MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 plasmid pTet

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017282	TA	3	6	1276	1281	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017282	AT	3	6	1542	1547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017282	TC	3	6	2227	2232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017282	TC	3	6	2352	2357	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_017282	TA	3	6	2681	2686	50 %	50 %	0 %	0 %	384442306
6	NC_017282	TA	3	6	3495	3500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017282	TA	3	6	3646	3651	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
8	NC_017282	AT	3	6	3663	3668	50 %	50 %	0 %	0 %	384442308
9	NC_017282	GA	4	8	4991	4998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017282	TA	4	8	5284	5291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017282	TA	3	6	5294	5299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017282	AT	4	8	5333	5340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017282	AT	3	6	5544	5549	50 %	50 %	0 %	0 %	384442311
14	NC_017282	CT	3	6	5888	5893	0 %	50 %	0 %	50 %	384442311
15	NC_017282	TC	3	6	5925	5930	0 %	50 %	0 %	50 %	384442311
16	NC_017282	GA	3	6	6978	6983	50 %	0 %	50 %	0 %	384442314
17	NC_017282	AT	4	8	7371	7378	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
18	NC_017282	TA	4	8	7819	7826	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
19	NC_017282	AT	3	6	8064	8069	50 %	50 %	0 %	0 %	384442314
20	NC_017282	TA	3	6	9630	9635	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
21	NC_017282	AT	3	6	9795	9800	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
22	NC_017282	TA	3	6	10004	10009	50 %	50 %	0 %	0 %	384442316
23	NC_017282	TA	3	6	11280	11285	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
24	NC_017282	CT	3	6	11286	11291	0 %	50 %	0 %	50 %	384442317
25	NC_017282	TA	3	6	12819	12824	50 %	50 %	0 %	0 %	384442317
26	NC_017282	AT	3	6	13169	13174	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
27	NC_017282	TA	3	6	13351	13356	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
28	NC_017282	AT	3	6	13499	13504	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
29	NC_017282	TA	3	6	13543	13548	50 %	50 %	0 %	0 %	384442318
30	NC_017282	TA	3	6	14327	14332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017282	TA	3	6	14523	14528	50 %	50 %	0 %	0 %	384442320
32	NC_017282	TC	3	6	15289	15294	0 %	50 %	0 %	50 %	384442321
33	NC_017282	GA	3	6	15307	15312	50 %	0 %	50 %	0 %	384442321
34	NC_017282	CT	3	6	16700	16705	0 %	50 %	0 %	50 %	384442323
35	NC_017282	TA	3	6	17030	17035	50 %	50 %	0 %	0 %	384442323
36	NC_017282	TC	3	6	18131	18136	0 %	50 %	0 %	50 %	384442324
37	NC_017282	TA	3	6	18703	18708	50 %	50 %	0 %	0 %	384442324
38	NC_017282	TA	3	6	19689	19694	50 %	50 %	0 %	0 %	384442325
39	NC_017282	TG	3	6	20244	20249	0 %	50 %	50 %	0 %	384442325
40	NC_017282	GA	3	6	21580	21585	50 %	0 %	50 %	0 %	384442327
41	NC_017282	CT	3	6	24569	24574	0 %	50 %	0 %	50 %	384442332
42	NC_017282	AG	3	6	24614	24619	50 %	0 %	50 %	0 %	384442332
43	NC_017282	CT	3	6	24911	24916	0 %	50 %	0 %	50 %	384442333
44	NC_017282	AG	3	6	25648	25653	50 %	0 %	50 %	0 %	384442334
45	NC_017282	TA	4	8	25673	25680	50 %	50 %	0 %	0 %	384442334
46	NC_017282	TG	3	6	26033	26038	0 %	50 %	50 %	0 %	384442335
47	NC_017282	AT	3	6	26167	26172	50 %	50 %	0 %	0 %	384442335
48	NC_017282	TG	3	6	26821	26826	0 %	50 %	50 %	0 %	384442335
49	NC_017282	AT	3	6	26878	26883	50 %	50 %	0 %	0 %	384442335
50	NC_017282	TA	4	8	29349	29356	50 %	50 %	0 %	0 %	384442337
51	NC_017282	AT	3	6	29887	29892	50 %	50 %	0 %	0 %	384442339
52	NC_017282	TA	3	6	30574	30579	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017282	TA	3	6	30604	30609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017282	AT	3	6	30696	30701	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017282	AT	3	6	31065	31070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017282	GA	3	6	31231	31236	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017282	AT	3	6	31386	31391	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017282	TA	3	6	34052	34057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017282	TA	3	6	34068	34073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017282	AT	3	6	34080	34085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017282	TA	3	6	34492	34497	50 %	50 %	0 %	0 %	384442345
62	NC_017282	AT	3	6	35792	35797	50 %	50 %	0 %	0 %	384442346
63	NC_017282	AT	3	6	36175	36180	50 %	50 %	0 %	0 %	384442347
64	NC_017282	AT	3	6	36529	36534	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
65	NC_017282	AT	4	8	36867	36874	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
66	NC_017282	AT	3	6	36966	36971	50 %	50 %	0 %	0 %	384442348
67	NC_017282	TA	3	6	37376	37381	50 %	50 %	0 %	0 %	384442349
68	NC_017282	AG	3	6	38068	38073	50 %	0 %	50 %	0 %	384442349
69	NC_017282	GA	4	8	38149	38156	50 %	0 %	50 %	0 %	384442349
70	NC_017282	TA	3	6	38413	38418	50 %	50 %	0 %	0 %	384442350
71	NC_017282	TA	3	6	38838	38843	50 %	50 %	0 %	0 %	384442351
72	NC_017282	GA	3	6	39800	39805	50 %	0 %	50 %	0 %	384442353
73	NC_017282	TC	3	6	41037	41042	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_017282	TA	3	6	41317	41322	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017282	TG	3	6	41508	41513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017282	CA	3	6	41700	41705	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017282	AT	3	6	42129	42134	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017282	GT	3	6	42491	42496	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017282	TA	4	8	42775	42782	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.