MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni IA3902 chromosome

Total Repeats: 1652

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017279	CAAAG	2	10	94	103	60 %	0 %	20 %	20 %	384447321
2	NC_017279	AAAGA	2	10	1009	1018	80 %	0 %	20 %	0 %	384447321
3	NC_017279	TGAAA	2	10	1194	1203	60 %	20 %	20 %	0 %	384447321
4	NC_017279	TAAAA	2	10	1647	1656	80 %	20 %	0 %	0 %	384447322
5	NC_017279	GCTTT	2	10	3329	3338	0 %	60 %	20 %	20 %	384447323
6	NC_017279	GTTTT	2	10	4923	4932	0 %	80 %	20 %	0 %	384447324
7	NC_017279	TTTTA	2	10	6527	6536	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017279	TAAAA	2	10	6619	6628	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017279	GTTTT	2	10	7487	7496	0 %	80 %	20 %	0 %	384447326
10	NC_017279	ATTTT	2	10	8704	8713	20 %	80 %	0 %	0 %	384447327
11	NC_017279	AAGAG	2	10	9736	9745	60 %	0 %	40 %	0 %	384447327
12	NC_017279	TGCTT	2	10	10045	10054	0 %	60 %	20 %	20 %	384447327
13	NC_017279	ACTTC	2	10	10398	10407	20 %	40 %	0 %	40 %	384447327
14	NC_017279	TCAAA	2	10	10960	10969	60 %	20 %	0 %	20 %	384447327
15	NC_017279	TTTTA	2	10	13052	13061	20 %	80 %	0 %	0 %	384447328
16	NC_017279	AATTT	2	10	13236	13245	40 %	60 %	0 %	0 %	384447328
17	NC_017279	TAGAT	2	10	13264	13273	40 %	40 %	20 %	0 %	384447328
18	NC_017279	TATTT	2	10	13709	13718	20 %	80 %	0 %	0 %	384447328
19	NC_017279	CTTTA	2	10	14037	14046	20 %	60 %	0 %	20 %	384447328
20	NC_017279	GACAA	2	10	15321	15330	60 %	0 %	20 %	20 %	384447329
21	NC_017279	CTTAA	2	10	16750	16759	40 %	40 %	0 %	20 %	384447332
22	NC_017279	CATTT	2	10	17300	17309	20 %	60 %	0 %	20 %	384447332
23	NC_017279	GTATT	2	10	17431	17440	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017279	GCGAT	2	10	17570	17579	20 %	20 %	40 %	20 %	384447333
25	NC_017279	AAAAT	2	10	19799	19808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017279	TTTCA	2	10	20266	20275	20 %	60 %	0 %	20 %	384447335
27	NC_017279	AAGAT	2	10	21819	21828	60 %	20 %	20 %	0 %	384447336
28	NC_017279	ACCAA	2	10	23482	23491	60 %	0 %	0 %	40 %	384447338
29	NC_017279	AAAAT	2	10	23623	23632	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017279	GTTAA	2	10	23650	23659	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017279	TTTAT	2	10	27412	27421	20 %	80 %	0 %	0 %	384447342
32	NC_017279	ATGGT	2	10	27621	27630	20 %	40 %	40 %	0 %	384447342
33	NC_017279	TTCTT	2	10	28167	28176	0 %	80 %	0 %	20 %	384447342
34	NC_017279	AGATA	2	10	29925	29934	60 %	20 %	20 %	0 %	384447344
35	NC_017279	GCTTT	2	10	30439	30448	0 %	60 %	20 %	20 %	384447344
36	NC_017279	ATCAA	2	10	31046	31055	60 %	20 %	0 %	20 %	384447344
37	NC_017279	ATACT	2	10	31848	31857	40 %	40 %	0 %	20 %	384447344
38	NC_017279	AATCC	2	10	32299	32308	40 %	20 %	0 %	40 %	384447345
39	NC_017279	TGTTT	2	10	33286	33295	0 %	80 %	20 %	0 %	384447345
40	NC_017279	GCAAA	2	10	33353	33362	60 %	0 %	20 %	20 %	384447345
41	NC_017279	GAAAT	2	10	33771	33780	60 %	20 %	20 %	0 %	384447346
42	NC_017279	AAAGT	2	10	34255	34264	60 %	20 %	20 %	0 %	384447346
43	NC_017279	AAAAT	2	10	35507	35516	80 %	20 %	0 %	0 %	384447347
44	NC_017279	ATTAT	2	10	36252	36261	40 %	60 %	0 %	0 %	384447348
45	NC_017279	AAATC	2	10	36922	36931	60 %	20 %	0 %	20 %	384447348
