MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	TAAAAT	2	12	1455	1466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017279	AATTTA	2	12	21111	21122	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017279	TTTTAT	2	12	28295	28306	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017279	ATTTAT	2	12	41190	41201	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017279	TACAGC	2	12	67880	67891	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017279	CTTTTA	2	12	68145	68156	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_017279	TAAAAT	2	12	96280	96291	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017279	TTAAAT	2	12	140536	140547	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017279	AAATAA	2	12	146536	146547	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017279	ATTTTT	2	12	165696	165707	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017279	ATATTA	2	12	172732	172743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017279	AATATT	2	12	172874	172885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017279	AGAAGT	2	12	197526	197537	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017279	AAATCT	2	12	197959	197970	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_017279	AAGAAA	2	12	198029	198040	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017279	GTTTAT	2	12	211163	211174	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017279	AAAATT	2	12	213531	213542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017279	TTTGAA	2	12	213706	213717	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017279	TATTTT	2	12	213806	213817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017279	TTAATT	2	12	228685	228696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017279	TATATT	2	12	229258	229269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017279	AAAATT	2	12	273686	273697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017279	TTTATT	2	12	307680	307691	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017279	TATTTT	2	12	368861	368872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017279	TGTGTT	2	12	376292	376303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017279	ATTTAT	2	12	400720	400731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017279	TTTATT	2	12	404434	404445	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017279	TAAGGA	2	12	417973	417984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017279	TTTTAT	2	12	453134	453145	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017279	AATTTA	2	12	482352	482363	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017279	TTTTAA	2	12	527300	527311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017279	GCAAGA	2	12	532935	532946	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017279	AATACA	2	12	534046	534057	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_017279	ATATTT	2	12	582963	582974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017279	TAATAG	2	12	620148	620159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017279	TACAAA	2	12	631258	631269	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_017279	TTTATT	2	12	639226	639237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017279	TAAATT	2	12	639295	639306	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017279	ATTTTT	2	12	645474	645485	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017279	ATAATT	2	12	672951	672962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017279	TTAAAT	2	12	692533	692544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017279	TAACTT	2	12	698590	698601	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_017279	AATTTA	2	12	699135	699146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017279	ATTTAT	2	12	702007	702018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017279	TCTTAT	2	12	705695	705706	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_017279	GGGTTG	2	12	706052	706063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017279	GTTTGG	2	12	706234	706245	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017279	AATTAA	2	12	707538	707549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017279	TCAAAA	2	12	707570	707581	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_017279	TTAGCT	2	12	708019	708030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017279	CTTCTA	2	12	708037	708048	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017279	AAATTT	2	12	772477	772488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017279	AATTTT	2	12	785775	785786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017279	ATATTT	2	12	809760	809771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017279	AAATTA	2	12	813553	813564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017279	ACAAAG	2	12	826379	826390	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_017279	TTTTTA	2	12	828856	828867	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017279	AATAAA	2	12	875252	875263	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017279	ATCTTA	2	12	904407	904418	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_017279	ATCTTA	2	12	909622	909633	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017279	TATAAA	2	12	909879	909890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017279	ATCTTA	2	12	909905	909916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_017279	ATTTTA	2	12	1032330	1032341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017279	TTAATT	2	12	1132545	1132556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017279	TTAATT	2	12	1160532	1160543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017279	AATTTT	2	12	1195991	1196002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017279	CTTTAT	2	12	1243965	1243976	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_017279	CAAAAA	2	12	1317645	1317656	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_017279	TTAATT	2	12	1327696	1327707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017279	TTTACT	2	12	1330997	1331008	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_017279	AAATGA	2	12	1331608	1331619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017279	AAAGAA	2	12	1331624	1331635	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017279	AGTGCA	2	12	1335388	1335399	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_017279	TATAAT	2	12	1457259	1457270	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017279	TAGCTT	2	12	1487851	1487862	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017279	ATAAAA	2	12	1489337	1489348	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017279	TAAAAA	2	12	1522707	1522718	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017279	ATTTTT	2	12	1580887	1580898	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017279	TAAAAA	2	12	1623750	1623761	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017279	TTAAAT	2	12	1631470	1631481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017279	AAGCCT	2	12	1631601	1631612	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.