MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 997

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384440683
2	NC_017280	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440683
3	NC_017280	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384440684
4	NC_017280	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384440684
5	NC_017280	AATGAA	2	12	4478	4489	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384440684
6	NC_017280	ATGCTA	2	12	9430	9441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384440688
7	NC_017280	ATTTAA	2	12	10234	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	384440688
8	NC_017280	TTTTCA	2	12	15392	15403	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440692
9	NC_017280	ATGGGT	2	12	17170	17181	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384440693
10	NC_017280	TTCATT	2	12	18322	18333	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440695
11	NC_017280	AAGAAA	2	12	19535	19546	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384440696
12	NC_017280	AAGATA	2	12	20454	20465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384440697
13	NC_017280	AGCAAA	2	12	21237	21248	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384440697
14	NC_017280	TATAAG	2	12	26175	26186	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384440701
15	NC_017280	TTATGC	2	12	27600	27611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384440702
16	NC_017280	GAACTT	2	12	28085	28096	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384440703
17	NC_017280	CTTTAA	2	12	29847	29858	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384440703
18	NC_017280	CTATTT	2	12	29967	29978	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440703
19	NC_017280	ATGTGT	2	12	30661	30672	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384440704
20	NC_017280	TAGCTA	2	12	30762	30773	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384440704
21	NC_017280	CGCCAC	2	12	34040	34051	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	384440706
22	NC_017280	ATGGAT	2	12	34528	34539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440707
23	NC_017280	GAAATT	2	12	34737	34748	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384440707
24	NC_017280	GCTTTA	2	12	50296	50307	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384440712
25	NC_017280	CCTGTG	2	12	50971	50982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440712
26	NC_017280	ATTTTA	2	12	51019	51030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440712
27	NC_017280	TAAATT	2	12	57423	57434	50 %	50 %	0 %	0 %	384440715
28	NC_017280	AATTGA	2	12	58874	58885	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384440716
29	NC_017280	ATTTTT	2	12	59444	59455	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384440716
30	NC_017280	GCAAAA	2	12	62138	62149	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384440719
31	NC_017280	ATGAAA	2	12	62188	62199	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384440719
32	NC_017280	TAAACT	2	12	62720	62731	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384440719
33	NC_017280	AGTTTT	2	12	64902	64913	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440721
34	NC_017280	TTCTTT	2	12	65118	65129	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384440722
35	NC_017280	CCAATG	2	12	68972	68983	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384440725
36	NC_017280	CAAAAT	2	12	69088	69099	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384440725
37	NC_017280	TTCATC	2	12	70022	70033	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384440726
38	NC_017280	TAATTT	2	12	71816	71827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440728
39	NC_017280	ATTTTA	2	12	72068	72079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440728
40	NC_017280	AAATAT	2	12	72425	72436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440728
41	NC_017280	GTTGGA	2	12	73365	73376	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384440728
42	NC_017280	GTTTTT	2	12	73510	73521	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384440728
43	NC_017280	TACAGC	2	12	75545	75556	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384440730
44	NC_017280	CTTTTA	2	12	75699	75710	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440731
45	NC_017280	ACGCAC	2	12	78226	78237	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	384440735
46	NC_017280	TAGCTT	2	12	78895	78906	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384440737
47	NC_017280	TTCATT	2	12	81254	81265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440740
48	NC_017280	CATCTT	2	12	83000	83011	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384440741
49	NC_017280	TTTAAA	2	12	85420	85431	50 %	50 %	0 %	0 %	384440744
50	NC_017280	CTAGCT	2	12	85852	85863	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384440745
51	NC_017280	GAATGA	2	12	86106	86117	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384440745
52	NC_017280	GATGCT	2	12	87268	87279	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384440746
53	NC_017280	TCTAAA	2	12	88981	88992	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384440748
54	NC_017280	TTTAGC	2	12	90538	90549	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384440749
55	NC_017280	TTTTTG	2	12	95843	95854	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384440755