46	NC_017279	TATAT	2	10	38744	38753	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017279	CTTTT	2	10	39031	39040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_017279	CTTTT	2	10	39201	39210	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_017279	GGTAA	2	10	39513	39522	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017279	TCGTG	2	10	40309	40318	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_017279	TCTTT	2	10	41337	41346	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_017279	TAACT	2	10	41351	41360	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_017279	CCGTA	2	10	43195	43204	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_017279	AAAAT	2	10	45310	45319	80 %	20 %	0 %	0 %	384447350
55	NC_017279	TTGAC	2	10	46841	46850	20 %	40 %	20 %	20 %	384447352
56	NC_017279	AAGAA	2	10	47745	47754	80 %	0 %	20 %	0 %	384447352
57	NC_017279	ATGTT	2	10	47843	47852	20 %	60 %	20 %	0 %	384447352
58	NC_017279	AAAAG	2	10	50356	50365	80 %	0 %	20 %	0 %	384447353
59	NC_017279	AAAAT	2	10	51847	51856	80 %	20 %	0 %	0 %	384447353
60	NC_017279	AGCTT	2	10	52180	52189	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_017279	CAAAT	2	10	54229	54238	60 %	20 %	0 %	20 %	384447356
62	NC_017279	ACAAA	2	10	55257	55266	80 %	0 %	0 %	20 %	384447356
63	NC_017279	TACTC	2	10	56509	56518	20 %	40 %	0 %	40 %	384447357
64	NC_017279	GATAA	2	10	56907	56916	60 %	20 %	20 %	0 %	384447358
65	NC_017279	CTTTT	2	10	57991	58000	0 %	80 %	0 %	20 %	384447359
66	NC_017279	TTTCA	2	10	58238	58247	20 %	60 %	0 %	20 %	384447359
67	NC_017279	AAGAT	2	10	59630	59639	60 %	20 %	20 %	0 %	384447360
68	NC_017279	TAATG	2	10	59682	59691	40 %	40 %	20 %	0 %	384447360
69	NC_017279	GATAA	2	10	60009	60018	60 %	20 %	20 %	0 %	384447361
70	NC_017279	AAATT	2	10	60918	60927	60 %	40 %	0 %	0 %	384447361
71	NC_017279	TACTA	2	10	62774	62783	40 %	40 %	0 %	20 %	384447363
72	NC_017279	TGCTT	2	10	63568	63577	0 %	60 %	20 %	20 %	384447363
73	NC_017279	AATAT	2	10	63753	63762	60 %	40 %	0 %	0 %	384447363
74	NC_017279	CATTT	2	10	64352	64361	20 %	60 %	0 %	20 %	384447364
75	NC_017279	AATTT	2	10	64366	64375	40 %	60 %	0 %	0 %	384447364
76	NC_017279	ATTTC	2	10	64468	64477	20 %	60 %	0 %	20 %	384447364
77	NC_017279	TGATT	2	10	64519	64528	20 %	60 %	20 %	0 %	384447364
78	NC_017279	TTTTA	2	10	64586	64595	20 %	80 %	0 %	0 %	384447364
79	NC_017279	GATAA	2	10	65520	65529	60 %	20 %	20 %	0 %	384447364
80	NC_017279	TCAAA	2	10	66071	66080	60 %	20 %	0 %	20 %	384447365
81	NC_017279	TGTGT	2	10	66566	66575	0 %	60 %	40 %	0 %	384447365
82	NC_017279	AAAAT	2	10	66746	66755	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017279	ATTAC	2	10	67102	67111	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_017279	AAAAT	2	10	67808	67817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017279	ATATT	2	10	70086	70095	40 %	60 %	0 %	0 %	384447367
86	NC_017279	CAAGA	2	10	72530	72539	60 %	0 %	20 %	20 %	384447370
87	NC_017279	GAGCA	2	10	72902	72911	40 %	0 %	40 %	20 %	384447370
88	NC_017279	ATCAA	2	10	73381	73390	60 %	20 %	0 %	20 %	384447371
89	NC_017279	CTCTT	2	10	76376	76385	0 %	60 %	0 %	40 %	384447375
90	NC_017279	TTTTC	2	10	76417	76426	0 %	80 %	0 %	20 %	384447375
91	NC_017279	TCTCT	2	10	76681	76690	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_017279	ATCTC	2	10	77232	77241	20 %	40 %	0 %	40 %	384447376
93	NC_017279	GCCAA	2	10	77370	77379	40 %	0 %	20 %	40 %	384447376
94	NC_017279	TTTTG	2	10	78614	78623	0 %	80 %	20 %	0 %	384447377
