MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	AAACGA	2	12	42	53	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384447321
2	NC_017279	TGCAAA	2	12	1689	1700	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384447322
3	NC_017279	TTTAGT	2	12	2047	2058	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447322
4	NC_017279	AAGCTA	2	12	3666	3677	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	384447323
5	NC_017279	AAGTGA	2	12	3811	3822	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384447323
6	NC_017279	ATGCTA	2	12	9432	9443	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384447327
7	NC_017279	ATTTAA	2	12	10236	10247	50 %	50 %	0 %	0 %	384447327
8	NC_017279	GAAAAT	2	12	13085	13096	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384447328
9	NC_017279	TATTGC	2	12	13414	13425	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447328
10	NC_017279	AAATGA	2	12	14200	14211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384447328
11	NC_017279	GCTTTA	2	12	16567	16578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447331
12	NC_017279	TTTTCA	2	12	17147	17158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384447332
13	NC_017279	ATGGGT	2	12	18925	18936	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384447333
14	NC_017279	TTCATT	2	12	20077	20088	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384447335
15	NC_017279	AAGAAA	2	12	21291	21302	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384447336
16	NC_017279	AAGATA	2	12	22210	22221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384447337
17	NC_017279	AGCAAA	2	12	22993	23004	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384447337
18	NC_017279	TTTTCT	2	12	23500	23511	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384447338
19	NC_017279	TTATGC	2	12	29357	29368	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447343
20	NC_017279	CTTTAA	2	12	31604	31615	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384447344
21	NC_017279	CTATTT	2	12	31724	31735	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384447344
22	NC_017279	ATGTGT	2	12	32418	32429	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	384447345
23	NC_017279	ATGGAT	2	12	36285	36296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384447348
24	NC_017279	GAAATT	2	12	36494	36505	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384447348
25	NC_017279	AACAAA	2	12	45586	45597	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	384447351
26	NC_017279	TTGATT	2	12	49631	49642	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447352
27	NC_017279	TTTTTG	2	12	50239	50250	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384447353
28	NC_017279	TACACT	2	12	52787	52798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447354
29	NC_017279	ATGAAA	2	12	54536	54547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384447356
30	NC_017279	TAAACT	2	12	55068	55079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384447356
31	NC_017279	AGTTTT	2	12	57250	57261	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447358
32	NC_017279	TTCTTT	2	12	57466	57477	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384447359
33	NC_017279	CGCCTT	2	12	57871	57882	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384447359
34	NC_017279	CCAATG	2	12	61294	61305	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	384447361
35	NC_017279	CAAAAT	2	12	61410	61421	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384447361
36	NC_017279	TTCATC	2	12	62344	62355	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384447362
37	NC_017279	TAATTT	2	12	64138	64149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447364
38	NC_017279	ATTTTA	2	12	64390	64401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447364
39	NC_017279	AAATAT	2	12	64747	64758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447364
40	NC_017279	GTTGGA	2	12	65687	65698	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	384447364
41	NC_017279	GTTTTT	2	12	65832	65843	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384447364
42	NC_017279	TAGCTT	2	12	74611	74622	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447373
43	NC_017279	TTCATT	2	12	76970	76981	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384447376
44	NC_017279	CATCTT	2	12	78716	78727	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384447377
45	NC_017279	TTTAAA	2	12	81136	81147	50 %	50 %	0 %	0 %	384447380
46	NC_017279	CTAGCT	2	12	81568	81579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	384447381
47	NC_017279	GAATGA	2	12	81822	81833	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384447381
48	NC_017279	GATGCT	2	12	82984	82995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384447382
49	NC_017279	TAAATT	2	12	84698	84709	50 %	50 %	0 %	0 %	384447385
50	NC_017279	TTTTTG	2	12	91560	91571	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384447392
51	NC_017279	GAATTT	2	12	91880	91891	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384447393
52	NC_017279	AACTCA	2	12	92395	92406	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	384447393
53	NC_017279	ATTTAT	2	12	93956	93967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447394
54	NC_017279	CTTTAA	2	12	94175	94186	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384447394
55	NC_017279	ATATTT	2	12	94935	94946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384447395
56	NC_017279	GTAACT	2	12	97344	97355	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384447397
57	NC_017279	CAGGAA	2	12	98050	98061	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384447398
58	NC_017279	TTGTGT	2	12	98636	98647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384447398
59	NC_017279	ATAAAA	2	12	100461	100472	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384447399
60	NC_017279	TTAATG	2	12	102678	102689	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	384447402
61	NC_017279	GCAAGC	2	12	102758	102769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384447402
62	NC_017279	AACTTA	2	12	105496	105507	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384447406
