MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 1606

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	384440682
2	NC_017280	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	384440682
3	NC_017280	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	384440682
4	NC_017280	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	384440684
5	NC_017280	GTTTT	2	10	4921	4930	0 %	80 %	20 %	0 %	384440685
6	NC_017280	TTGTT	2	10	6483	6492	0 %	80 %	20 %	0 %	384440686
7	NC_017280	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017280	GTTTT	2	10	7484	7493	0 %	80 %	20 %	0 %	384440687
9	NC_017280	ATTTT	2	10	8702	8711	20 %	80 %	0 %	0 %	384440688
10	NC_017280	AAGAG	2	10	9734	9743	60 %	0 %	40 %	0 %	384440688
11	NC_017280	TGCTT	2	10	10043	10052	0 %	60 %	20 %	20 %	384440688
12	NC_017280	ACTTC	2	10	10396	10405	20 %	40 %	0 %	40 %	384440688
13	NC_017280	TCAAA	2	10	10958	10967	60 %	20 %	0 %	20 %	384440688
14	NC_017280	GACAA	2	10	13566	13575	60 %	0 %	20 %	20 %	384440689
15	NC_017280	CTTAA	2	10	14995	15004	40 %	40 %	0 %	20 %	384440692
16	NC_017280	CATTT	2	10	15545	15554	20 %	60 %	0 %	20 %	384440692
17	NC_017280	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017280	GCGAT	2	10	15815	15824	20 %	20 %	40 %	20 %	384440693
19	NC_017280	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017280	TTTCA	2	10	18511	18520	20 %	60 %	0 %	20 %	384440695
21	NC_017280	AAGAT	2	10	20063	20072	60 %	20 %	20 %	0 %	384440696
22	NC_017280	ACCAA	2	10	21726	21735	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_017280	AAAAT	2	10	21867	21876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017280	GTTAA	2	10	21894	21903	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017280	TTTAT	2	10	25655	25664	20 %	80 %	0 %	0 %	384440701
26	NC_017280	TTCTT	2	10	26410	26419	0 %	80 %	0 %	20 %	384440701
27	NC_017280	TTTGG	2	10	27083	27092	0 %	60 %	40 %	0 %	384440702
28	NC_017280	AGATA	2	10	28168	28177	60 %	20 %	20 %	0 %	384440703
29	NC_017280	GCTTT	2	10	28682	28691	0 %	60 %	20 %	20 %	384440703
30	NC_017280	ATACT	2	10	30091	30100	40 %	40 %	0 %	20 %	384440703
31	NC_017280	AATCC	2	10	30542	30551	40 %	20 %	0 %	40 %	384440704
32	NC_017280	TGTTT	2	10	31529	31538	0 %	80 %	20 %	0 %	384440704
33	NC_017280	GCAAA	2	10	31596	31605	60 %	0 %	20 %	20 %	384440704
34	NC_017280	GAAAT	2	10	32014	32023	60 %	20 %	20 %	0 %	384440705
35	NC_017280	AAAGT	2	10	32498	32507	60 %	20 %	20 %	0 %	384440705
36	NC_017280	AAAAT	2	10	33750	33759	80 %	20 %	0 %	0 %	384440706
37	NC_017280	AAATC	2	10	35165	35174	60 %	20 %	0 %	20 %	384440707
38	NC_017280	TATAT	2	10	37027	37036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017280	CTTTT	2	10	37314	37323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_017280	CTTTT	2	10	37485	37494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_017280	GGTAA	2	10	37796	37805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017280	TCGTG	2	10	38592	38601	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017280	TCTTT	2	10	39620	39629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_017280	CCGTA	2	10	41567	41576	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_017280	ATTAT	2	10	43623	43632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017280	GGAAT	2	10	44005	44014	40 %	20 %	40 %	0 %	384440709
