	AAG	2	6	6769	6774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448943
99	NC_017284	AAG	2	6	6821	6826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448943
100	NC_017284	GAA	2	6	6831	6836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448943
101	NC_017284	ATT	2	6	6870	6875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448943
102	NC_017284	TGA	2	6	7094	7099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448943
103	NC_017284	AAG	2	6	7132	7137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448943
104	NC_017284	AAT	2	6	7458	7463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448943
105	NC_017284	CAA	2	6	7496	7501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384448943
106	NC_017284	CTT	2	6	7502	7507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448943
107	NC_017284	ATT	2	6	7531	7536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448943
108	NC_017284	GAA	2	6	7833	7838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448944
109	NC_017284	AGA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448944
110	NC_017284	GAA	2	6	7896	7901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448944
111	NC_017284	ATT	2	6	8013	8018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448944
112	NC_017284	ATA	2	6	8056	8061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448945
113	NC_017284	TAT	2	6	8168	8173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448945
114	NC_017284	ATG	2	6	8299	8304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448945
115	NC_017284	CGC	2	6	8501	8506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	384448945
116	NC_017284	TAT	2	6	8585	8590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448945
117	NC_017284	ATT	2	6	8616	8621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448945
118	NC_017284	TCT	2	6	8861	8866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384448945
119	NC_017284	TGG	3	9	8918	8926	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448945
120	NC_017284	CTA	2	6	8968	8973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448945
121	NC_017284	ATT	3	9	9219	9227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384448946
122	NC_017284	TAA	2	6	9239	9244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448946
123	NC_017284	CTA	2	6	9286	9291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384448946
124	NC_017284	TGG	2	6	9637	9642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384448946
125	NC_017284	TAA	2	6	9668	9673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448946
126	NC_017284	TTG	2	6	9730	9735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448946
127	NC_017284	GAT	2	6	9768	9773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448946
128	NC_017284	AAT	2	6	9774	9779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448946
129	NC_017284	AAT	2	6	9840	9845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448946
130	NC_017284	AGA	2	6	9866	9871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448946
131	NC_017284	TAA	2	6	9992	9997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384448946
132	NC_017284	AGA	2	6	10253	10258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384448946
133	NC_017284	TGA	3	9	10268	10276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384448946
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.