MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Brucella melitensis NI chromosome chromosome II

Total Repeats: 397

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017283	GAAA	2	8	147	154	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017283	CGAT	2	8	8956	8963	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017283	TGAT	2	8	20644	20651	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017283	AAAC	2	8	27876	27883	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017283	CCTT	2	8	27900	27907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017283	GACA	2	8	30146	30153	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_017283	ATCT	2	8	31440	31447	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017283	TCAA	2	8	33114	33121	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_017283	GCCT	2	8	39221	39228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_017283	GTTC	2	8	43179	43186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017283	CATA	2	8	46395	46402	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017283	CTGT	2	8	46575	46582	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017283	GAAT	2	8	46680	46687	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017283	AAAC	2	8	54703	54710	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017283	ATGG	2	8	56073	56080	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017283	CCAG	2	8	62017	62024	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_017283	TGCT	2	8	66096	66103	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_017283	GCCG	2	8	69116	69123	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_017283	ATGA	2	8	69315	69322	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017283	GCTC	2	8	86423	86430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017283	GAAG	2	8	92163	92170	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017283	ATAA	2	8	96883	96890	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017283	AGGC	2	8	103348	103355	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017283	GATA	2	8	103410	103417	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017283	TCTT	2	8	112537	112544	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_017283	TGCC	2	8	112552	112559	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_017283	ATTT	2	8	129219	129226	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017283	TTAA	2	8	134400	134407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017283	ACGA	2	8	134498	134505	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_017283	TGAA	2	8	135070	135077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017283	ATAC	2	8	141918	141925	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_017283	CGGA	2	8	142062	142069	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_017283	TAGG	2	8	155389	155396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017283	GAAA	2	8	155788	155795	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017283	TTTC	2	8	158979	158986	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017283	GTTC	2	8	160414	160421	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017283	TGAA	2	8	160614	160621	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017283	ACGG	2	8	162645	162652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_017283	GGGC	2	8	162840	162847	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_017283	CACG	2	8	169922	169929	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017283	TTCC	2	8	170677	170684	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_017283	CAGG	2	8	170711	170718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017283	TCAA	2	8	174073	174080	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017283	GGCT	2	8	177566	177573	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_017283	TTGA	2	8	177680	177687	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017283	AGGC	2	8	178105	178112	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_017283	GCCT	2	8	178117	178124	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_017283	CGGG	2	8	178423	178430	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_017283	TATT	2	8	178533	178540	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017283	ATTC	2	8	183367	183374	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_017283	GGCT	2	8	186468	186475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_017283	TCGC	2	8	188662	188669	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_017283	GAAA	2	8	199155	199162	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017283	ATAG	2	8	211101	211108	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017283	TGCC	2	8	216403	216410	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_017283	GCCT	2	8	216942	216949	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_017283	CGGG	2	8	216971	216978	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
58	NC_017283	AAAT	2	8	220737	220744	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017283	CTGC	2	8	222201	222208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_017283	TCGA	2	8	224089	224096	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017283	GCCG	2	8	224113	224120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017283	CTGC	2	8	229368	229375	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_017283	CGGG	2	8	231370	231377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017283	TTTG	2	8	236947	236954	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017283	ACAG	2	8	238788	238795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017283	ATTG	2	8	239683	239690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017283	TGGG	2	8	240942	240949	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017283	AATT	2	8	244073	244080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017283	TGGA	2	8	244100	244107	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017283	GTTC	2	8	244230	244237	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_017283	AGTA	2	8	245417	245424	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017283	CCGG	2	8	245624	245631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017283	TCAA	2	8	253717	253724	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017283	ATTG	2	8	284777	284784	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017283	TCAT	2	8	286727	286734	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_017283	CTGT	2	8	286895	286902	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_017283	AGGC	2	8	293137	293144	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_017283	TTGT	2	8	293387	293394	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017283	CCTG	2	8	295665	295672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017283	CTAT	2	8	295688	295695	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_017283	CGGG	2	8	295935	295942	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017283	CAGT	2	8	296042	296049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_017283	GCTT	2	8	300186	300193	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_017283	GGCG	2	8	300203	300210	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017283	AATG	2	8	300241	300248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017283	AAAT	2	8	300580	300587	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017283	CCGG	2	8	300918	300925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_017283	GCGG	2	8	305249	305256	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017283	GCCG	2	8	308485	308492	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017283	TCCA	2	8	308722	308729	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_017283	AGGA	2	8	309243	309250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017283	TTTG	2	8	309883	309890	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017283	TTGG	2	8	315613	315620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017283	GGAG	2	8	315649	315656	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017283	TGTT	2	8	315687	315694	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017283	GCGG	2	8	320699	320706	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
97	NC_017283	TCCA	2	8	323174	323181	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_017283	CTTG	2	8	323374	323381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_017283	AATT	2	8	323459	323466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017283	GCTG	2	8	324461	324468	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_017283	CCAG	2	8	330441	330448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_017283	CATG	2	8	336346	336353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017283	CAGC	2	8	336366	336373	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_017283	GATG	2	8	341666	341673	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017283	CATT	2	8	351228	351235	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_017283	GGGC	2	8	352542	352549	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_017283	GGCG	2	8	353837	353844	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_017283	TCCT	2	8	366680	366687	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_017283	ATTA	2	8	373920	373927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017283	ATTT	2	8	378001	378008	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017283	AAAT	2	8	389537	389544	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017283	GAGC	2	8	394342	394349	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_017283	GGCA	2	8	398399	398406	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_017283	CTTT	2	8	405563	405570	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017283	GTAT	2	8	405702	405709	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017283	TTTG	2	8	408618	408625	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017283	AAGC	2	8	411769	411776	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017283	GACG	2	8	411797	411804	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017283	GCCT	2	8	413111	413118	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
120	NC_017283	AGCC	2	8	422908	422915	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017283	GGTT	2	8	424574	424581	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017283	ACTT	2	8	426553	426560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_017283	CTCC	2	8	427999	428006	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
124	NC_017283	GATA	2	8	428209	428216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017283	AATC	2	8	428297	428304	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017283	GATT	2	8	428305	428312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017283	GTCG	2	8	438700	438707	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_017283	GGGT	2	8	440909	440916	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017283	CAGC	2	8	441333	441340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_017283	GCAA	2	8	441448	441455	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
131	NC_017283	TCCC	2	8	441820	441827	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_017283	CCTC	2	8	445483	445490	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_017283	CCGC	2	8	445491	445498	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
134	NC_017283	GCCA	2	8	447954	447961	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_017283	AAAG	2	8	447971	447978	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017283	TGGC	2	8	449113	449120	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
137	NC_017283	AGCG	2	8	449138	449145	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_017283	AATC	2	8	454869	454876	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_017283	ATGG	2	8	454985	454992	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017283	CGGC	2	8	455061	455068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_017283	GATT	2	8	456955	456962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017283	GGAC	2	8	457136	457143	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_017283	ATGC	2	8	458639	458646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_017283	TGCT	2	8	458956	458963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017283	CAGG	2	8	465178	465185	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017283	ATGG	2	8	469447	469454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017283	CGAG	2	8	484287	484294	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_017283	TATG	2	8	484337	484344	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017283	GAAA	2	8	486647	486654	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017283	TCGG	2	8	486828	486835	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017283	AATT	2	8	489757	489764	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.