MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Brucella melitensis NI chromosome chromosome II

Total Repeats: 843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017283	GCGAA	2	10	288	297	40 %	0 %	40 %	20 %	384446172
2	NC_017283	CATGG	2	10	431	440	20 %	20 %	40 %	20 %	384446172
3	NC_017283	CCGCG	2	10	782	791	0 %	0 %	40 %	60 %	384446172
4	NC_017283	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017283	GGGAG	2	10	1695	1704	20 %	0 %	80 %	0 %	384446174
6	NC_017283	CTGCC	2	10	2165	2174	0 %	20 %	20 %	60 %	384446175
7	NC_017283	CAAGG	2	10	2499	2508	40 %	0 %	40 %	20 %	384446175
8	NC_017283	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017283	GCCGC	2	10	4378	4387	0 %	0 %	40 %	60 %	384446177
10	NC_017283	ACCGA	2	10	8475	8484	40 %	0 %	20 %	40 %	384446181
11	NC_017283	CGGCG	2	10	11682	11691	0 %	0 %	60 %	40 %	384446185
12	NC_017283	CCCCG	2	10	13861	13870	0 %	0 %	20 %	80 %	384446187
13	NC_017283	GCCGA	2	10	15067	15076	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017283	CATCA	2	10	15513	15522	40 %	20 %	0 %	40 %	384446188
15	NC_017283	AGGCG	2	10	18903	18912	20 %	0 %	60 %	20 %	384446192
16	NC_017283	GCCAT	2	10	19167	19176	20 %	20 %	20 %	40 %	384446193
17	NC_017283	TGAGG	2	10	19453	19462	20 %	20 %	60 %	0 %	384446193
18	NC_017283	GCTTC	2	10	19535	19544	0 %	40 %	20 %	40 %	384446193
19	NC_017283	AGCGG	2	10	22092	22101	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
20	NC_017283	GACCA	2	10	22150	22159	40 %	0 %	20 %	40 %	384446196
21	NC_017283	GCTTC	2	10	22885	22894	0 %	40 %	20 %	40 %	384446196
22	NC_017283	TCTCG	2	10	23166	23175	0 %	40 %	20 %	40 %	384446197
23	NC_017283	CGGCC	2	10	23880	23889	0 %	0 %	40 %	60 %	384446197
24	NC_017283	CGGCC	2	10	24368	24377	0 %	0 %	40 %	60 %	384446198
25	NC_017283	ATCCG	2	10	24815	24824	20 %	20 %	20 %	40 %	384446198
26	NC_017283	GGCGA	2	10	25169	25178	20 %	0 %	60 %	20 %	384446199
27	NC_017283	ACGGC	2	10	27200	27209	20 %	0 %	40 %	40 %	384446202
28	NC_017283	GCGCA	2	10	28307	28316	20 %	0 %	40 %	40 %	384446204
29	NC_017283	TCGGT	2	10	28524	28533	0 %	40 %	40 %	20 %	384446204
30	NC_017283	CCGCG	2	10	33715	33724	0 %	0 %	40 %	60 %	384446209
31	NC_017283	CTGCC	2	10	35746	35755	0 %	20 %	20 %	60 %	384446209
32	NC_017283	GGCCT	2	10	37484	37493	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
33	NC_017283	CGGAA	2	10	38774	38783	40 %	0 %	40 %	20 %	384446214
34	NC_017283	ATGAA	2	10	40055	40064	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017283	CATGC	2	10	41003	41012	20 %	20 %	20 %	40 %	384446216
36	NC_017283	TTTGT	2	10	41216	41225	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017283	GCGCC	2	10	41748	41757	0 %	0 %	40 %	60 %	384446217
38	NC_017283	CAGCG	2	10	42630	42639	20 %	0 %	40 %	40 %	384446218
39	NC_017283	CGCTC	2	10	43425	43434	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_017283	CGGCG	2	10	43529	43538	0 %	0 %	60 %	40 %	384446219
41	NC_017283	GCAAA	2	10	44116	44125	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017283	TGAAA	2	10	44281	44290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017283	TGCGC	2	10	48258	48267	0 %	20 %	40 %	40 %	384446222
44	NC_017283	CCGCT	2	10	50273	50282	0 %	20 %	20 %	60 %	384446222
