MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TGCTT	2	10	161	170	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_017282	GTAGC	2	10	1895	1904	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_017282	AGATA	2	10	4763	4772	60 %	20 %	20 %	0 %	384442310
4	NC_017282	CTGCT	2	10	5898	5907	0 %	40 %	20 %	40 %	384442311
5	NC_017282	CTTTC	2	10	6267	6276	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_017282	GCTTT	2	10	8191	8200	0 %	60 %	20 %	20 %	384442314
7	NC_017282	TTAAT	2	10	9605	9614	40 %	60 %	0 %	0 %	384442316
8	NC_017282	TATTT	2	10	9736	9745	20 %	80 %	0 %	0 %	384442316
9	NC_017282	GCTAT	2	10	10435	10444	20 %	40 %	20 %	20 %	384442316
10	NC_017282	ATTGC	2	10	10845	10854	20 %	40 %	20 %	20 %	384442317
11	NC_017282	TTGTT	2	10	10884	10893	0 %	80 %	20 %	0 %	384442317
12	NC_017282	ATTGC	2	10	11007	11016	20 %	40 %	20 %	20 %	384442317
13	NC_017282	TGTCA	2	10	11181	11190	20 %	40 %	20 %	20 %	384442317
14	NC_017282	ATTTT	2	10	11770	11779	20 %	80 %	0 %	0 %	384442317
15	NC_017282	TTTCA	2	10	13731	13740	20 %	60 %	0 %	20 %	384442319
16	NC_017282	AACGA	2	10	14667	14676	60 %	0 %	20 %	20 %	384442320
17	NC_017282	GCTTT	2	10	16263	16272	0 %	60 %	20 %	20 %	384442322
18	NC_017282	ATTCT	2	10	21249	21258	20 %	60 %	0 %	20 %	384442327
19	NC_017282	GCCAA	2	10	24388	24397	40 %	0 %	20 %	40 %	384442332
20	NC_017282	TTCTT	2	10	25281	25290	0 %	80 %	0 %	20 %	384442333
21	NC_017282	TAATT	2	10	29050	29059	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017282	TTTGT	2	10	29060	29069	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017282	GATTT	2	10	29434	29443	20 %	60 %	20 %	0 %	384442337
24	NC_017282	TTTAA	2	10	30843	30852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017282	TTTTA	2	10	33222	33231	20 %	80 %	0 %	0 %	384442342
26	NC_017282	AAGAG	2	10	33581	33590	60 %	0 %	40 %	0 %	384442343
27	NC_017282	TTTTA	2	10	33700	33709	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017282	GTTTT	2	10	35987	35996	0 %	80 %	20 %	0 %	384442347
29	NC_017282	TAAAT	2	10	36106	36115	60 %	40 %	0 %	0 %	384442347
30	NC_017282	AAATA	2	10	36667	36676	80 %	20 %	0 %	0 %	384442348
31	NC_017282	TTAAA	2	10	37724	37733	60 %	40 %	0 %	0 %	384442349
32	NC_017282	TTGAG	2	10	40263	40272	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017282	TTGCT	2	10	40948	40957	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017282	AATTG	2	10	42071	42080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017282	GTTTT	2	10	42392	42401	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.