MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 1726

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017281	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	384442355
2	NC_017281	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	384442355
3	NC_017281	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	384442355
4	NC_017281	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	384442356
5	NC_017281	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	384442357
6	NC_017281	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	384442358
7	NC_017281	TTTTA	2	10	6525	6534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017281	TAAAA	2	10	6617	6626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017281	GTTTT	2	10	7485	7494	0 %	80 %	20 %	0 %	384442360
10	NC_017281	ATTTT	2	10	8702	8711	20 %	80 %	0 %	0 %	384442361
11	NC_017281	AAGAG	2	10	9734	9743	60 %	0 %	40 %	0 %	384442361
12	NC_017281	ACTTC	2	10	10396	10405	20 %	40 %	0 %	40 %	384442361
13	NC_017281	TCAAA	2	10	10958	10967	60 %	20 %	0 %	20 %	384442361
14	NC_017281	TGTGG	2	10	12786	12795	0 %	40 %	60 %	0 %	384442362
15	NC_017281	GACAA	2	10	13565	13574	60 %	0 %	20 %	20 %	384442362
16	NC_017281	CTTAA	2	10	14994	15003	40 %	40 %	0 %	20 %	384442365
17	NC_017281	CATTT	2	10	15544	15553	20 %	60 %	0 %	20 %	384442365
18	NC_017281	GCGAT	2	10	15814	15823	20 %	20 %	40 %	20 %	384442366
19	NC_017281	AAAAT	2	10	17915	17924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017281	TTTCA	2	10	18382	18391	20 %	60 %	0 %	20 %	384442369
21	NC_017281	AAGAT	2	10	19936	19945	60 %	20 %	20 %	0 %	384442370
22	NC_017281	ACCAA	2	10	21599	21608	60 %	0 %	0 %	40 %	384442372
23	NC_017281	AAAAT	2	10	21740	21749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017281	GTTAA	2	10	21767	21776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017281	AGATA	2	10	23524	23533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017281	TTTAT	2	10	25528	25537	20 %	80 %	0 %	0 %	384442376
27	NC_017281	TTCTT	2	10	26283	26292	0 %	80 %	0 %	20 %	384442376
28	NC_017281	AGATA	2	10	28041	28050	60 %	20 %	20 %	0 %	384442378
29	NC_017281	GCTTT	2	10	28555	28564	0 %	60 %	20 %	20 %	384442378
30	NC_017281	ATACT	2	10	29964	29973	40 %	40 %	0 %	20 %	384442378
31	NC_017281	AATCC	2	10	30415	30424	40 %	20 %	0 %	40 %	384442379
32	NC_017281	TGTTT	2	10	31402	31411	0 %	80 %	20 %	0 %	384442379
33	NC_017281	GCAAA	2	10	31469	31478	60 %	0 %	20 %	20 %	384442379
34	NC_017281	GAAAT	2	10	31887	31896	60 %	20 %	20 %	0 %	384442380
35	NC_017281	AAAGT	2	10	32371	32380	60 %	20 %	20 %	0 %	384442380
36	NC_017281	AAAAT	2	10	33623	33632	80 %	20 %	0 %	0 %	384442381
37	NC_017281	ATTAT	2	10	34368	34377	40 %	60 %	0 %	0 %	384442382
38	NC_017281	AAATC	2	10	35038	35047	60 %	20 %	0 %	20 %	384442382
39	NC_017281	TATAT	2	10	36860	36869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017281	TATAT	2	10	36873	36882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017281	CTTTT	2	10	37167	37176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_017281	GGTAA	2	10	37647	37656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017281	TCGTG	2	10	38443	38452	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017281	TCTTT	2	10	39469	39478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017281	TAACT	2	10	39483	39492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017281	CCGTA	2	10	41476	41485	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_017281	AAGAA	2	10	42920	42929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017281	AAAAT	2	10	43582	43591	80 %	20 %	0 %	0 %	384442384