95	NC_017279	AGTAA	2	10	79187	79196	60 %	20 %	20 %	0 %	384447378
96	NC_017279	TAAGG	2	10	83088	83097	40 %	20 %	40 %	0 %	384447382
97	NC_017279	ATTTT	2	10	83141	83150	20 %	80 %	0 %	0 %	384447382
98	NC_017279	TAGGA	2	10	83417	83426	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017279	AAAAT	2	10	83443	83452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017279	ATTTT	2	10	83453	83462	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017279	TAAGA	2	10	83869	83878	60 %	20 %	20 %	0 %	384447383
102	NC_017279	TTAAT	2	10	84178	84187	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017279	TATTT	2	10	84246	84255	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017279	TATAA	2	10	84263	84272	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017279	TTTGC	2	10	84942	84951	0 %	60 %	20 %	20 %	384447385
106	NC_017279	TGGAC	2	10	85291	85300	20 %	20 %	40 %	20 %	384447386
107	NC_017279	TAAAA	2	10	88039	88048	80 %	20 %	0 %	0 %	384447388
108	NC_017279	CAAAA	2	10	88572	88581	80 %	0 %	0 %	20 %	384447388
109	NC_017279	TAAAA	2	10	89011	89020	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017279	TAAAA	2	10	91282	91291	80 %	20 %	0 %	0 %	384447391
111	NC_017279	GAAAT	2	10	92154	92163	60 %	20 %	20 %	0 %	384447393
112	NC_017279	TGGTT	2	10	92338	92347	0 %	60 %	40 %	0 %	384447393
113	NC_017279	TCCAT	2	10	92951	92960	20 %	40 %	0 %	40 %	384447393
114	NC_017279	TATTT	2	10	93498	93507	20 %	80 %	0 %	0 %	384447394
115	NC_017279	TTTTA	2	10	93510	93519	20 %	80 %	0 %	0 %	384447394
116	NC_017279	TATTT	2	10	93858	93867	20 %	80 %	0 %	0 %	384447394
117	NC_017279	TTGGC	2	10	94372	94381	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_017279	AAGAT	2	10	94459	94468	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017279	GTAAA	2	10	95108	95117	60 %	20 %	20 %	0 %	384447395
120	NC_017279	AGAAT	2	10	95638	95647	60 %	20 %	20 %	0 %	384447396
121	NC_017279	AAGAA	2	10	96320	96329	80 %	0 %	20 %	0 %	384447397
122	NC_017279	CCTTG	2	10	96761	96770	0 %	40 %	20 %	40 %	384447397
123	NC_017279	AGGTA	2	10	97277	97286	40 %	20 %	40 %	0 %	384447397
124	NC_017279	GTGCA	2	10	98935	98944	20 %	20 %	40 %	20 %	384447398
125	NC_017279	ACCTT	2	10	100046	100055	20 %	40 %	0 %	40 %	384447399
126	NC_017279	TATTT	2	10	100561	100570	20 %	80 %	0 %	0 %	384447400
127	NC_017279	TCAAA	2	10	100619	100628	60 %	20 %	0 %	20 %	384447400
128	NC_017279	TTAGA	2	10	100890	100899	40 %	40 %	20 %	0 %	384447400
129	NC_017279	GCTTT	2	10	100981	100990	0 %	60 %	20 %	20 %	384447401
130	NC_017279	GTTTA	2	10	101498	101507	20 %	60 %	20 %	0 %	384447401
131	NC_017279	TAAAA	2	10	101563	101572	80 %	20 %	0 %	0 %	384447401
132	NC_017279	AAATG	2	10	101749	101758	60 %	20 %	20 %	0 %	384447402
133	NC_017279	AGGCA	2	10	102385	102394	40 %	0 %	40 %	20 %	384447402
134	NC_017279	TAAAA	2	10	102748	102757	80 %	20 %	0 %	0 %	384447402
135	NC_017279	AAATT	2	10	103743	103752	60 %	40 %	0 %	0 %	384447403
136	NC_017279	AAAGC	2	10	104438	104447	60 %	0 %	20 %	20 %	384447404
137	NC_017279	AAGAA	2	10	105812	105821	80 %	0 %	20 %	0 %	384447406
138	NC_017279	ACTCA	2	10	107952	107961	40 %	20 %	0 %	40 %	384447409
139	NC_017279	TTTTG	2	10	111290	111299	0 %	80 %	20 %	0 %	384447414
140	NC_017279	ATTTC	2	10	113409	113418	20 %	60 %	0 %	20 %	384447416
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