56	NC_017280	GAATTT	2	12	96163	96174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384440756
57	NC_017280	AACTCA	2	12	96678	96689	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384440756
58	NC_017280	CTTTAA	2	12	98458	98469	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384440757
59	NC_017280	ATATTT	2	12	99218	99229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440759
60	NC_017280	TGTAAC	2	12	101630	101641	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384440761
61	NC_017280	CAGGAA	2	12	102338	102349	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384440762
62	NC_017280	TTGTGT	2	12	102924	102935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440762
63	NC_017280	ATAAAA	2	12	104749	104760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384440763
64	NC_017280	TTAATG	2	12	106965	106976	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384440766
65	NC_017280	GCAAGC	2	12	107045	107056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440766
66	NC_017280	AACTTA	2	12	109785	109796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384440770
67	NC_017280	TTAGAA	2	12	112085	112096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384440772
68	NC_017280	AAAAAT	2	12	114388	114399	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384440775
69	NC_017280	GGTTTG	2	12	120093	120104	0 %	50 %	50 %	0 %	384440782
70	NC_017280	AAAGAA	2	12	120372	120383	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384440783
71	NC_017280	AAAATA	2	12	121904	121915	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384440785
72	NC_017280	AATAGT	2	12	122857	122868	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384440786
73	NC_017280	ATTTTG	2	12	123441	123452	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440787
74	NC_017280	GAAAAA	2	12	124348	124359	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384440788
75	NC_017280	GTTGTG	2	12	125194	125205	0 %	50 %	50 %	0 %	384440789
76	NC_017280	ACGGAC	2	12	125233	125244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440789
77	NC_017280	CGGTTG	2	12	125273	125284	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384440789
78	NC_017280	TTTGAT	2	12	126820	126831	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440791
79	NC_017280	TTCTTT	2	12	136536	136547	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384440803
80	NC_017280	GGGCTT	2	12	137215	137226	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384440804
81	NC_017280	AAAGAT	2	12	140287	140298	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384440806
82	NC_017280	TTGTTA	2	12	142372	142383	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440810
83	NC_017280	AAAGAA	2	12	142511	142522	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384440810
84	NC_017280	GAAAAA	2	12	145206	145217	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384440812
85	NC_017280	TAAAAA	2	12	147391	147402	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384440814
86	NC_017280	ACCTTT	2	12	148570	148581	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384440814
87	NC_017280	CTATAC	2	12	149218	149229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440815
88	NC_017280	TGCTCA	2	12	150733	150744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384440817
89	NC_017280	TAAGGT	2	12	155359	155370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440821
90	NC_017280	TAAAGT	2	12	156157	156168	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384440821
91	NC_017280	TCATTA	2	12	156777	156788	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384440822
92	NC_017280	TTTTAC	2	12	158263	158274	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440824
93	NC_017280	CTGCTC	2	12	160139	160150	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384440827
94	NC_017280	ATTTTC	2	12	161061	161072	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440828
95	NC_017280	TTAGAT	2	12	162364	162375	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384440829
96	NC_017280	AAAACT	2	12	164100	164111	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384440831
97	NC_017280	ATAAAA	2	12	164168	164179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384440831
98	NC_017280	TTTTGC	2	12	164724	164735	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384440832
99	NC_017280	AGCTAT	2	12	165779	165790	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384440834
100	NC_017280	GGCTAA	2	12	166178	166189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384440834
101	NC_017280	ATTTTT	2	12	166907	166918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384440835
102	NC_017280	TCAAAT	2	12	167806	167817	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384440836
103	NC_017280	AAATAA	2	12	170575	170586	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384440841
104	NC_017280	ATTTTC	2	12	172647	172658	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384440843
105	NC_017280	AGCTTT	2	12	173343	173354	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384440844
106	NC_017280	GGCTGT	2	12	173986	173997	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384440845
107	NC_017280	TATAAA	2	12	174651	174662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440846
108	NC_017280	AAAAGC	2	12	176149	176160	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384440847
