MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 79

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017280	AATTTA	2	12	19355	19366	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017280	TTTTCT	2	12	21744	21755	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_017280	TTTTAT	2	12	26538	26549	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017280	TATTTA	2	12	39471	39482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017280	TTTATT	2	12	43284	43295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017280	AACCTA	2	12	156965	156976	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017280	ATTTTT	2	12	173047	173058	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017280	ATATTA	2	12	179334	179345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017280	AAATTT	2	12	208892	208903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017280	TATTTT	2	12	210889	210900	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017280	TTAATT	2	12	225771	225782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017280	TATATT	2	12	226344	226355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017280	AAAAAT	2	12	227753	227764	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017280	TGGTTT	2	12	229412	229423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017280	TATATT	2	12	242509	242520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017280	TATAAA	2	12	242646	242657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017280	TAAAAT	2	12	270604	270615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017280	ATTTAT	2	12	315089	315100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017280	TAAATT	2	12	339288	339299	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017280	TATTTT	2	12	363178	363189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017280	TGTGTT	2	12	370608	370619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017280	TTTTGT	2	12	386628	386639	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017280	TTAAAA	2	12	387685	387696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017280	TATTTA	2	12	395238	395249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017280	TTTATT	2	12	399052	399063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017280	ATTTTA	2	12	455270	455281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017280	TATAAA	2	12	457941	457952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017280	ATCTTA	2	12	457967	457978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_017280	AATTTA	2	12	472803	472814	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017280	AAAATA	2	12	489167	489178	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017280	TTTTAA	2	12	517751	517762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017280	TAATAG	2	12	608790	608801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017280	ATTTAA	2	12	617730	617741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017280	TTTATT	2	12	627880	627891	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017280	TAAATT	2	12	627949	627960	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017280	CTTAAA	2	12	636183	636194	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_017280	TTAAAA	2	12	637866	637877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017280	AAAAAT	2	12	640719	640730	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017280	ATTTTT	2	12	645102	645113	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017280	AAATAA	2	12	648586	648597	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017280	ATAATT	2	12	668714	668725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017280	TTAAAT	2	12	688285	688296	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017280	TATTTA	2	12	698444	698455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017280	TTTATT	2	12	702515	702526	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017280	TTATTT	2	12	703930	703941	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017280	AAATTT	2	12	768649	768660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017280	AATTTT	2	12	781946	781957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017280	AAATTA	2	12	810650	810661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017280	ACAAAG	2	12	824266	824277	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017280	TTTTTA	2	12	826740	826751	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017280	AATAAA	2	12	873136	873147	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017280	TCAAAT	2	12	879467	879478	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_017280	TAAAAA	2	12	879549	879560	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017280	ATCTTA	2	12	908273	908284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017280	ATTATA	2	12	911223	911234	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017280	TATAAA	2	12	913954	913965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017280	ATCTTA	2	12	913980	913991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_017280	ATTTTG	2	12	965340	965351	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017280	TTATAA	2	12	990406	990417	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017280	ATTTTA	2	12	1040531	1040542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017280	TTAATT	2	12	1143303	1143314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017280	AAATTT	2	12	1144300	1144311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017280	TTAATT	2	12	1171410	1171421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017280	CAAAAA	2	12	1303537	1303548	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017280	TTAATT	2	12	1312810	1312821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017280	ACTAAA	2	12	1428029	1428040	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017280	TATAAT	2	12	1436284	1436295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017280	CAAAAA	2	12	1462397	1462408	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_017280	TTTTTA	2	12	1466840	1466851	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017280	ATAAAA	2	12	1467701	1467712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017280	ATTTTT	2	12	1490441	1490452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017280	TTAATT	2	12	1490514	1490525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017280	TAAATT	2	12	1556774	1556785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017280	ATTTTT	2	12	1560075	1560086	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017280	TAAAAA	2	12	1604138	1604149	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017280	AGGAAT	2	12	1604506	1604517	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017280	TTAAAT	2	12	1613032	1613043	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017280	AAGCCT	2	12	1613164	1613175	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.