45	NC_017283	GGTAA	2	10	51604	51613	40 %	20 %	40 %	0 %	384446223
46	NC_017283	CCGGC	2	10	52058	52067	0 %	0 %	40 %	60 %	384446223
47	NC_017283	CGGAA	2	10	52758	52767	40 %	0 %	40 %	20 %	384446223
48	NC_017283	GCCGT	2	10	55053	55062	0 %	20 %	40 %	40 %	384446225
49	NC_017283	CATTC	2	10	55302	55311	20 %	40 %	0 %	40 %	384446225
50	NC_017283	CTTCG	2	10	57180	57189	0 %	40 %	20 %	40 %	384446227
51	NC_017283	TTTGC	2	10	59132	59141	0 %	60 %	20 %	20 %	384446229
52	NC_017283	TGCCC	2	10	60529	60538	0 %	20 %	20 %	60 %	384446230
53	NC_017283	TGCGG	2	10	60767	60776	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017283	ATGCG	2	10	62470	62479	20 %	20 %	40 %	20 %	384446233
55	NC_017283	ATGTG	2	10	64308	64317	20 %	40 %	40 %	0 %	384446234
56	NC_017283	ATCGC	2	10	68478	68487	20 %	20 %	20 %	40 %	384446239
57	NC_017283	GACGG	2	10	68789	68798	20 %	0 %	60 %	20 %	384446239
58	NC_017283	TATCT	2	10	73004	73013	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017283	AGGGC	2	10	78373	78382	20 %	0 %	60 %	20 %	384446249
60	NC_017283	AATTC	2	10	78493	78502	40 %	40 %	0 %	20 %	384446249
61	NC_017283	TCGGT	2	10	81697	81706	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017283	TTCTC	2	10	81726	81735	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_017283	TCTGC	2	10	83081	83090	0 %	40 %	20 %	40 %	384446252
64	NC_017283	AGCCA	2	10	86818	86827	40 %	0 %	20 %	40 %	384446256
65	NC_017283	ACTTG	2	10	87255	87264	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_017283	GCCGG	2	10	93408	93417	0 %	0 %	60 %	40 %	384446264
67	NC_017283	TGCGG	2	10	93432	93441	0 %	20 %	60 %	20 %	384446264
68	NC_017283	ATGAA	2	10	93661	93670	60 %	20 %	20 %	0 %	384446264
69	NC_017283	CTTTC	2	10	94030	94039	0 %	60 %	0 %	40 %	384446265
70	NC_017283	GCAAT	2	10	94656	94665	40 %	20 %	20 %	20 %	384446265
71	NC_017283	CTTGC	2	10	94900	94909	0 %	40 %	20 %	40 %	384446266
72	NC_017283	GGAAT	2	10	95170	95179	40 %	20 %	40 %	0 %	384446266
73	NC_017283	GTAAT	2	10	95790	95799	40 %	40 %	20 %	0 %	384446267
74	NC_017283	AAGCG	2	10	96021	96030	40 %	0 %	40 %	20 %	384446267
75	NC_017283	CCGAG	2	10	96477	96486	20 %	0 %	40 %	40 %	384446267
76	NC_017283	CGGTA	2	10	97107	97116	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017283	CCAAG	2	10	97282	97291	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
78	NC_017283	TCGCT	2	10	97627	97636	0 %	40 %	20 %	40 %	384446268
79	NC_017283	ATGGC	2	10	98143	98152	20 %	20 %	40 %	20 %	384446268
80	NC_017283	GGTGT	2	10	99226	99235	0 %	40 %	60 %	0 %	384446269
81	NC_017283	TTCGC	2	10	99529	99538	0 %	40 %	20 %	40 %	384446269
82	NC_017283	GCTCT	2	10	99642	99651	0 %	40 %	20 %	40 %	384446269
83	NC_017283	ATGAG	2	10	99736	99745	40 %	20 %	40 %	0 %	384446269
84	NC_017283	GTTCC	2	10	99848	99857	0 %	40 %	20 %	40 %	384446269
85	NC_017283	TGCTG	2	10	100456	100465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017283	ATGAA	2	10	103369	103378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017283	CCGCT	2	10	103664	103673	0 %	20 %	20 %	60 %	384446273
88	NC_017283	CCGAT	2	10	103817	103826	20 %	20 %	20 %	40 %	384446273
89	NC_017283	TCCTT	2	10	106713	106722	0 %	60 %	0 %	40 %	384446275
