MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TTGT	2	8	10	17	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017282	ATCT	2	8	240	247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_017282	TTTG	2	8	508	515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017282	ACTT	2	8	813	820	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_017282	AAAT	2	8	1483	1490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017282	ATTT	2	8	1866	1873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017282	ATCT	2	8	1959	1966	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_017282	AGAT	2	8	1979	1986	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017282	ATTG	2	8	2171	2178	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017282	ATTT	2	8	2181	2188	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017282	GTTC	2	8	2426	2433	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_017282	CTTT	2	8	3236	3243	0 %	75 %	0 %	25 %	384442307
13	NC_017282	AAAT	2	8	3525	3532	75 %	25 %	0 %	0 %	384442308
14	NC_017282	TTTA	2	8	3737	3744	25 %	75 %	0 %	0 %	384442308
15	NC_017282	TAAA	2	8	4514	4521	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
16	NC_017282	ATTT	2	8	4577	4584	25 %	75 %	0 %	0 %	384442310
17	NC_017282	ATAA	2	8	4736	4743	75 %	25 %	0 %	0 %	384442310
18	NC_017282	ATTA	2	8	5325	5332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017282	AATC	2	8	5510	5517	50 %	25 %	0 %	25 %	384442311
20	NC_017282	AAAT	2	8	5744	5751	75 %	25 %	0 %	0 %	384442311
21	NC_017282	CCTG	2	8	6016	6023	0 %	25 %	25 %	50 %	384442312
22	NC_017282	TCAT	2	8	6091	6098	25 %	50 %	0 %	25 %	384442312
23	NC_017282	ACCC	2	8	6380	6387	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_017282	AATC	2	8	6536	6543	50 %	25 %	0 %	25 %	384442313
25	NC_017282	TCCT	2	8	6594	6601	0 %	50 %	0 %	50 %	384442313
26	NC_017282	AAAT	2	8	6778	6785	75 %	25 %	0 %	0 %	384442314
27	NC_017282	GCTG	2	8	6795	6802	0 %	25 %	50 %	25 %	384442314
28	NC_017282	TCCA	2	8	7156	7163	25 %	25 %	0 %	50 %	384442314
29	NC_017282	GATT	2	8	7218	7225	25 %	50 %	25 %	0 %	384442314
30	NC_017282	ACAT	2	8	7746	7753	50 %	25 %	0 %	25 %	384442314
31	NC_017282	AATC	2	8	8224	8231	50 %	25 %	0 %	25 %	384442314
32	NC_017282	TTTA	2	8	8856	8863	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017282	TTTG	2	8	9156	9163	0 %	75 %	25 %	0 %	384442315
34	NC_017282	ATTT	2	8	9278	9285	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
35	NC_017282	TTAA	2	8	9580	9587	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
36	NC_017282	CTTT	2	8	9661	9668	0 %	75 %	0 %	25 %	384442316
37	NC_017282	ATTT	2	8	9902	9909	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
38	NC_017282	AATT	2	8	9917	9924	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
39	NC_017282	ATTT	2	8	10062	10069	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
40	NC_017282	ATTT	2	8	10248	10255	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
41	NC_017282	TATT	2	8	10591	10598	25 %	75 %	0 %	0 %	384442316
42	NC_017282	AAAT	2	8	10693	10700	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017282	TTGC	2	8	10876	10883	0 %	50 %	25 %	25 %	384442317
44	NC_017282	GTTT	2	8	11033	11040	0 %	75 %	25 %	0 %	384442317
45	NC_017282	TTAA	2	8	11218	11225	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
46	NC_017282	TACT	2	8	11270	11277	25 %	50 %	0 %	25 %	384442317
47	NC_017282	TTTG	2	8	11470	11477	0 %	75 %	25 %	0 %	384442317
48	NC_017282	AGAT	2	8	11528	11535	50 %	25 %	25 %	0 %	384442317
