MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 plasmid pVir

Total Repeats: 54

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017284	GA	3	6	49	54	50 %	0 %	50 %	0 %	384448935
2	NC_017284	GA	3	6	307	312	50 %	0 %	50 %	0 %	384448935
3	NC_017284	TG	3	6	345	350	0 %	50 %	50 %	0 %	384448935
4	NC_017284	AT	3	6	1851	1856	50 %	50 %	0 %	0 %	384448937
5	NC_017284	AT	4	8	2382	2389	50 %	50 %	0 %	0 %	384448937
6	NC_017284	GA	3	6	2491	2496	50 %	0 %	50 %	0 %	384448937
7	NC_017284	TA	3	6	3626	3631	50 %	50 %	0 %	0 %	384448939
8	NC_017284	AT	3	6	5620	5625	50 %	50 %	0 %	0 %	384448941
9	NC_017284	AT	3	6	6047	6052	50 %	50 %	0 %	0 %	384448941
10	NC_017284	AG	3	6	6444	6449	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017284	TA	3	6	8146	8151	50 %	50 %	0 %	0 %	384448945
12	NC_017284	TA	3	6	8547	8552	50 %	50 %	0 %	0 %	384448945
13	NC_017284	AT	3	6	10826	10831	50 %	50 %	0 %	0 %	384448946
14	NC_017284	AT	3	6	11953	11958	50 %	50 %	0 %	0 %	384448948
15	NC_017284	TA	3	6	12488	12493	50 %	50 %	0 %	0 %	384448949
16	NC_017284	TA	3	6	13243	13248	50 %	50 %	0 %	0 %	384448951
17	NC_017284	CA	3	6	13384	13389	50 %	0 %	0 %	50 %	384448951
18	NC_017284	TA	3	6	14348	14353	50 %	50 %	0 %	0 %	384448953
19	NC_017284	AG	3	6	14775	14780	50 %	0 %	50 %	0 %	384448954
20	NC_017284	TA	3	6	15015	15020	50 %	50 %	0 %	0 %	384448955
21	NC_017284	TG	4	8	15666	15673	0 %	50 %	50 %	0 %	384448956
22	NC_017284	TA	3	6	15939	15944	50 %	50 %	0 %	0 %	384448957
23	NC_017284	TA	3	6	16076	16081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017284	TA	3	6	16087	16092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017284	TA	3	6	16098	16103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017284	TA	3	6	16440	16445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017284	AT	3	6	17342	17347	50 %	50 %	0 %	0 %	384448959
28	NC_017284	AT	3	6	17815	17820	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017284	TA	3	6	18798	18803	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017284	AT	3	6	20748	20753	50 %	50 %	0 %	0 %	384448961
31	NC_017284	GA	3	6	21193	21198	50 %	0 %	50 %	0 %	384448962
32	NC_017284	AT	4	8	21676	21683	50 %	50 %	0 %	0 %	384448962
33	NC_017284	TA	3	6	21914	21919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017284	AG	3	6	22909	22914	50 %	0 %	50 %	0 %	384448964
35	NC_017284	AG	3	6	23091	23096	50 %	0 %	50 %	0 %	384448964
36	NC_017284	TC	3	6	23893	23898	0 %	50 %	0 %	50 %	384448965
37	NC_017284	CA	3	6	24038	24043	50 %	0 %	0 %	50 %	384448965
38	NC_017284	AG	3	6	24554	24559	50 %	0 %	50 %	0 %	384448965
39	NC_017284	TA	3	6	25559	25564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017284	GA	3	6	25689	25694	50 %	0 %	50 %	0 %	384448968
41	NC_017284	AG	3	6	25850	25855	50 %	0 %	50 %	0 %	384448968
42	NC_017284	GA	3	6	26385	26390	50 %	0 %	50 %	0 %	384448970
43	NC_017284	TA	3	6	27046	27051	50 %	50 %	0 %	0 %	384448972
44	NC_017284	TA	3	6	28362	28367	50 %	50 %	0 %	0 %	384448975
45	NC_017284	AG	3	6	28385	28390	50 %	0 %	50 %	0 %	384448975
46	NC_017284	TA	3	6	28781	28786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017284	TA	3	6	29716	29721	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017284	TA	3	6	30354	30359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017284	TA	3	6	30977	30982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017284	TA	3	6	31951	31956	50 %	50 %	0 %	0 %	384448982
51	NC_017284	GT	3	6	32756	32761	0 %	50 %	50 %	0 %	384448982
52	NC_017284	AT	3	6	33651	33656	50 %	50 %	0 %	0 %	384448983
53	NC_017284	AT	3	6	34655	34660	50 %	50 %	0 %	0 %	384448986
54	NC_017284	GA	3	6	36587	36592	50 %	0 %	50 %	0 %	384448986

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.