MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 186

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	TAAAA	2	10	6616	6625	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017280	GTATT	2	10	15676	15685	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017280	AAAAT	2	10	18044	18053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017280	ACCAA	2	10	21726	21735	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_017280	AAAAT	2	10	21867	21876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017280	GTTAA	2	10	21894	21903	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017280	TATAT	2	10	37027	37036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017280	CTTTT	2	10	37314	37323	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_017280	CTTTT	2	10	37485	37494	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_017280	GGTAA	2	10	37796	37805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017280	TCGTG	2	10	38592	38601	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
12	NC_017280	TCTTT	2	10	39620	39629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_017280	CCGTA	2	10	41567	41576	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_017280	ATTAT	2	10	43623	43632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017280	AGCTT	2	10	59832	59841	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_017280	AAATT	2	10	68596	68605	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017280	AATAA	2	10	74423	74432	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017280	TCTCT	2	10	80965	80974	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_017280	TAGGA	2	10	87701	87710	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017280	AAAAT	2	10	87727	87736	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017280	ATTTT	2	10	87737	87746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017280	TTAAT	2	10	88463	88472	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017280	TATTT	2	10	88531	88540	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017280	GTATA	2	10	88547	88556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017280	TTAAA	2	10	93287	93296	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017280	ATTGT	2	10	93327	93336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017280	AAGAT	2	10	98742	98751	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017280	TTATT	2	10	99541	99550	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017280	TTAAA	2	10	100567	100576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017280	TAATT	2	10	145361	145370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017280	TATTT	2	10	159400	159409	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017280	TTATT	2	10	173614	173623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017280	AAAGC	2	10	179255	179264	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_017280	TATTT	2	10	180771	180780	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017280	TAAAA	2	10	190962	190971	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017280	AAAAT	2	10	195130	195139	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017280	AAGTG	2	10	198016	198025	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017280	AGGAT	2	10	199200	199209	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017280	TAAAA	2	10	200558	200567	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017280	AAAAT	2	10	225856	225865	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017280	AAATT	2	10	227692	227701	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017280	CTTTT	2	10	227737	227746	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_017280	GATTT	2	10	229346	229355	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017280	CATAA	2	10	236196	236205	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_017280	AAAAT	2	10	242522	242531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017280	ATATT	2	10	247054	247063	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017280	ATTAA	2	10	250331	250340	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017280	TTAAT	2	10	252247	252256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017280	ATAAA	2	10	270559	270568	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017280	AATTT	2	10	276823	276832	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017280	TTAAA	2	10	301769	301778	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017280	TTTTA	2	10	320685	320694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017280	ATTAA	2	10	336755	336764	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017280	ATTAA	2	10	339248	339257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017280	CTTTT	2	10	393081	393090	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_017280	CTTTT	2	10	393252	393261	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_017280	GGTAA	2	10	393563	393572	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017280	TCGTG	2	10	394359	394368	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_017280	TCTTT	2	10	395387	395396	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_017280	CCGTA	2	10	397334	397343	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_017280	CTTAT	2	10	404430	404439	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_017280	ATTTT	2	10	408956	408965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017280	TAAAT	2	10	430241	430250	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017280	GATTT	2	10	447438	447447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017280	ATATT	2	10	455163	455172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017280	AATAA	2	10	455181	455190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017280	TAATT	2	10	455198	455207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017280	AAAAT	2	10	505210	505219	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017280	GTTTT	2	10	508306	508315	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017280	AAATA	2	10	508615	508624	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017280	CATTC	2	10	509331	509340	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_017280	TTTAA	2	10	509366	509375	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017280	TTTTA	2	10	517621	517630	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017280	AAAAT	2	10	517655	517664	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017280	AATTA	2	10	520115	520124	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017280	ATTTG	2	10	535954	535963	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017280	AAATT	2	10	538758	538767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017280	TAAAA	2	10	549817	549826	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017280	TTTTA	2	10	571624	571633	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017280	GAAAA	2	10	589237	589246	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017280	TTTGC	2	10	592758	592767	