49	NC_017282	CTAT	2	8	11578	11585	25 %	50 %	0 %	25 %	384442317
50	NC_017282	AATT	2	8	12119	12126	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
51	NC_017282	CTAC	2	8	12328	12335	25 %	25 %	0 %	50 %	384442317
52	NC_017282	ATTA	2	8	12513	12520	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
53	NC_017282	CTTT	2	8	12670	12677	0 %	75 %	0 %	25 %	384442317
54	NC_017282	AATT	2	8	13084	13091	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
55	NC_017282	AAAT	2	8	13297	13304	75 %	25 %	0 %	0 %	384442318
56	NC_017282	AATT	2	8	13908	13915	50 %	50 %	0 %	0 %	384442319
57	NC_017282	CTTT	2	8	14172	14179	0 %	75 %	0 %	25 %	384442319
58	NC_017282	CCTT	2	8	14191	14198	0 %	50 %	0 %	50 %	384442319
59	NC_017282	TTGT	2	8	14218	14225	0 %	75 %	25 %	0 %	384442319
60	NC_017282	TTCA	2	8	14342	14349	25 %	50 %	0 %	25 %	384442320
61	NC_017282	CTTT	2	8	14491	14498	0 %	75 %	0 %	25 %	384442320
62	NC_017282	AATT	2	8	15122	15129	50 %	50 %	0 %	0 %	384442320
63	NC_017282	TTCA	2	8	15132	15139	25 %	50 %	0 %	25 %	384442320
64	NC_017282	CTTT	2	8	15233	15240	0 %	75 %	0 %	25 %	384442321
65	NC_017282	TCCA	2	8	15599	15606	25 %	25 %	0 %	50 %	384442321
66	NC_017282	AGTT	2	8	15915	15922	25 %	50 %	25 %	0 %	384442322
67	NC_017282	CTAC	2	8	16049	16056	25 %	25 %	0 %	50 %	384442322
68	NC_017282	CCTT	2	8	16755	16762	0 %	50 %	0 %	50 %	384442323
69	NC_017282	AAAT	2	8	16990	16997	75 %	25 %	0 %	0 %	384442323
70	NC_017282	ATAA	2	8	17398	17405	75 %	25 %	0 %	0 %	384442323
71	NC_017282	GTCT	2	8	17562	17569	0 %	50 %	25 %	25 %	384442323
72	NC_017282	AAAT	2	8	17813	17820	75 %	25 %	0 %	0 %	384442323
73	NC_017282	AAAG	2	8	17940	17947	75 %	0 %	25 %	0 %	384442323
74	NC_017282	TTTA	2	8	18029	18036	25 %	75 %	0 %	0 %	384442323
75	NC_017282	AAAT	2	8	18162	18169	75 %	25 %	0 %	0 %	384442324
76	NC_017282	TCTT	2	8	18695	18702	0 %	75 %	0 %	25 %	384442324
77	NC_017282	AAGA	2	8	18904	18911	75 %	0 %	25 %	0 %	384442324
78	NC_017282	ATCA	2	8	19236	19243	50 %	25 %	0 %	25 %	384442325
79	NC_017282	TATT	2	8	20312	20319	25 %	75 %	0 %	0 %	384442326
80	NC_017282	TTTA	2	8	20355	20362	25 %	75 %	0 %	0 %	384442326
81	NC_017282	CTTT	2	8	20497	20504	0 %	75 %	0 %	25 %	384442326
82	NC_017282	TTTA	2	8	20658	20665	25 %	75 %	0 %	0 %	384442326
83	NC_017282	GTTT	2	8	20829	20836	0 %	75 %	25 %	0 %	384442326
84	NC_017282	AGTA	2	8	21518	21525	50 %	25 %	25 %	0 %	384442327
85	NC_017282	AGTA	2	8	21707	21714	50 %	25 %	25 %	0 %	384442327
86	NC_017282	TCAT	2	8	21847	21854	25 %	50 %	0 %	25 %	384442327
87	NC_017282	TTTA	2	8	21861	21868	25 %	75 %	0 %	0 %	384442328
88	NC_017282	TGAT	2	8	21880	21887	25 %	50 %	25 %	0 %	384442328
89	NC_017282	ATCC	2	8	21892	21899	25 %	25 %	0 %	50 %	384442328
90	NC_017282	AATT	2	8	21987	21994	50 %	50 %	0 %	0 %	384442328
91	NC_017282	ATCC	2	8	22337	22344	25 %	25 %	0 %	50 %	384442329
92	NC_017282	TCCA	2	8	22714	22721	25 %	25 %	0 %	50 %	384442329
93	NC_017282	AAGT	2	8	22800	22807	50 %	25 %	25 %	0 %	384442329
94	NC_017282	GAAA	2	8	22974	22981	75 %	0 %	25 %	0 %	384442329
95	NC_017282	CTTT	2	8	23195	23202	0 %	75 %	0 %	25 %	384442330
96	NC_017282	TGAT	2	8	24089	24096	25 %	50 %	25 %	0 %	384442331
97	NC_017282	TGCA	2	8	24480	24487	25 %	25 %	25 %	25 %	384442332
98	NC_017282	TTAT	2	8	24752	24759	25 %	75 %	0 %	0 %	384442333
99	NC_017282	CTTT	2	8	25232	25239	0 %	75 %	0 %	25 %	384442333
100	NC_017282	ATAA	2	8	25506	25513	75 %	25 %	0 %	0 %	384442334
101	NC_017282	TATT	2	8	25534	25541	25 %	75 %	0 %	0 %	384442334