109	NC_017280	AACAAG	2	12	176941	176952	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384440848
110	NC_017280	TCCTTA	2	12	178846	178857	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384440849
111	NC_017280	ATTCTA	2	12	179663	179674	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384440850
112	NC_017280	GCTATT	2	12	179890	179901	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384440850
113	NC_017280	TTGCAG	2	12	181237	181248	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384440851
114	NC_017280	AACATA	2	12	181585	181596	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384440851
115	NC_017280	TGACTT	2	12	183926	183937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384440854
116	NC_017280	AAAACC	2	12	185030	185041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440856
117	NC_017280	CAAGGA	2	12	187400	187411	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384440858
118	NC_017280	TAGGAT	2	12	188960	188971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440859
119	NC_017280	AATGAA	2	12	191804	191815	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384440863
120	NC_017280	AAGTGC	2	12	193009	193020	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384440863
121	NC_017280	CCTAAT	2	12	193028	193039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440863
122	NC_017280	CTTACT	2	12	194628	194639	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384440865
123	NC_017280	ATTAAA	2	12	196007	196018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440866
124	NC_017280	ATCAAT	2	12	196752	196763	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384440867
125	NC_017280	TTTTAG	2	12	205418	205429	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440874
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127	NC_017280	AAAGGC	2	12	207821	207832	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384440877
128	NC_017280	GTTTAT	2	12	208085	208096	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440877
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130	NC_017280	TGAACT	2	12	211133	211144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384440881
131	NC_017280	TTTGAT	2	12	211929	211940	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384440881
132	NC_017280	TAAAAT	2	12	213151	213162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440883
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139	NC_017280	AATTTA	2	12	221735	221746	50 %	50 %	0 %	0 %	384440895
140	NC_017280	ATAAAG	2	12	226780	226791	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384440899
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142	NC_017280	ATTGGC	2	12	235674	235685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384440911
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147	NC_017280	GCTATA	2	12	243221	243232	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384440921
148	NC_017280	ATAATT	2	12	244087	244098	50 %	50 %	0 %	0 %	384440922
149	NC_017280	TTCTTT	2	12	246242	246253	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384440923
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220	NC_017280	CATTGA	2	12	361186	361197	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384441046
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224	NC_017280	TGAAGA	2	12	364927	364938	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384441053
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226	NC_017280	ATTTAA	2	12	366999	367010	50 %	50 %	0 %	0 %	384441054
227	NC_017280	AAAGAA	2	12	367297	367308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384441054
228	NC_017280	TTTAAA	2	12	367571	367582	50 %	50 %	0 %	0 %	384441055
229	NC_017280	TATGCC	2	12	374586	374597	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384441062
230	NC_017280	AAATGA	2	12	377734	377745	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384441064
231	NC_017280	TTTATT	2	12	379089	379100	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	384441065
232	NC_017280	GAAAAA	2	12	379450	379461	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384441065
233	NC_017280	CAAACT	2	12	380086	380097	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384441066
234	NC_017280	AAGGAG	2	12	380150	380161	50 %	0 %	50 %	0 %	384441066
235	NC_017280	ATTTTA	2	12	380778	380789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384441067
236	NC_017280	ATTTTC	2	12	384835	384846	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384441072
237	NC_017280	AAAAGA	2	12	388047	388058	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384441077
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240	NC_017280	TGCAAG	2	12	400416	400427	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384441084
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251	NC_017280	TTTGGG	2	12	416996	417007	0 %	50 %	50 %	0 %	384441101
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340	NC_017280	ATGTGG	2	12	559325	559336	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384441242
341	NC_017280	CAAGCT	2	12	559919	559930	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384441242
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343	NC_017280	TCAAGC	2	12	559948	559959	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384441242
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