63	NC_017279	GAACTT	2	12	107746	107757	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384447408
64	NC_017279	TTAGAA	2	12	107797	107808	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	384447408
65	NC_017279	TGGCTG	2	12	108635	108646	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384447410
66	NC_017279	AAAAAT	2	12	110100	110111	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384447411
67	NC_017279	AAAATA	2	12	117617	117628	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384447421
68	NC_017279	ATTTTG	2	12	119154	119165	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447423
69	NC_017279	GAAAAA	2	12	120061	120072	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384447424
70	NC_017279	GTTGTG	2	12	120908	120919	0 %	50 %	50 %	0 %	384447425
71	NC_017279	GGACAT	2	12	120949	120960	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384447425
72	NC_017279	CGGTTG	2	12	120987	120998	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384447425
73	NC_017279	TTTGAT	2	12	122534	122545	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447427
74	NC_017279	TTCTTT	2	12	131677	131688	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	384447439
75	NC_017279	GGGCTT	2	12	132356	132367	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384447440
76	NC_017279	AAAGAT	2	12	135428	135439	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384447442
77	NC_017279	GCTTTA	2	12	136737	136748	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447444
78	NC_017279	TTGTTA	2	12	137528	137539	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447446
79	NC_017279	AAAGAA	2	12	137667	137678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384447446
80	NC_017279	GAAAAA	2	12	140362	140373	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384447448
81	NC_017279	ACCTTT	2	12	143898	143909	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384447450
82	NC_017279	AGCTAT	2	12	143950	143961	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384447451
83	NC_017279	CTATAC	2	12	144546	144557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447451
84	NC_017279	TAAGGA	2	12	148900	148911	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384447455
85	NC_017279	TTTTAC	2	12	150915	150926	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384447456
86	NC_017279	CTGCTC	2	12	152790	152801	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	384447459
87	NC_017279	ATTTTC	2	12	153712	153723	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384447460
88	NC_017279	AAAACT	2	12	156751	156762	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	384447463
89	NC_017279	ATAAAA	2	12	156819	156830	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384447463
90	NC_017279	TTTTGC	2	12	157375	157386	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	384447464
91	NC_017279	AGCTAT	2	12	158430	158441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384447466
92	NC_017279	GGCTAA	2	12	158829	158840	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384447466
93	NC_017279	TCAAAT	2	12	160455	160466	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384447469
94	NC_017279	AAATAA	2	12	163224	163235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384447474
95	NC_017279	ATTTTC	2	12	165296	165307	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	384447476
96	NC_017279	AGCTTT	2	12	165992	166003	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447477
97	NC_017279	GGCTGT	2	12	166634	166645	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	384447478
98	NC_017279	TATAAA	2	12	168043	168054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447481
99	NC_017279	AAAAGC	2	12	169547	169558	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384447482
100	NC_017279	AACAAG	2	12	170339	170350	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	384447483
101	NC_017279	TAAAAA	2	12	173260	173271	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	384447486
102	NC_017279	TGGAAA	2	12	173321	173332	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	384447486
103	NC_017279	TTAAAT	2	12	176088	176099	50 %	50 %	0 %	0 %	384447488
104	NC_017279	CTTTCT	2	12	176175	176186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384447488
105	NC_017279	ATTCTA	2	12	178176	178187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384447491
106	NC_017279	GCTATT	2	12	178403	178414	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447491
107	NC_017279	TTGCAG	2	12	179750	179761	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	384447492
108	NC_017279	TGACTT	2	12	182439	182450	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384447495
109	NC_017279	AAAACC	2	12	183543	183554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384447497
110	NC_017279	CAAGGA	2	12	185913	185924	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	384447499
111	NC_017279	AATGAA	2	12	190316	190327	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	384447504
112	NC_017279	AAGTGC	2	12	191521	191532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	384447504
113	NC_017279	CCTAAT	2	12	191540	191551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384447504
114	NC_017279	CTTACT	2	12	193140	193151	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	384447506
115	NC_017279	ATTAAA	2	12	194519	194530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384447507
116	NC_017279	ATCAAT	2	12	195264	195275	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	384447508
117	NC_017279	TTTTAG	2	12	208501	208512	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	384447514
118	NC_017279	AAAGAA	2	12	208640	208651	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	384447515
119	NC_017279	TGAACT	2	12	214049	214060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	384447517
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465	NC_017279	GTGTTT	2	12	808937	808948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384448121
466	NC_017279	TTGTTT	2	12	809599	809610	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	384448122
467	NC_017279	TTATCA	2	12	812170	812181	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384448125
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