MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TGT	2	6	37	42	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017282	ATT	2	6	109	114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017282	TCT	2	6	134	139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017282	CTT	2	6	153	158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017282	TCT	2	6	269	274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017282	CTT	2	6	348	353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017282	TTG	2	6	417	422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017282	CTT	2	6	447	452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017282	TCT	2	6	524	529	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017282	CTT	2	6	567	572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_017282	TCA	2	6	584	589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_017282	CTA	2	6	621	626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_017282	TTC	2	6	702	707	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017282	TCA	2	6	749	754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017282	ATT	2	6	781	786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017282	AAT	2	6	795	800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017282	TAA	2	6	869	874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017282	CAT	2	6	963	968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017282	ATT	2	6	1036	1041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017282	TCA	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017282	ATA	2	6	1187	1192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017282	GTA	2	6	1196	1201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017282	ATT	2	6	1231	1236	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017282	TAC	2	6	1324	1329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017282	AGC	2	6	1333	1338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017282	TCT	2	6	1346	1351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017282	AAT	2	6	1380	1385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017282	TTA	2	6	1400	1405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017282	GTA	2	6	1409	1414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017282	TAT	2	6	1506	1511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017282	CAT	2	6	1665	1670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017282	ATA	2	6	1712	1717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017282	TAA	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017282	TGA	2	6	1826	1831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017282	TCA	2	6	1988	1993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017282	CTT	3	9	2030	2038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017282	CAT	2	6	2046	2051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017282	TTG	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017282	TTG	2	6	2077	2082	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017282	CTT	2	6	2090	2095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017282	GCA	2	6	2096	2101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_017282	TCA	3	9	2117	2125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_017282	CTT	2	6	2243	2248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017282	TAT	2	6	2361	2366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017282	TGA	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017282	TTG	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017282	TCT	2	6	2489	2494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017282	TAA	2	6	3512	3517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017282	TAA	2	6	4887	4892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017282	TAT	2	6	5079	5084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017282	CTC	2	6	5260	5265	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017282	ATT	2	6	5302	5307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017282	TTA	2	6	5347	5352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017282	TTA	2	6	5364	5369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017282	TAG	2	6	5376	5381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017282	TTC	2	6	6240	6245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_017282	GAT	2	6	6446	6451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017282	TTA	2	6	8883	8888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017282	CCT	2	6	10617	10622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_017282	ATT	2	6	10672	10677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017282	TTA	2	6	10707	10712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017282	TAA	2	6	13598	13603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017282	ATA	3	9	13604	13612	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017282	TAT	2	6	29032	29037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017282	ATT	2	6	29082	29087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017282	TTA	2	6	29129	29134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017282	TAA	2	6	30524	30529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017282	ATC	2	6	30683	30688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_017282	TTA	2	6	30711	30716	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017282	TTA	2	6	30759	30764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017282	TCA	3	9	30774	30782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017282	TAA	2	6	31003	31008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017282	ATC	3	9	31022	31030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017282	TCT	2	6	31191	31196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017282	AAT	2	6	31264	31269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017282	TTA	2	6	31281	31286	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017282	ATG	2	6	31459	31464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017282	TAT	2	6	31498	31503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017282	CAG	2	6	31621	31626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017282	TCA	2	6	31701	31706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017282	ATT	3	9	31760	31768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017282	GGT	2	6	31796	31801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017282	TCT	2	6	31812	31817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017282	ATA	2	6	31860	31865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017282	TGA	2	6	31906	31911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017282	TAA	2	6	31914	31919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017282	ATT	2	6	31929	31934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017282	CTT	2	6	32075	32080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017282	TCT	2	6	32203	32208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_017282	CAT	2	6	32234	32239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017282	GCA	2	6	32934	32939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017282	CAA	2	6	32998	33003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017282	CTC	2	6	33017	33022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_017282	AAG	2	6	33305	33310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017282	TAA	2	6	33638	33643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017282	ATA	2	6	33694	33699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017282	TAT	2	6	34036	34041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017282	TAA	2	6	34046	34051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017282	TAT	2	6	36307	36312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017282	AGT	2	6	36318	36323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017282	TAA	2	6	36343	36348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017282	AAT	2	6	36370	36375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017282	AAG	2	6	38936	38941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017282	TTA	2	6	39891	39896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017282	GTC	2	6	39914	39919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017282	ATG	2	6	39931	39936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017282	ATG	2	6	39961	39966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017282	TCT	2	6	40059	40064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017282	TCT	2	6	40152	40157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017282	ACC	2	6	40319	40324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_017282	ATT	2	6	40395	40400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017282	AGT	2	6	40412	40417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017282	TCA	2	6	40509	40514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017282	TCA	3	9	40614	40622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017282	AGT	2	6	40710	40715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017282	ATT	2	6	40751	40756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017282	TCT	2	6	40791	40796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_017282	GTA	2	6	40825	40830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017282	GCA	2	6	40869	40874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017282	CAC	2	6	40882	40887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_017282	TCT	2	6	40896	40901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017282	CAT	2	6	40981	40986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_017282	CTT	2	6	41079	41084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017282	TCA	2	6	41352	41357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017282	TCT	3	9	41373	41381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_017282	TTC	2	6	41414	41419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017282	GTT	2	6	41473	41478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017282	ATC	2	6	41519	41524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_017282	TTA	2	6	41565	41570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017282	ATC	2	6	41588	41593	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017282	TAA	2	6	41605	41610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017282	ATC	2	6	41675	41680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017282	TTG	2	6	41681	41686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017282	ATA	2	6	41838	41843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017282	ATT	2	6	41846	41851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017282	TCA	2	6	42243	42248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017282	ATC	2	6	42386	42391	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_017282	TCT	2	6	42432	42437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_017282	ATG	2	6	42501	42506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017282	ATT	2	6	42515	42520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017282	TGT	2	6	42521	42526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017282	TAT	2	6	42550	42555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017282	ATC	2	6	42566	42571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_017282	TCA	2	6	42618	42623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_017282	TGA	2	6	42738	42743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017282	ATA	2	6	42750	42755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017282	TAA	2	6	43061	43066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017282	CAA	2	6	43076	43081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.