49	NC_017281	TTGAC	2	10	45307	45316	20 %	40 %	20 %	20 %	384442385
50	NC_017281	AAGAA	2	10	46211	46220	80 %	0 %	20 %	0 %	384442385
51	NC_017281	ATGTT	2	10	46309	46318	20 %	60 %	20 %	0 %	384442385
52	NC_017281	GAAAT	2	10	47716	47725	60 %	20 %	20 %	0 %	384442385
53	NC_017281	AAAAG	2	10	48014	48023	80 %	0 %	20 %	0 %	384442385
54	NC_017281	AAAAT	2	10	48353	48362	80 %	20 %	0 %	0 %	384442386
55	NC_017281	GAAAA	2	10	49746	49755	80 %	0 %	20 %	0 %	384442387
56	NC_017281	GTTTA	2	10	49957	49966	20 %	60 %	20 %	0 %	384442387
57	NC_017281	AGCTT	2	10	50218	50227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017281	CAAAT	2	10	52268	52277	60 %	20 %	0 %	20 %	384442390
59	NC_017281	ACAAA	2	10	53296	53305	80 %	0 %	0 %	20 %	384442390
60	NC_017281	TACTC	2	10	54548	54557	20 %	40 %	0 %	40 %	384442391
61	NC_017281	GATAA	2	10	54946	54955	60 %	20 %	20 %	0 %	384442392
62	NC_017281	ACCGC	2	10	55864	55873	20 %	0 %	20 %	60 %	384442393
63	NC_017281	CTTTT	2	10	56030	56039	0 %	80 %	0 %	20 %	384442393
64	NC_017281	TTTCA	2	10	56277	56286	20 %	60 %	0 %	20 %	384442393
65	NC_017281	AAGAT	2	10	57669	57678	60 %	20 %	20 %	0 %	384442394
66	NC_017281	TAATG	2	10	57721	57730	40 %	40 %	20 %	0 %	384442394
67	NC_017281	GATAA	2	10	58046	58055	60 %	20 %	20 %	0 %	384442395
68	NC_017281	AAATT	2	10	58955	58964	60 %	40 %	0 %	0 %	384442395
69	NC_017281	CAATG	2	10	59338	59347	40 %	20 %	20 %	20 %	384442395
70	NC_017281	TACTA	2	10	60810	60819	40 %	40 %	0 %	20 %	384442397
71	NC_017281	TGCTT	2	10	61604	61613	0 %	60 %	20 %	20 %	384442397
72	NC_017281	AATAT	2	10	61789	61798	60 %	40 %	0 %	0 %	384442397
73	NC_017281	CATTT	2	10	62388	62397	20 %	60 %	0 %	20 %	384442398
74	NC_017281	AATTT	2	10	62402	62411	40 %	60 %	0 %	0 %	384442398
75	NC_017281	ATTTC	2	10	62504	62513	20 %	60 %	0 %	20 %	384442398
76	NC_017281	TGATT	2	10	62555	62564	20 %	60 %	20 %	0 %	384442398
77	NC_017281	TTTTA	2	10	62622	62631	20 %	80 %	0 %	0 %	384442398
78	NC_017281	GATAA	2	10	63556	63565	60 %	20 %	20 %	0 %	384442398
79	NC_017281	TCAAA	2	10	64107	64116	60 %	20 %	0 %	20 %	384442399
80	NC_017281	TGTGT	2	10	64602	64611	0 %	60 %	40 %	0 %	384442399
81	NC_017281	AATAA	2	10	64781	64790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017281	AAAAT	2	10	65837	65846	80 %	20 %	0 %	0 %	384442401
83	NC_017281	ATATT	2	10	68004	68013	40 %	60 %	0 %	0 %	384442407
84	NC_017281	TTTAT	2	10	68391	68400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017281	TCATC	2	10	70020	70029	20 %	40 %	0 %	40 %	384442410
86	NC_017281	CAAGA	2	10	70583	70592	60 %	0 %	20 %	20 %	384442411
87	NC_017281	GAGCA	2	10	70955	70964	40 %	0 %	40 %	20 %	384442411
88	NC_017281	ATCAA	2	10	71431	71440	60 %	20 %	0 %	20 %	384442412
89	NC_017281	CTCTT	2	10	74426	74435	0 %	60 %	0 %	40 %	384442416
90	NC_017281	TTTTC	2	10	74467	74476	0 %	80 %	0 %	20 %	384442416
91	NC_017281	TCTCT	2	10	74731	74740	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017281	ATCTC	2	10	75282	75291	20 %	40 %	0 %	40 %	384442417
93	NC_017281	GCCAA	2	10	75420	75429	40 %	0 %	20 %	40 %	384442417
