MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017281	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017281	AATTTA	2	12	19228	19239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017281	TTTTAT	2	12	26411	26422	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017281	ATTTAT	2	12	39323	39334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017281	TTAAAT	2	12	138572	138583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017281	AAATAA	2	12	144572	144583	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017281	ATTTTT	2	12	163747	163758	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017281	ATATTA	2	12	170035	170046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017281	AATATT	2	12	170177	170188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017281	AAAATT	2	12	206253	206264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017281	TATTTT	2	12	206527	206538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017281	TTAATT	2	12	221409	221420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017281	TATATT	2	12	221978	221989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017281	AAAAAT	2	12	223388	223399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017281	CTTTAT	2	12	236987	236998	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_017281	TAAAAA	2	12	237355	237366	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017281	TATATT	2	12	240411	240422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017281	AAAATT	2	12	267236	267247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017281	AAAAAC	2	12	309580	309591	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_017281	TATTTT	2	12	363820	363831	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017281	TGTGTT	2	12	371251	371262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017281	ATTTAA	2	12	383997	384008	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017281	ATTTAT	2	12	396075	396086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017281	TTTATT	2	12	399928	399939	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017281	TAAGGA	2	12	413450	413461	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017281	TTTTAT	2	12	448609	448620	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017281	AATTTA	2	12	477829	477840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017281	AAAATA	2	12	494202	494213	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017281	TTTTAA	2	12	522765	522776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017281	TTTAGG	2	12	523030	523041	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017281	ATATTT	2	12	576298	576309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017281	TAATAG	2	12	617010	617021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017281	ATTTAA	2	12	625953	625964	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017281	TACAAA	2	12	628162	628173	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_017281	ATTGCT	2	12	633785	633796	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_017281	CTAATG	3	18	633849	633866	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017281	TTTATT	2	12	635997	636008	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017281	TAAATT	2	12	636066	636077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017281	TAAAAT	2	12	639444	639455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017281	ATTTTA	2	12	639596	639607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017281	ATTTTT	2	12	675014	675025	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017281	ATAATT	2	12	702492	702503	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017281	ATCTTT	2	12	720130	720141	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017281	TTAAAT	2	12	722075	722086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017281	AAATTT	2	12	723238	723249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017281	AATTTA	2	12	728680	728691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017281	ATTTAT	2	12	731549	731560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017281	TCTTAT	2	12	735376	735387	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_017281	TTAGCT	2	12	737253	737264	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017281	CTTCTA	2	12	737271	737282	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017281	AAATTT	2	12	801095	801106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017281	AATTTT	2	12	814393	814404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017281	AAATTA	2	12	842959	842970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017281	ACAAAG	2	12	856162	856173	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_017281	TTTTTA	2	12	858639	858650	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017281	AATTTT	2	12	885047	885058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017281	AATAAA	2	12	905034	905045	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017281	ATCTTA	2	12	934188	934199	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017281	ATCTTA	2	12	939222	939233	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017281	TATAAA	2	12	939480	939491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017281	ATCTTA	2	12	939506	939517	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_017281	TAAAAG	2	12	941503	941514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017281	TCAAAT	2	12	941933	941944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_017281	TGGAGA	2	12	942893	942904	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017281	ATTTTA	2	12	1059414	1059425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017281	CAATAC	2	12	1101761	1101772	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_017281	ATACAA	2	12	1101995	1102006	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017281	ATCATA	2	12	1103326	1103337	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017281	TTAATT	2	12	1152679	1152690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017281	TTAATT	2	12	1180666	1180677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017281	GCTATA	2	12	1183666	1183677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_017281	TTTGCT	2	12	1184106	1184117	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_017281	AATTTT	2	12	1215967	1215978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017281	TTTATT	2	12	1244731	1244742	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017281	AATTTA	2	12	1244760	1244771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017281	TTTGTA	2	12	1252850	1252861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017281	GCAAGG	2	12	1269420	1269431	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_017281	ATAAAA	2	12	1276019	1276030	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017281	TATGTA	2	12	1277221	1277232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017281	CAAATT	2	12	1311488	1311499	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_017281	TATAAA	2	12	1312051	1312062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017281	TAGAAA	2	12	1322509	1322520	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017281	ATATTT	2	12	1322539	1322550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017281	CTTTTA	2	12	1333936	1333947	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_017281	AATTTG	2	12	1351208	1351219	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017281	TTAATT	2	12	1380395	1380406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017281	AAATGA	2	12	1384309	1384320	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017281	AAAGAA	2	12	1384325	1384336	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017281	ATCGCC	2	12	1436118	1436129	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_017281	ACTAAA	2	12	1493567	1493578	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_017281	TTTCAT	2	12	1497802	1497813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_017281	CTTTGT	2	12	1500385	1500396	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_017281	AAAACT	2	12	1500534	1500545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_017281	TTTGAT	2	12	1501123	1501134	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017281	TATAAT	2	12	1502298	1502309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017281	TAAAAA	2	12	1569995	1570006	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017281	TTCTTT	2	12	1601664	1601675	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_017281	ATTTTT	2	12	1628367	1628378	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017281	TAAAAA	2	12	1665736	1665747	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017281	TAAAAT	2	12	1677839	1677850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017281	AAGCCT	2	12	1677942	1677953	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.