MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni M1 chromosome

Total Repeats: 17944

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017280	CTT	2	6	308	313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440682
2	NC_017280	TGT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440682
3	NC_017280	GAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440682
4	NC_017280	AAG	2	6	647	652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440682
5	NC_017280	ATC	2	6	697	702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440682
6	NC_017280	CAT	2	6	819	824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440682
7	NC_017280	CTT	2	6	887	892	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440682
8	NC_017280	ATA	2	6	899	904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440682
9	NC_017280	ATC	2	6	922	927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440682
10	NC_017280	TGA	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440682
11	NC_017280	ATT	2	6	1187	1192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440682
12	NC_017280	ATG	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440682
13	NC_017280	GAA	2	6	1282	1287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440682
14	NC_017280	TGA	2	6	1593	1598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440683
15	NC_017280	CTT	2	6	1606	1611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440683
16	NC_017280	TTA	2	6	1715	1720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440683
17	NC_017280	GAA	2	6	1735	1740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440683
18	NC_017280	GTT	2	6	1741	1746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440683
19	NC_017280	AAT	2	6	2035	2040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440683
20	NC_017280	TAT	2	6	2073	2078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440683
21	NC_017280	ATC	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440683
22	NC_017280	GAA	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440683
23	NC_017280	AGA	3	9	2451	2459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440683
24	NC_017280	TAA	2	6	2548	2553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440683
25	NC_017280	TCA	2	6	2683	2688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
26	NC_017280	ACT	2	6	2765	2770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
27	NC_017280	TGT	2	6	2851	2856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440684
28	NC_017280	AAC	2	6	3067	3072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440684
29	NC_017280	TGA	2	6	3088	3093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440684
30	NC_017280	GAA	2	6	3305	3310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
31	NC_017280	ATA	2	6	3378	3383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440684
32	NC_017280	TGG	2	6	3397	3402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440684
33	NC_017280	ATA	2	6	3486	3491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440684
34	NC_017280	TGT	2	6	3529	3534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440684
35	NC_017280	GAA	2	6	3650	3655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
36	NC_017280	AGC	2	6	3715	3720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440684
37	NC_017280	AGG	2	6	3850	3855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440684
38	NC_017280	ATC	3	9	4040	4048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
39	NC_017280	TCT	2	6	4101	4106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440684
40	NC_017280	ACC	2	6	4156	4161	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440684
41	NC_017280	ATT	2	6	4290	4295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440684
42	NC_017280	GAA	2	6	4409	4414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
43	NC_017280	AGA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
44	NC_017280	GAA	2	6	4541	4546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
45	NC_017280	GAA	2	6	4568	4573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
46	NC_017280	CTA	2	6	4674	4679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440684
47	NC_017280	AAG	2	6	4750	4755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440684
48	NC_017280	TGA	2	6	4819	4824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440684
49	NC_017280	TTC	2	6	4910	4915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440685
50	NC_017280	TTC	3	9	4952	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440685
51	NC_017280	ATA	2	6	4980	4985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440685
52	NC_017280	GCT	2	6	5068	5073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440685
53	NC_017280	CCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440686
54	NC_017280	ATA	2	6	5378	5383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440686
55	NC_017280	TTG	2	6	5389	5394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440686
56	NC_017280	ACC	2	6	5765	5770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384440686
57	NC_017280	CTC	2	6	5872	5877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440686
58	NC_017280	TTC	2	6	5894	5899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440686
59	NC_017280	ATA	2	6	5924	5929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440686
60	NC_017280	CAT	2	6	5944	5949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440686
61	NC_017280	TCT	2	6	6126	6131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440686
62	NC_017280	TGG	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440686
63	NC_017280	ATT	2	6	6233	6238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440686
64	NC_017280	CTG	2	6	6298	6303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440686
65	NC_017280	TCT	2	6	6471	6476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440686
66	NC_017280	GTT	2	6	6739	6744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440687
67	NC_017280	TGA	2	6	6746	6751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440687
68	NC_017280	TTG	2	6	6806	6811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440687
69	NC_017280	TGC	2	6	6918	6923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440687
70	NC_017280	TTG	2	6	7072	7077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440687
71	NC_017280	TAA	2	6	7101	7106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440687
72	NC_017280	TAC	2	6	7155	7160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440687
73	NC_017280	AAT	2	6	7231	7236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440687
74	NC_017280	ATG	2	6	7253	7258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440687
75	NC_017280	TGC	2	6	7278	7283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440687
76	NC_017280	AAG	2	6	7349	7354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440687
77	NC_017280	TGA	2	6	7542	7547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440687
78	NC_017280	ATG	2	6	7558	7563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440687
79	NC_017280	TTG	2	6	7586	7591	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440687
80	NC_017280	AGT	2	6	7629	7634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440687
81	NC_017280	ATC	2	6	7714	7719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440687
82	NC_017280	CTT	2	6	7736	7741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440687