47	NC_017280	TAAAA	2	10	45626	45635	80 %	20 %	0 %	0 %	384440709
48	NC_017280	TATGT	2	10	46031	46040	20 %	60 %	20 %	0 %	384440710
49	NC_017280	TACTT	2	10	46786	46795	20 %	60 %	0 %	20 %	384440710
50	NC_017280	AAGGT	2	10	48746	48755	40 %	20 %	40 %	0 %	384440712
51	NC_017280	TTCTT	2	10	51110	51119	0 %	80 %	0 %	20 %	384440713
52	NC_017280	AAGAA	2	10	54509	54518	80 %	0 %	20 %	0 %	384440714
53	NC_017280	ATGTT	2	10	54607	54616	20 %	60 %	20 %	0 %	384440714
54	NC_017280	GATTT	2	10	56859	56868	20 %	60 %	20 %	0 %	384440715
55	NC_017280	TAATC	2	10	58670	58679	40 %	40 %	0 %	20 %	384440716
56	NC_017280	AATTT	2	10	59148	59157	40 %	60 %	0 %	0 %	384440716
57	NC_017280	AGCTT	2	10	59832	59841	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_017280	CAAAT	2	10	61881	61890	60 %	20 %	0 %	20 %	384440719
59	NC_017280	ACAAA	2	10	62909	62918	80 %	0 %	0 %	20 %	384440719
60	NC_017280	TACTC	2	10	64161	64170	20 %	40 %	0 %	40 %	384440720
61	NC_017280	GATAA	2	10	64559	64568	60 %	20 %	20 %	0 %	384440721
62	NC_017280	ACCGC	2	10	65477	65486	20 %	0 %	20 %	60 %	384440722
63	NC_017280	CTTTT	2	10	65643	65652	0 %	80 %	0 %	20 %	384440722
64	NC_017280	ACCGC	2	10	65669	65678	20 %	0 %	20 %	60 %	384440722
65	NC_017280	TTTCA	2	10	65890	65899	20 %	60 %	0 %	20 %	384440722
66	NC_017280	ATACT	2	10	65979	65988	40 %	40 %	0 %	20 %	384440722
67	NC_017280	AAGAT	2	10	67282	67291	60 %	20 %	20 %	0 %	384440723
68	NC_017280	TAATG	2	10	67334	67343	40 %	40 %	20 %	0 %	384440723
69	NC_017280	GATAA	2	10	67661	67670	60 %	20 %	20 %	0 %	384440724
70	NC_017280	AAATT	2	10	68596	68605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017280	TACTA	2	10	70452	70461	40 %	40 %	0 %	20 %	384440727
72	NC_017280	TGCTT	2	10	71246	71255	0 %	60 %	20 %	20 %	384440727
73	NC_017280	AATAT	2	10	71431	71440	60 %	40 %	0 %	0 %	384440727
74	NC_017280	CATTT	2	10	72030	72039	20 %	60 %	0 %	20 %	384440728
75	NC_017280	AATTT	2	10	72044	72053	40 %	60 %	0 %	0 %	384440728
76	NC_017280	ATTTC	2	10	72146	72155	20 %	60 %	0 %	20 %	384440728
77	NC_017280	TGATT	2	10	72197	72206	20 %	60 %	20 %	0 %	384440728
78	NC_017280	TTTTA	2	10	72264	72273	20 %	80 %	0 %	0 %	384440728
79	NC_017280	GATAA	2	10	73198	73207	60 %	20 %	20 %	0 %	384440728
80	NC_017280	TCAAA	2	10	73749	73758	60 %	20 %	0 %	20 %	384440729
81	NC_017280	AATAA	2	10	74423	74432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017280	AAAAT	2	10	75473	75482	80 %	20 %	0 %	0 %	384440730
83	NC_017280	ATATT	2	10	77640	77649	40 %	60 %	0 %	0 %	384440734
84	NC_017280	CTCTT	2	10	80660	80669	0 %	60 %	0 %	40 %	384440739
85	NC_017280	TTTTC	2	10	80701	80710	0 %	80 %	0 %	20 %	384440739
86	NC_017280	TCTCT	2	10	80965	80974	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
87	NC_017280	ATCTC	2	10	81516	81525	20 %	40 %	0 %	40 %	384440740
88	NC_017280	GCCAA	2	10	81654	81663	40 %	0 %	20 %	40 %	384440740
89	NC_017280	TTTTG	2	10	82898	82907	0 %	80 %	20 %	0 %	384440741
90	NC_017280	TAAGG	2	10	87372	87381	40 %	20 %	40 %	0 %	384440746
91	NC_017280	ATTTT	2	10	87425	87434	20 %	80 %	0 %	0 %	384440746
