MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis NI chromosome chromosome II

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017283	ATTTC	2	10	1583	1592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017283	AAAAG	2	10	3050	3059	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017283	GCCGA	2	10	15067	15076	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_017283	AGCGG	2	10	22092	22101	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_017283	GGCCT	2	10	37484	37493	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017283	ATGAA	2	10	40055	40064	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017283	TTTGT	2	10	41216	41225	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017283	CGCTC	2	10	43425	43434	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_017283	GCAAA	2	10	44116	44125	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017283	TGAAA	2	10	44281	44290	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017283	TGCGG	2	10	60767	60776	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017283	TATCT	2	10	73004	73013	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017283	TCGGT	2	10	81697	81706	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017283	TTCTC	2	10	81726	81735	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017283	ACTTG	2	10	87255	87264	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017283	CGGTA	2	10	97107	97116	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017283	CCAAG	2	10	97282	97291	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
18	NC_017283	TGCTG	2	10	100456	100465	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_017283	ATGAA	2	10	103369	103378	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017283	CTTGC	2	10	107941	107950	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_017283	CCTGC	2	10	112615	112624	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_017283	GCCCG	2	10	115863	115872	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
23	NC_017283	GCACA	2	10	117154	117163	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_017283	GTTCG	2	10	117175	117184	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_017283	GAAAA	2	10	119107	119116	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017283	AGATA	2	10	134452	134461	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017283	CCGGG	2	10	152240	152249	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_017283	GGGGC	2	10	156216	156225	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
29	NC_017283	CGGAT	2	10	159003	159012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_017283	TGTTT	2	10	159587	159596	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017283	CCCGT	2	10	160312	160321	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_017283	GGATA	2	10	187339	187348	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017283	TGACG	2	10	191085	191094	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017283	AGCAG	2	10	202885	202894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_017283	TTTTG	2	10	208467	208476	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017283	ATCAA	2	10	208635	208644	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_017283	TGAAA	2	10	208645	208654	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017283	GTCAA	2	10	234345	234354	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_017283	GGCGG	2	10	286657	286666	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017283	GCTTT	2	10	303128	303137	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017283	GGTGG	2	10	338491	338500	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017283	TTTGT	2	10	345160	345169	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017283	GGCCG	2	10	349176	349185	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_017283	TGGAG	2	10	375616	375625	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017283	TGGAG	2	10	388609	388618	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017283	TCATA	2	10	389700	389709	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017283	AGCAA	2	10	396055	396064	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017283	CGGAA	2	10	422747	422756	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017283	GCGCC	2	10	427799	427808	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_017283	AAAGC	2	10	455030	455039	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017283	ACTGG	2	10	481915	481924	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017283	TTTGC	2	10	486408	486417	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017283	GTCTT	2	10	486753	486762	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_017283	CGGCC	2	10	490928	490937	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
55	NC_017283	ATTCG	2	10	500746	500755	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017283	TCGCA	2	10	510626	510635	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_017283	TCATT	2	10	518111	518120	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017283	AGCGG	2	10	551514	551523	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017283	ACAAA	2	10	553820	553829	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017283	ACAAA	2	10	577298	577307	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017283	TTTGC	2	10	577759	577768	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017283	GCAGA	2	10	584480	584489	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017283	GCCTT	2	10	585928	585937	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_017283	ACAAA	2	10	600825	600834	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_017283	GCGCC	2	10	616172	616181	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_017283	ACAAA	2	10	642822	642831	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017283	CGGGG	2	10	644952	644961	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017283	TAATC	2	10	674273	674282	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_017283	TTACG	2	10	679582	679591	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017283	TCAGG	2	10	690840	690849	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
71	NC_017283	CCGTG	2	10	708757	708766	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017283	ATTAT	2	10	724108	724117	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017283	TCAAA	2	10	748628	748637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_017283	CATCG	2	10	751987	751996	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_017283	ACAAA	2	10	752103	752112	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_017283	GATCG	2	10	760768	760777	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
77	NC_017283	TCCCC	2	10	760894	760903	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
78	NC_017283	TCCCC	2	10	762514	762523	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
79	NC_017283	GCAAT	2	10	763642	763651	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_017283	CATTC	2	10	774941	774950	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_017283	GCAGT	2	10	791007	791016	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017283	AGAGG	2	10	813883	813892	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017283	GTTAT	2	10	818957	818966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017283	GATCA	2	10	833048	833057	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017283	CAATT	2	10	839018	839027	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_017283	CGTAT	2	10	839029	839038	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017283	GAAAA	2	10	844203	844212	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017283	CCGGC	2	10	848697	848706	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
89	NC_017283	GGTTT	2	10	852153	852162	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017283	CATTC	2	10	859072	859081	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_017283	TGATA	2	10	859129	859138	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017283	CCCTC	2	10	881171	881180	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
93	NC_017283	ACAAA	2	10	891901	891910	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_017283	GGTGG	2	10	920349	920358	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017283	CATGG	2	10	924117	924126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_017283	CCGGG	5	25	924127	924151	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
97	NC_017283	GCCTC	2	10	924191	924200	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
98	NC_017283	GCCTG	2	10	924683	924692	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_017283	TTCAG	2	10	932279	932288	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017283	ATGCC	2	10	932291	932300	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_017283	GGAAC	2	10	933705	933714	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017283	AGGCC	2	10	938876	938885	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_017283	CCCTA	2	10	939734	939743	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
104	NC_017283	CCCTT	2	10	943497	943506	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
105	NC_017283	CCCCG	2	10	959263	959272	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
106	NC_017283	TAAAA	2	10	963308	963317	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017283	TCCCC	2	10	979281	979290	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
108	NC_017283	CATTG	2	10	981970	981979	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
109	NC_017283	CGCTT	2	10	1003918	1003927	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
110	NC_017283	CGCCT	2	10	1023257	1023266	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_017283	ATTAA	2	10	1024665	1024674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017283	AACCG	2	10	1026494	1026503	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_017283	TTTTC	2	10	1036440	1036449	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_017283	GTTGA	2	10	1042688	1042697	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017283	CTATT	2	10	1064610	1064619	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017283	GAAAG	2	10	1071176	1071185	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017283	TTCAA	2	10	1074935	1074944	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017283	CCTCT	2	10	1074953	1074962	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_017283	GCTGT	2	10	1076564	1076573	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_017283	CGAAG	2	10	1077377	1077386	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
121	NC_017283	AGCCC	2	10	1077931	1077940	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
122	NC_017283	CACGA	2	10	1078076	1078085	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
123	NC_017283	TTATT	2	10	1083875	1083884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017283	TGCGG	2	10	1105408	1105417	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017283	TTCTG	2	10	1120079	1120088	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017283	CAGGC	2	10	1123299	1123308	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017283	GGAAG	2	10	1152230	1152239	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017283	TGATT	2	10	1163718	1163727	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017283	AAAGC	2	10	1163742	1163751	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_017283	GCTTT	2	10	1163757	1163766	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017283	ACGGC	2	10	1164028	1164037	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.