MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 395

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	AAAT	2	8	1339	1346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017280	ATTT	3	12	8037	8048	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017280	AAAT	2	8	15742	15749	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017280	TTTA	2	8	18070	18077	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017280	CCTT	2	8	21641	21648	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_017280	TGAT	2	8	25626	25633	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017280	AAGG	2	8	27970	27977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017280	TATT	2	8	35841	35848	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017280	TTTA	2	8	37133	37140	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017280	CTAT	2	8	37533	37540	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017280	ATTT	2	8	39406	39413	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017280	CAAG	2	8	39562	39569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017280	TAGC	2	8	40169	40176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017280	CTTA	2	8	40831	40838	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_017280	AAAG	2	8	40902	40909	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017280	AGTA	2	8	40962	40969	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017280	TAAT	2	8	41232	41239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017280	GGAT	2	8	41502	41509	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017280	GGTG	2	8	41587	41594	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017280	TCCC	2	8	41729	41736	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_017280	TCGT	2	8	42277	42284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_017280	ATAA	2	8	42897	42904	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017280	TAAA	2	8	43020	43027	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017280	TTAC	2	8	43257	43264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_017280	TAAA	2	8	43478	43485	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017280	ATTA	2	8	43530	43537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017280	TTAA	2	8	43544	43551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017280	TATT	2	8	43610	43617	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017280	TTTA	2	8	43642	43649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017280	TAAA	2	8	64353	64360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017280	TAAA	2	8	68318	68325	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017280	TAAA	2	8	68363	68370	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017280	TAAA	2	8	68465	68472	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017280	TAAA	2	8	68531	68538	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017280	TAAA	2	8	68615	68622	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017280	CAAA	2	8	68701	68708	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017280	TAAA	2	8	68771	68778	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017280	TAAA	2	8	69235	69242	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017280	TAAA	2	8	74441	74448	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017280	ATTT	2	8	74715	74722	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017280	AGAA	2	8	74802	74809	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017280	AATT	2	8	76310	76317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017280	ATTT	2	8	84276	84283	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017280	AAAT	2	8	84309	84316	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017280	TTTA	2	8	86478	86485	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017280	TTTA	2	8	87783	87790	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017280	ATTA	2	8	93338	93345	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017280	TAAA	2	8	93376	93383	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017280	AATT	2	8	99527	99534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017280	ATTT	2	8	99574	99581	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017280	TAAA	3	12	99583	99594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017280	TAAA	2	8	100408	100415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017280	AGGA	2	8	105216	105223	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017280	TTTA	2	8	109275	109282	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017280	ATTA	2	8	123205	123212	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017280	AAGG	2	8	138094	138101	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017280	TAAA	2	8	151209	151216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017280	AATT	2	8	151230	151237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017280	AAAT	2	8	152685	152692	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017280	CATT	2	8	156937	156944	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_017280	CCTT	2	8	157748	157755	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_017280	ATAA	2	8	157767	157774	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017280	CTTT	2	8	159376	159383	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_017280	ACAA	2	8	166538	166545	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_017280	CATT	2	8	166606	166613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_017280	ATAA	2	8	166669	166676	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017280	CAAA	2	8	172971	172978	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_017280	TTAA	2	8	173006	173013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017280	AAAT	2	8	173022	173029	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017280	TAAA	2	8	173629	173636	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017280	AGCA	2	8	179247	179254	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_017280	TAAA	2	8	179455	179462	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017280	TTGC	2	8	191003	191010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_017280	ATTT	2	8	195152	195159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017280	TTTA	2	8	197555	197562	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017280	TTTA	2	8	209216	209223	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017280	TAAA	2	8	215139	215146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017280	TAAA	2	8	215192	215199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017280	TAAA	2	8	220131	220138	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017280	TAAA	2	8	220952	220959	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017280	GGTT	2	8	221038	221045	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017280	ATTA	3	12	226396	226407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017280	GTTA	2	8	230486	230493	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017280	TAAA	2	8	233440	233447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017280	TTTG	2	8	233473	233480	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017280	AAAG	2	8	240488	240495	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017280	GTTT	2	8	246889	246896	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017280	TCCC	2	8	246973	246980	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
89	NC_017280	TTGA	2	8	247023	247030	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017280	AAAT	2	8	256582	256589	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017280	ATTT	2	8	256627	256634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017280	CTTT	2	8	266532	266539	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_017280	TTAA	2	8	268237	268244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017280	ATTG	2	8	269068	269075	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017280	GCAA	2	8	269163	269170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_017280	TGAT	2	8	269955	269962	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017280	ATTT	2	8	273267	273274	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017280	AATA	2	8	293848	293855	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017280	AAAG	2	8	301761	301768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017280	TTTA	2	8	303006	303013	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017280	TAAA	2	8	314065	314072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017280	AATT	2	8	315108	315115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017280	ATTT	2	8	315292	315299	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017280	TAAA	2	8	324024	324031	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017280	ATAA	2	8	325807	325814	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017280	ATTA	2	8	325845	325852	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017280	ATTT	2	8	325875	325882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017280	TAAA	2	8	330719	330726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017280	TATT	2	8	339262	339269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017280	TTTA	2	8	370599	370606	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017280	TAAA	2	8	379810	379817	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017280	TTTA	2	8	382871	382878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017280	ATTA	2	8	386079	386086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017280	TTTA	2	8	392900	392907	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017280	CTAT	2	8	393300	393307	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_017280	ATTT	2	8	395173	395180	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017280	CAAG	2	8	395329	395336	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_017280	TAGC	2	8	395936	395943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_017280	CTTA	2	8	396598	396605	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_017280	AAAG	2	8	396669	396676	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017280	AGTA	2	8	396729	396736	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017280	TAAT	2	8	396999	397006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017280	GGAT	2	8	397269	397276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017280	GGTG	2	8	397354	397361	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017280	TCCC	2	8	397496	397503	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_017280	TCGT	2	8	398044	398051	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_017280	ATAA	2	8	398665	398672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017280	TAAA	2	8	398788	398795	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017280	TTAC	2	8	399025	399032	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_017280	GATA	2	8	403081	403088	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
131	NC_017280	TTAA	2	8	404277	404284	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017280	TTAA	2	8	404298	404305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017280	ATTT	2	8	404394	404401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017280	ATCT	2	8	404412	404419	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_017280	GTTT	2	8	404500	404507	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017280	TTAA	2	8	411517	411524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017280	ATAA	2	8	413729	413736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017280	ATTT	2	8	433175	433182	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017280	ATTT	2	8	433615	433622	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017280	AAAG	2	8	447011	447018	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017280	TCAT	2	8	447414	447421	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_017280	TTTA	2	8	455085	455092	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017280	TATT	2	8	455137	455144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017280	TACT	2	8	455621	455628	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017280	AACA	2	8	459749	459756	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_017280	AATC	2	8	459790	459797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_017280	AGAA	2	8	459837	459844	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_017280	TAAA	2	8	464650	464657	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017280	TTTA	2	8	472359	472366	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017280	CTTT	2	8	472760	472767	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_017280	GTTT	2	8	489094	489101	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.