MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 19

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	CTAAAT	2	12	2704	2715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442306
2	NC_017282	TTTCTC	2	12	3106	3117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442307
3	NC_017282	CTCTTT	2	12	3849	3860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384442309
4	NC_017282	AAATTC	2	12	10329	10340	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384442316
5	NC_017282	GTCTTT	2	12	11361	11372	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384442317
6	NC_017282	TAAATA	2	12	13330	13341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442318
7	NC_017282	TTTATA	2	12	15626	15637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442321
8	NC_017282	AATTTT	2	12	16355	16366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384442323
9	NC_017282	AAATCA	2	12	17067	17078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384442323
10	NC_017282	CTTAAT	2	12	17091	17102	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384442323
11	NC_017282	CTACAT	2	12	17335	17346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384442323
12	NC_017282	ATCTTT	2	12	24373	24384	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384442332
13	NC_017282	TGGATT	2	12	29401	29412	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384442337
14	NC_017282	GAAGGA	2	12	29458	29469	50 %	0 %	50 %	0 %	384442337
15	NC_017282	AAAATT	2	12	33203	33214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384442342
16	NC_017282	ATAGAA	2	12	33259	33270	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384442342
17	NC_017282	TTTTCT	2	12	36191	36202	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384442347
18	NC_017282	AAAAAT	2	12	37761	37772	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384442349
19	NC_017282	ATTTTT	2	12	39154	39165	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384442353

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.