92	NC_017280	TAGGA	2	10	87701	87710	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017280	AAAAT	2	10	87727	87736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017280	ATTTT	2	10	87737	87746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017280	TTAAT	2	10	88463	88472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017280	TATTT	2	10	88531	88540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017280	GTATA	2	10	88547	88556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017280	TAAAA	2	10	92321	92330	80 %	20 %	0 %	0 %	384440751
99	NC_017280	CAAAA	2	10	92854	92863	80 %	0 %	0 %	20 %	384440751
100	NC_017280	TTAAA	2	10	93287	93296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017280	ATTGT	2	10	93327	93336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017280	TAAAA	2	10	95564	95573	80 %	20 %	0 %	0 %	384440754
103	NC_017280	GAAAT	2	10	96437	96446	60 %	20 %	20 %	0 %	384440756
104	NC_017280	TGGTT	2	10	96621	96630	0 %	60 %	40 %	0 %	384440756
105	NC_017280	TCCAT	2	10	97234	97243	20 %	40 %	0 %	40 %	384440756
106	NC_017280	TATTT	2	10	97781	97790	20 %	80 %	0 %	0 %	384440757
107	NC_017280	TTTTA	2	10	97793	97802	20 %	80 %	0 %	0 %	384440757
108	NC_017280	TATTT	2	10	98141	98150	20 %	80 %	0 %	0 %	384440757
109	NC_017280	TTGGC	2	10	98655	98664	0 %	40 %	40 %	20 %	384440758
110	NC_017280	AAGAT	2	10	98742	98751	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017280	GTAAA	2	10	99391	99400	60 %	20 %	20 %	0 %	384440759
112	NC_017280	TTATT	2	10	99541	99550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017280	AGAAT	2	10	99925	99934	60 %	20 %	20 %	0 %	384440760
114	NC_017280	TTAAA	2	10	100567	100576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017280	AAGAA	2	10	100607	100616	80 %	0 %	20 %	0 %	384440761
116	NC_017280	CCTTG	2	10	101048	101057	0 %	40 %	20 %	40 %	384440761
117	NC_017280	AGGTA	2	10	101564	101573	40 %	20 %	40 %	0 %	384440761
118	NC_017280	ACCTT	2	10	104334	104343	20 %	40 %	0 %	40 %	384440763
119	NC_017280	TATTT	2	10	104849	104858	20 %	80 %	0 %	0 %	384440764
120	NC_017280	TCAAA	2	10	104907	104916	60 %	20 %	0 %	20 %	384440764
121	NC_017280	ATTTA	2	10	105034	105043	40 %	60 %	0 %	0 %	384440764
122	NC_017280	TTAGA	2	10	105178	105187	40 %	40 %	20 %	0 %	384440764
123	NC_017280	GCTTT	2	10	105269	105278	0 %	60 %	20 %	20 %	384440765
124	NC_017280	CAAGT	2	10	105318	105327	40 %	20 %	20 %	20 %	384440765
125	NC_017280	GTTTA	2	10	105786	105795	20 %	60 %	20 %	0 %	384440765
126	NC_017280	TAAAA	2	10	105851	105860	80 %	20 %	0 %	0 %	384440765
127	NC_017280	ATGAA	2	10	105930	105939	60 %	20 %	20 %	0 %	384440766
128	NC_017280	AAATG	2	10	106036	106045	60 %	20 %	20 %	0 %	384440766
129	NC_017280	AGGCA	2	10	106672	106681	40 %	0 %	40 %	20 %	384440766
130	NC_017280	TAAAA	2	10	107035	107044	80 %	20 %	0 %	0 %	384440766
131	NC_017280	AAATT	2	10	108030	108039	60 %	40 %	0 %	0 %	384440767
132	NC_017280	AAAAC	2	10	108291	108300	80 %	0 %	0 %	20 %	384440767
133	NC_017280	AAAGC	2	10	108725	108734	60 %	0 %	20 %	20 %	384440768
134	NC_017280	CTTTG	2	10	109138	109147	0 %	60 %	20 %	20 %	384440769
135	NC_017280	AAGAA	2	10	110101	110110	80 %	0 %	20 %	0 %	384440770
136	NC_017280	ACTCA	2	10	112240	112249	40 %	20 %	0 %	40 %	384440773
137	NC_017280	TTTTG	2	10	115578	115587	0 %	80 %	20 %	0 %	384440778
138	NC_017280	ATTTC	2	10	117697	117706	20 %	60 %	0 %	20 %	384440780
139	NC_017280	CAAGA	2	10	118352	118361	60 %	0 %	20 %	20 %	384440780
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