83	NC_017280	TTA	2	6	7811	7816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440687
84	NC_017280	AAC	2	6	7872	7877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440687
85	NC_017280	ACT	2	6	7885	7890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440687
86	NC_017280	ACA	2	6	7911	7916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440687
87	NC_017280	ATT	2	6	7968	7973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440687
88	NC_017280	GTA	2	6	7982	7987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440687
89	NC_017280	AAT	2	6	8166	8171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440688
90	NC_017280	TGA	2	6	8287	8292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
91	NC_017280	GGT	2	6	8307	8312	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440688
92	NC_017280	GAA	2	6	8322	8327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
93	NC_017280	AGA	2	6	8465	8470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
94	NC_017280	TTC	2	6	8720	8725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440688
95	NC_017280	CTT	2	6	8751	8756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440688
96	NC_017280	CAT	2	6	8996	9001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440688
97	NC_017280	ATA	2	6	9034	9039	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440688
98	NC_017280	AGA	2	6	9074	9079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
99	NC_017280	ATG	3	9	9087	9095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
100	NC_017280	CTG	2	6	9190	9195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440688
101	NC_017280	TAT	2	6	9264	9269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
102	NC_017280	GAT	2	6	9279	9284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
103	NC_017280	TGA	2	6	9323	9328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
104	NC_017280	AGA	2	6	9521	9526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
105	NC_017280	ATG	2	6	9565	9570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
106	NC_017280	GCT	2	6	9588	9593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440688
107	NC_017280	AAG	2	6	9610	9615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
108	NC_017280	AGC	2	6	9620	9625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384440688
109	NC_017280	ATT	2	6	9682	9687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
110	NC_017280	AAC	2	6	9691	9696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440688
111	NC_017280	TCC	2	6	9716	9721	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440688
112	NC_017280	TTA	2	6	9786	9791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
113	NC_017280	GAA	2	6	9849	9854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
114	NC_017280	ATT	2	6	9913	9918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
115	NC_017280	AGA	2	6	9965	9970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
116	NC_017280	TAT	2	6	9992	9997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
117	NC_017280	ATC	2	6	10072	10077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440688
118	NC_017280	TTA	2	6	10111	10116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
119	NC_017280	GTG	2	6	10123	10128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440688
120	NC_017280	TCA	2	6	10142	10147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440688
121	NC_017280	TTA	2	6	10180	10185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
122	NC_017280	TCA	2	6	10270	10275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440688
123	NC_017280	AGA	2	6	10436	10441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
124	NC_017280	AGA	2	6	10538	10543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
125	NC_017280	CAA	2	6	10592	10597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440688
126	NC_017280	TAG	2	6	10630	10635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
127	NC_017280	AAG	2	6	10771	10776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
128	NC_017280	GAA	2	6	10848	10853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
129	NC_017280	ACT	2	6	10933	10938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440688
130	NC_017280	CCT	2	6	11079	11084	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384440688
131	NC_017280	CAT	2	6	11085	11090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440688
132	NC_017280	AGA	2	6	11105	11110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
133	NC_017280	TGC	2	6	11201	11206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440688
134	NC_017280	ATG	2	6	11251	11256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
135	NC_017280	GAA	2	6	11436	11441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440688
136	NC_017280	GAT	2	6	11483	11488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
137	NC_017280	GAT	2	6	11571	11576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
138	NC_017280	GAG	2	6	11604	11609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	384440688
139	NC_017280	GAT	2	6	11649	11654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440688
140	NC_017280	ATT	2	6	12058	12063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384440688
141	NC_017280	GTG	2	6	12079	12084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384440688
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143	NC_017280	ATC	2	6	12138	12143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440688
144	NC_017280	GCT	2	6	12327	12332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440688
145	NC_017280	GTT	2	6	12348	12353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440688
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149	NC_017280	CTG	2	6	13127	13132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384440689
150	NC_017280	AAG	2	6	13188	13193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440689
151	NC_017280	AAG	2	6	13602	13607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440689
152	NC_017280	AAG	2	6	13626	13631	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440689
153	NC_017280	TAC	2	6	13668	13673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440689
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155	NC_017280	AAG	2	6	13805	13810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440689
156	NC_017280	GAA	2	6	13897	13902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440689
157	NC_017280	ACA	2	6	13943	13948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384440689
158	NC_017280	GTT	2	6	14023	14028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384440689
159	NC_017280	AAT	2	6	14084	14089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384440689
160	NC_017280	TCA	2	6	14220	14225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440690
161	NC_017280	CAT	2	6	14334	14339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384440690
162	NC_017280	AAG	2	6	14342	14347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440690
163	NC_017280	GAA	2	6	14432	14437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384440690
164	NC_017280	TGA	3	9	14466	14474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384440690
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172	NC_017280	TTC	2	6	15112	15117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384440692
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