MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni S3 chromosome

Total Repeats: 236

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017281	TTTTA	2	10	6525	6534	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017281	TAAAA	2	10	6617	6626	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017281	AAAAT	2	10	17915	17924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017281	AAAAT	2	10	21740	21749	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017281	GTTAA	2	10	21767	21776	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017281	AGATA	2	10	23524	23533	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017281	TATAT	2	10	36860	36869	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017281	TATAT	2	10	36873	36882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017281	CTTTT	2	10	37167	37176	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017281	GGTAA	2	10	37647	37656	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017281	TCGTG	2	10	38443	38452	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017281	TCTTT	2	10	39469	39478	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017281	TAACT	2	10	39483	39492	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_017281	CCGTA	2	10	41476	41485	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_017281	AAGAA	2	10	42920	42929	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017281	AGCTT	2	10	50218	50227	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017281	AATAA	2	10	64781	64790	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017281	TTTAT	2	10	68391	68400	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017281	TCTCT	2	10	74731	74740	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_017281	AAAAT	2	10	81491	81500	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017281	ATTTT	2	10	81501	81510	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017281	TTAAT	2	10	82226	82235	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017281	TATTT	2	10	82294	82303	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017281	TATAA	2	10	82311	82320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017281	TTAAA	2	10	87054	87063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017281	AAGAT	2	10	92508	92517	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017281	TTAAA	2	10	94333	94342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017281	TTAAT	2	10	144594	144603	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017281	TATTT	2	10	150102	150111	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017281	TTTTA	2	10	163857	163866	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017281	TATTT	2	10	176587	176596	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017281	TAAAA	2	10	186779	186788	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017281	AAAAT	2	10	190947	190956	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017281	AAGTG	2	10	193832	193841	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017281	AGGAT	2	10	195017	195026	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017281	TAAAA	2	10	196375	196384	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017281	TAGAT	2	10	206042	206051	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017281	AAAAT	2	10	221494	221503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017281	AAATT	2	10	223325	223334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017281	TCTTT	2	10	223369	223378	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017281	ATTAA	2	10	224826	224835	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017281	TAAAT	2	10	225668	225677	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017281	CATAA	2	10	231250	231259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017281	AAAAT	2	10	234577	234586	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017281	AAACA	2	10	235349	235358	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_017281	AAGCA	2	10	236039	236048	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_017281	ATTAA	2	10	246912	246921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017281	TTAAT	2	10	248827	248836	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017281	ATAAA	2	10	267189	267198	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017281	TTAAA	2	10	299611	299620	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017281	ATTTG	2	10	301073	301082	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017281	TAGAG	2	10	306256	306265	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017281	AAATA	2	10	309625	309634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017281	TTTTA	2	10	320385	320394	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017281	ATTAA	2	10	336458	336467	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017281	ATTAA	2	10	338950	338959	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017281	TTATT	2	10	387655	387664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017281	ATTTT	2	10	388505	388514	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017281	CTTTT	2	10	393919	393928	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017281	GGTAA	2	10	394399	394408	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017281	TCGTG	2	10	395195	395204	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017281	TCTTT	2	10	396221	396230	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_017281	TAACT	2	10	396235	396244	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_017281	CCGTA	2	10	398228	398237	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_017281	AAGAA	2	10	399672	399681	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017281	CTTAT	2	10	405322	405331	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017281	TCAAA	2	10	412492	412501	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_017281	AAGGT	2	10	413488	413497	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017281	CAAAT	2	10	413979	413988	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_017281	TTGGT	2	10	414184	414193	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017281	ATAGA	2	10	414198	414207	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017281	GATGG	2	10	414465	414474	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017281	TAAAT	2	10	431136	431145	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017281	TTGCT	2	10	434496	434505	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_017281	TTTAT	2	10	457254	457263	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017281	GATTT	2	10	457777	457786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017281	TTTTA	2	10	465322	465331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017281	AAAAT	2	10	510244	510253	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017281	GTTTT	2	10	513319	513328	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017281	AAATA	2	10	513628	513637	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017281	CATTC	2	10	514345	514354	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
82	NC_017281	TTTTA	2	10	522635	522644	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017281	AAAAT	2	10	522669	522678	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017281	TGATA	2	10	522988	522997	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017281	GAGTT	2	10	523345	523354	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017281	ATGCA	2	10	523661	523670	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_017281	AATTA	2	10	525128	525137	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017281	ATCAA	2	10	529297	529306	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017281	GAAAT	2	10	530193	530202	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017281	TTTGA	2	10	538215	538224	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017281	ATTTG	2	10	539375	539384	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017281	TAAAA	2	10	553213	553222	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017281	GATAA	2	10	576364	576373	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017281	AATAA	2	10	585598	585607	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017281	GAAAA	2	10	597472	597481	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017281	TTTGC	2	10	600994	601003	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_017281	AATTA	2	10	617028	617037	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017281	TTTAA	2	10	626012	626021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017281	AGGAT	2	10	627613	627622	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017281	ATTTT	2	10	627938	627947	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017281	AGAAA	2	10	628656	628665	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017281	TTTTA	2	10	629757	629766	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017281	TTTTA	2	10	633334	633343	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017281	TTGTT	2	10	639136	639145	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017281	ATTTA	2	10	640297	640306	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017281	AAAAT	2	10	641380	641389	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017281	ATTTT	2	10	670433	670442	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017281	TTTTG	2	10	671596	671605	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017281	TTTGA	2	10	672966	672975	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017281	TAAAA	3	15	689210	689224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017281	ATAAA	2	10	690033	690042	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017281	ATTTA	2	10	691618	691627	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017281	TTTAA	2	10	698947	698956	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017281	GTTTC	2	10	701394	701403	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
115	NC_017281	TAAAA	2	10	722022	722031	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017281	AAAAT	2	10	722092	722101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017281	ATTTT	2	10	722113	722122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017281	ATTTT	2	10	722185	722194	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017281	AAAAT	2	10	723270	723279	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017281	AAATA	2	10	724456	724465	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017281	CTTTT	2	10	729393	729402	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_017281	GGTAA	2	10	729873	729882	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017281	TCGTG	2	10	730669	730678	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_017281	TCTTT	2	10	731695	731704	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_017281	TAACT	2	10	731709	731718	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_017281	CCGTA	2	10	733702	733711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_017281	AAGAA	2	10	735146	735155	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017281	TTAAT	2	10	735472	735481	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017281	TTTAT	2	10	735663	735672	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017281	GCAAA	2	10	736343	736352	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_017281	ATTTT	2	10	738038	738047	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017281	AATAA	2	10	744144	744153	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017281	ATTTA	2	10	746929	746938	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017281	TTTTC	2	10	777292	777301	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_017281	TTTTA	2	10	843139	843148	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017281	ATTCA	2	10	846147	846156	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017281	AGGTT	2	10	848168	848177	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017281	AAAAT	2	10	856234	856243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017281	ACTTT	2	10	885147	885156	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_017281	CTTGC	2	10	885390	885399	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
141	NC_017281	AGTAT	2	10	885798	885807	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017281	AAAAT	2	10	887120	887129	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017281	ATTTT	2	10	892784	892793	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017281	CTTAA	2	10	904930	904939	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_017281	TATAA	2	10	924490	924499	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017281	AAAAT	2	10	925041	925050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017281	TTAAT	2	10	937017	937026	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017281	AATTA	2	10	960896	960905	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.