90	NC_017283	GGCGA	2	10	107694	107703	20 %	0 %	60 %	20 %	384446277
91	NC_017283	CTTGC	2	10	107941	107950	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017283	CCTGC	2	10	112615	112624	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
93	NC_017283	CCGCG	2	10	113250	113259	0 %	0 %	40 %	60 %	384446282
94	NC_017283	CGGTG	2	10	114838	114847	0 %	20 %	60 %	20 %	384446283
95	NC_017283	GCCCG	2	10	115863	115872	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
96	NC_017283	GCACA	2	10	117154	117163	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017283	GTTCG	2	10	117175	117184	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
98	NC_017283	GCCAT	2	10	117785	117794	20 %	20 %	20 %	40 %	384446285
99	NC_017283	GAAAA	2	10	119107	119116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017283	CGATA	2	10	121261	121270	40 %	20 %	20 %	20 %	384446290
101	NC_017283	GCCCG	2	10	121675	121684	0 %	0 %	40 %	60 %	384446290
102	NC_017283	CATCG	2	10	125196	125205	20 %	20 %	20 %	40 %	384446295
103	NC_017283	CGCGG	2	10	127918	127927	0 %	0 %	60 %	40 %	384446298
104	NC_017283	AATCA	2	10	129039	129048	60 %	20 %	0 %	20 %	384446300
105	NC_017283	TGGGC	2	10	132725	132734	0 %	20 %	60 %	20 %	384446304
106	NC_017283	CAAGA	2	10	132837	132846	60 %	0 %	20 %	20 %	384446304
107	NC_017283	AGATA	2	10	134452	134461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017283	TGGGA	2	10	136113	136122	20 %	20 %	60 %	0 %	384446308
109	NC_017283	GGGCA	3	15	140692	140706	20 %	0 %	60 %	20 %	384446313
110	NC_017283	GCCGC	2	10	141558	141567	0 %	0 %	40 %	60 %	384446314
111	NC_017283	CCGCA	2	10	143209	143218	20 %	0 %	20 %	60 %	384446317
112	NC_017283	ATGAA	2	10	144260	144269	60 %	20 %	20 %	0 %	384446318
113	NC_017283	TTGGC	2	10	145090	145099	0 %	40 %	40 %	20 %	384446320
114	NC_017283	CGCAG	2	10	146721	146730	20 %	0 %	40 %	40 %	384446321
115	NC_017283	CCGGC	2	10	150103	150112	0 %	0 %	40 %	60 %	384446327
116	NC_017283	CGCAT	2	10	150181	150190	20 %	20 %	20 %	40 %	384446327
117	NC_017283	CTATA	2	10	151658	151667	40 %	40 %	0 %	20 %	384446329
118	NC_017283	CCGGG	2	10	152240	152249	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017283	GCTTT	2	10	152642	152651	0 %	60 %	20 %	20 %	384446330
120	NC_017283	CGCGG	2	10	152721	152730	0 %	0 %	60 %	40 %	384446330
121	NC_017283	GGGGC	2	10	156216	156225	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017283	CGGAT	2	10	159003	159012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017283	TGGGC	2	10	159134	159143	0 %	20 %	60 %	20 %	384446338
124	NC_017283	TGTTT	2	10	159587	159596	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017283	CCCGT	2	10	160312	160321	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_017283	AGCGG	2	10	162265	162274	20 %	0 %	60 %	20 %	384446342
127	NC_017283	GCCGC	2	10	164753	164762	0 %	0 %	40 %	60 %	384446344
128	NC_017283	GTGGC	2	10	165069	165078	0 %	20 %	60 %	20 %	384446344
129	NC_017283	GCCTG	2	10	165866	165875	0 %	20 %	40 %	40 %	384446345
130	NC_017283	AGGGC	2	10	169241	169250	20 %	0 %	60 %	20 %	384446349
131	NC_017283	GCCCG	2	10	170051	170060	0 %	0 %	40 %	60 %	384446350
132	NC_017283	GTTCG	2	10	171703	171712	0 %	40 %	40 %	20 %	384446351