94	NC_017281	TTTTG	2	10	76664	76673	0 %	80 %	20 %	0 %	384442418
95	NC_017281	TAAGG	2	10	81136	81145	40 %	20 %	40 %	0 %	384442423
96	NC_017281	ATTTT	2	10	81189	81198	20 %	80 %	0 %	0 %	384442423
97	NC_017281	ATAGG	2	10	81464	81473	40 %	20 %	40 %	0 %	384442424
98	NC_017281	AAAAT	2	10	81491	81500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017281	ATTTT	2	10	81501	81510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017281	TAAGA	2	10	81917	81926	60 %	20 %	20 %	0 %	384442425
101	NC_017281	TTAAT	2	10	82226	82235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017281	TATTT	2	10	82294	82303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017281	TATAA	2	10	82311	82320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017281	TAAAA	2	10	86088	86097	80 %	20 %	0 %	0 %	384442430
105	NC_017281	CAAAA	2	10	86621	86630	80 %	0 %	0 %	20 %	384442430
106	NC_017281	TTAAA	2	10	87054	87063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017281	TAAAA	2	10	89331	89340	80 %	20 %	0 %	0 %	384442433
108	NC_017281	GAAAT	2	10	90203	90212	60 %	20 %	20 %	0 %	384442435
109	NC_017281	TGGTT	2	10	90387	90396	0 %	60 %	40 %	0 %	384442435
110	NC_017281	TCCAT	2	10	91000	91009	20 %	40 %	0 %	40 %	384442435
111	NC_017281	TATTT	2	10	91547	91556	20 %	80 %	0 %	0 %	384442436
112	NC_017281	ATTTT	2	10	91908	91917	20 %	80 %	0 %	0 %	384442436
113	NC_017281	TTGGC	2	10	92421	92430	0 %	40 %	40 %	20 %	384442437
114	NC_017281	AAGAT	2	10	92508	92517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017281	GTAAA	2	10	93157	93166	60 %	20 %	20 %	0 %	384442438
116	NC_017281	AGAAT	2	10	93691	93700	60 %	20 %	20 %	0 %	384442439
117	NC_017281	TTAAA	2	10	94333	94342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017281	AAGAA	2	10	94373	94382	80 %	0 %	20 %	0 %	384442440
119	NC_017281	CCTTG	2	10	94814	94823	0 %	40 %	20 %	40 %	384442440
120	NC_017281	AGGTA	2	10	95330	95339	40 %	20 %	40 %	0 %	384442440
121	NC_017281	GTGCA	2	10	96989	96998	20 %	20 %	40 %	20 %	384442441
122	NC_017281	ACCTT	2	10	98098	98107	20 %	40 %	0 %	40 %	384442442
123	NC_017281	TATTT	2	10	98613	98622	20 %	80 %	0 %	0 %	384442443
124	NC_017281	TCAAA	2	10	98671	98680	60 %	20 %	0 %	20 %	384442443
125	NC_017281	TTAGA	2	10	98942	98951	40 %	40 %	20 %	0 %	384442443
126	NC_017281	GCTTT	2	10	99033	99042	0 %	60 %	20 %	20 %	384442444
127	NC_017281	GTTTA	2	10	99550	99559	20 %	60 %	20 %	0 %	384442444
128	NC_017281	TAAAA	2	10	99615	99624	80 %	20 %	0 %	0 %	384442444
129	NC_017281	AAATG	2	10	99801	99810	60 %	20 %	20 %	0 %	384442445
130	NC_017281	AGGCA	2	10	100437	100446	40 %	0 %	40 %	20 %	384442445
131	NC_017281	TAAAA	2	10	100800	100809	80 %	20 %	0 %	0 %	384442445
132	NC_017281	AAATT	2	10	101795	101804	60 %	40 %	0 %	0 %	384442446
133	NC_017281	AAAGC	2	10	102490	102499	60 %	0 %	20 %	20 %	384442447
134	NC_017281	AAGAA	2	10	103864	103873	80 %	0 %	20 %	0 %	384442449
135	NC_017281	ACTCA	2	10	106000	106009	40 %	20 %	0 %	40 %	384442452
136	NC_017281	TTTTG	2	10	109338	109347	0 %	80 %	20 %	0 %	384442457
137	NC_017281	ATTTC	2	10	111457	111466	20 %	60 %	0 %	20 %	384442459
138	NC_017281	CAAGA	2	10	112112	112121	60 %	0 %	20 %	20 %	384442459
139	NC_017281	AATGA	2	10	112781	112790	60 %	20 %	20 %	0 %	384442460
140	NC_017281	AAGAT	2	10	113823	113832	60 %	20 %	20 %	0 %	384442461
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