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_017280	AATTA	2	10	608808	608817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017280	TTTAA	2	10	617789	617798	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017280	CTTTG	2	10	619447	619456	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_017280	AAAAT	2	10	636117	636126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017280	ATTTT	2	10	636164	636173	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017280	TAAAA	2	10	636207	636216	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017280	GCTTA	2	10	639112	639121	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_017280	TAATT	2	10	640568	640577	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017280	TAAAA	3	15	655436	655450	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017280	ATAAA	2	10	656259	656268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017280	ATTTA	2	10	657844	657853	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017280	TTTAA	2	10	665171	665180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017280	TAAAA	2	10	688232	688241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017280	AAAAT	2	10	688302	688311	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017280	ATTTT	2	10	688323	688332	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017280	ATTTT	2	10	688395	688404	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017280	CTTTT	2	10	696287	696296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_017280	CTTTT	2	10	696458	696467	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_017280	GGTAA	2	10	696769	696778	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017280	TCGTG	2	10	697565	697574	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_017280	TCTTT	2	10	698593	698602	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_017280	CCGTA	2	10	700540	700549	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
104	NC_017280	AATAA	2	10	707526	707535	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017280	ATTTA	2	10	710300	710309	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017280	GCTTT	2	10	719346	719355	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_017280	TTTAT	2	10	730918	730927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017280	TATAA	2	10	776592	776601	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017280	ATTTT	2	10	810638	810647	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017280	TTTTA	2	10	810829	810838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017280	AGGTT	2	10	816277	816286	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017280	AAAAT	2	10	824338	824347	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017280	AAAAT	2	10	855222	855231	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017280	ATTTT	2	10	860886	860895	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017280	CTTAA	2	10	873032	873041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_017280	TAAAT	2	10	873799	873808	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017280	GGAAA	2	10	874048	874057	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017280	AAAAT	2	10	899126	899135	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017280	TTAAT	2	10	911102	911111	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017280	AAAAT	2	10	911145	911154	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017280	TTAAA	2	10	921324	921333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017280	AATTA	2	10	937350	937359	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017280	TAAAA	2	10	965978	965987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017280	TTTAT	2	10	971803	971812	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017280	TTAAT	2	10	976902	976911	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017280	CTTTA	2	10	1015777	1015786	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_017280	TATAT	2	10	1056763	1056772	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017280	AAATT	2	10	1106865	1106874	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017280	TTTAA	2	10	1110468	1110477	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017280	AGTTT	2	10	1124777	1124786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017280	ATTTT	2	10	1128967	1128976	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017280	TATCA	2	10	1134945	1134954	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_017280	TAAAA	2	10	1137352	1137361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017280	TTTTA	2	10	1142431	1142440	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017280	TTTAT	2	10	1164128	1164137	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017280	AAACT	2	10	1164157	1164166	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_017280	TTTAA	2	10	1164178	1164187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017280	ATTTA	2	10	1168172	1168181	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017280	TATTT	2	10	1184274	1184283	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017280	TTTAT	2	10	1184322	1184331	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017280	AATTT	2	10	1186071	1186080	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017280	TTTCT	2	10	1191543	1191552	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_017280	ATGTG	2	10	1230412	1230421	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017280	TTTAA	2	10	1230559	1230568	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017280	AAAAT	2	10	1230580	1230589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017280	TTTAA	2	10	1240013	1240022	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017280	ATTTT	2	10	1253112	1253121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017280	TATAT	2	10	1253137	1253146	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017280	TTTAG	2	10	1253192	1253201	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017280	TATTT	2	10	1279196	1279205	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017280	TAAAG	2	10	1279491	1279500	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_017280	AGAAA	2	10	1331546	1331555	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_017280	TAAAA	2	10	1421187	1421196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_017280	TAAAA	3	15	1436419	1436433	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_017280	TTAAT	2	10	1466898	1466907	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_017280	TAAAA	2	10	1517215	1517224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_017280	TATTT	2	10	1517367	1517376	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_017280	AAATT	2	10	1525380	1525389	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_017280	AAAAT	2	10	1610967	1610976	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_017280	TATAT	2	10	1612551	1612560	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_017280	CCTGT	2	10	1613652	1613661	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.