133	NC_017283	GTCTC	2	10	171738	171747	0 %	40 %	20 %	40 %	384446351
134	NC_017283	GCCGA	2	10	174490	174499	20 %	0 %	40 %	40 %	384446354
135	NC_017283	GCCCC	2	10	174517	174526	0 %	0 %	20 %	80 %	384446354
136	NC_017283	CTTCA	2	10	179110	179119	20 %	40 %	0 %	40 %	384446359
137	NC_017283	TGACC	2	10	179379	179388	20 %	20 %	20 %	40 %	384446359
138	NC_017283	GCCTC	2	10	181647	181656	0 %	20 %	20 %	60 %	384446361
139	NC_017283	GGATA	2	10	187339	187348	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017283	GTGAA	2	10	189545	189554	40 %	20 %	40 %	0 %	384446367
141	NC_017283	GAAGA	2	10	189877	189886	60 %	0 %	40 %	0 %	384446367
142	NC_017283	GCCGC	2	10	190380	190389	0 %	0 %	40 %	60 %	384446367
143	NC_017283	TGACG	2	10	191085	191094	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
144	NC_017283	GATCA	2	10	192532	192541	40 %	20 %	20 %	20 %	384446369
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146	NC_017283	GTTCA	2	10	196573	196582	20 %	40 %	20 %	20 %	384446372
147	NC_017283	AGCAG	2	10	202885	202894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_017283	CGTGT	2	10	203167	203176	0 %	40 %	40 %	20 %	384446380
149	NC_017283	CGGCA	2	10	203584	203593	20 %	0 %	40 %	40 %	384446380
150	NC_017283	GGCGT	2	10	204371	204380	0 %	20 %	60 %	20 %	384446380
151	NC_017283	AGGGC	2	10	204531	204540	20 %	0 %	60 %	20 %	384446380
152	NC_017283	TTTTG	2	10	208467	208476	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017283	ATCAA	2	10	208635	208644	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_017283	TGAAA	2	10	208645	208654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
155	NC_017283	TGAAG	2	10	209091	209100	40 %	20 %	40 %	0 %	384446384
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169	NC_017283	GTCCT	2	10	224890	224899	0 %	40 %	20 %	40 %	384446399
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173	NC_017283	CATCG	2	10	233813	233822	20 %	20 %	20 %	40 %	384446410
174	NC_017283	GTCAA	2	10	234345	234354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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179	NC_017283	GCGCT	2	10	241583	241592	0 %	20 %	40 %	40 %	384446419
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263	NC_017283	CTGTT	2	10	373170	373179	0 %	60 %	20 %	20 %	384446544
264	NC_017283	TGGAG	2	10	375616	375625	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017283	GGCAA	2	10	375936	375945	40 %	0 %	40 %	20 %	384446546
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267	NC_017283	CCTGT	2	10	384038	384047	0 %	40 %	20 %	40 %	384446554
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269	NC_017283	CGCGG	2	10	387719	387728	0 %	0 %	60 %	40 %	384446557
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414	NC_017283	GCCTT	2	10	585928	585937	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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498	NC_017283	CCCTG	2	10	722980	722989	0 %	20 %	20 %	60 %	384446887
499	NC_017283	ATTAT	2	10	724108	724117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
500	NC_017283	CATGA	2	10	725623	725632	40 %	20 %	20 %	20 %	384446891

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