102	NC_017282	AAAT	2	8	26523	26530	75 %	25 %	0 %	0 %	384442335
103	NC_017282	TCTT	2	8	26685	26692	0 %	75 %	0 %	25 %	384442335
104	NC_017282	TAAA	2	8	26931	26938	75 %	25 %	0 %	0 %	384442335
105	NC_017282	TTTA	2	8	27102	27109	25 %	75 %	0 %	0 %	384442335
106	NC_017282	GATG	2	8	27246	27253	25 %	25 %	50 %	0 %	384442335
107	NC_017282	AATT	2	8	28350	28357	50 %	50 %	0 %	0 %	384442335
108	NC_017282	TTTA	2	8	29096	29103	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017282	TTTA	2	8	29343	29350	25 %	75 %	0 %	0 %	384442337
110	NC_017282	TGAT	2	8	29363	29370	25 %	50 %	25 %	0 %	384442337
111	NC_017282	AATT	2	8	29492	29499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017282	TAAT	2	8	30114	30121	50 %	50 %	0 %	0 %	384442339
113	NC_017282	TATC	2	8	30390	30397	25 %	50 %	0 %	25 %	384442339
114	NC_017282	ATCA	2	8	30619	30626	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_017282	AAGA	2	8	31033	31040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017282	TAAA	2	8	31556	31563	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017282	TCAT	2	8	31578	31585	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017282	CAAG	2	8	31783	31790	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017282	CGAA	2	8	31825	31832	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017282	TAAA	2	8	32695	32702	75 %	25 %	0 %	0 %	384442341
121	NC_017282	ATCC	2	8	32793	32800	25 %	25 %	0 %	50 %	384442341
122	NC_017282	AAAT	2	8	32896	32903	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017282	TTTC	2	8	33470	33477	0 %	75 %	0 %	25 %	384442343
124	NC_017282	AGCA	2	8	33930	33937	50 %	0 %	25 %	25 %	384442344
125	NC_017282	TTAT	2	8	34074	34081	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017282	TCAC	2	8	34243	34250	25 %	25 %	0 %	50 %	384442345
127	NC_017282	CCAT	2	8	35083	35090	25 %	25 %	0 %	50 %	384442345
128	NC_017282	ATTC	2	8	35433	35440	25 %	50 %	0 %	25 %	384442346
129	NC_017282	ATTA	2	8	35698	35705	50 %	50 %	0 %	0 %	384442346
130	NC_017282	TTTA	2	8	35863	35870	25 %	75 %	0 %	0 %	384442346
131	NC_017282	TTAT	2	8	36050	36057	25 %	75 %	0 %	0 %	384442347
132	NC_017282	ATTT	2	8	36133	36140	25 %	75 %	0 %	0 %	384442347
133	NC_017282	CTTT	2	8	36263	36270	0 %	75 %	0 %	25 %	384442347
134	NC_017282	AAAT	2	8	36643	36650	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
135	NC_017282	AAAT	2	8	36912	36919	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
136	NC_017282	TAAA	2	8	36930	36937	75 %	25 %	0 %	0 %	384442348
137	NC_017282	GATA	2	8	37303	37310	50 %	25 %	25 %	0 %	384442349
138	NC_017282	AAAT	2	8	37703	37710	75 %	25 %	0 %	0 %	384442349
139	NC_017282	AAAG	2	8	37985	37992	75 %	0 %	25 %	0 %	384442349
140	NC_017282	AAGA	2	8	38231	38238	75 %	0 %	25 %	0 %	384442349
141	NC_017282	GTTT	2	8	38489	38496	0 %	75 %	25 %	0 %	384442351
142	NC_017282	TAAT	2	8	38724	38731	50 %	50 %	0 %	0 %	384442351
143	NC_017282	TAAA	2	8	39041	39048	75 %	25 %	0 %	0 %	384442352
144	NC_017282	AAAT	2	8	39072	39079	75 %	25 %	0 %	0 %	384442352
145	NC_017282	TTGT	2	8	39116	39123	0 %	75 %	25 %	0 %	384442352
146	NC_017282	CATA	2	8	39713	39720	50 %	25 %	0 %	25 %	384442353
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148	NC_017282	TTCT	2	8	40450	40457	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_017282	TTTC	2	8	40542	40549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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151	NC_017282	TTTA	2	8	41420	41427	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.