MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 4363

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017278	AGGG	2	8	180	187	25 %	0 %	75 %	0 %	384438401
2	NC_017278	GCCC	2	8	365	372	0 %	0 %	25 %	75 %	384438401
3	NC_017278	CGCC	2	8	962	969	0 %	0 %	25 %	75 %	384438401
4	NC_017278	CGGC	2	8	1178	1185	0 %	0 %	50 %	50 %	384438401
5	NC_017278	ACCT	2	8	1777	1784	25 %	25 %	0 %	50 %	384438402
6	NC_017278	GCCT	2	8	1925	1932	0 %	25 %	25 %	50 %	384438402
7	NC_017278	GCGG	2	8	2475	2482	0 %	0 %	75 %	25 %	384438402
8	NC_017278	GGGC	2	8	2973	2980	0 %	0 %	75 %	25 %	384438403
9	NC_017278	GGGT	2	8	3412	3419	0 %	25 %	75 %	0 %	384438403
10	NC_017278	GAGG	2	8	3486	3493	25 %	0 %	75 %	0 %	384438403
11	NC_017278	GCGG	2	8	3554	3561	0 %	0 %	75 %	25 %	384438403
12	NC_017278	GGCC	2	8	4312	4319	0 %	0 %	50 %	50 %	384438404
13	NC_017278	GGGA	2	8	4373	4380	25 %	0 %	75 %	0 %	384438404
14	NC_017278	TTTC	2	8	4706	4713	0 %	75 %	0 %	25 %	384438404
15	NC_017278	CCGC	2	8	6510	6517	0 %	0 %	25 %	75 %	384438406
16	NC_017278	GCCC	2	8	6581	6588	0 %	0 %	25 %	75 %	384438406
17	NC_017278	ACCC	2	8	7044	7051	25 %	0 %	0 %	75 %	384438407
18	NC_017278	CAGG	2	8	7913	7920	25 %	0 %	50 %	25 %	384438407
19	NC_017278	GCCC	2	8	8222	8229	0 %	0 %	25 %	75 %	384438407
20	NC_017278	GCGG	2	8	8930	8937	0 %	0 %	75 %	25 %	384438409
21	NC_017278	ACCC	2	8	9945	9952	25 %	0 %	0 %	75 %	384438410
22	NC_017278	TGGC	2	8	11075	11082	0 %	25 %	50 %	25 %	384438410
23	NC_017278	CCAG	2	8	11244	11251	25 %	0 %	25 %	50 %	384438411
24	NC_017278	AGGG	2	8	12489	12496	25 %	0 %	75 %	0 %	384438412
25	NC_017278	AGCC	2	8	12855	12862	25 %	0 %	25 %	50 %	384438412
26	NC_017278	GCCA	2	8	12881	12888	25 %	0 %	25 %	50 %	384438412
27	NC_017278	GGGC	2	8	14326	14333	0 %	0 %	75 %	25 %	384438415
28	NC_017278	GCCC	2	8	14901	14908	0 %	0 %	25 %	75 %	384438415
29	NC_017278	CGGG	2	8	14919	14926	0 %	0 %	75 %	25 %	384438415
30	NC_017278	GGTG	2	8	15409	15416	0 %	25 %	75 %	0 %	384438416
31	NC_017278	GCAG	2	8	16580	16587	25 %	0 %	50 %	25 %	384438417
32	NC_017278	CGGA	2	8	16917	16924	25 %	0 %	50 %	25 %	384438418
33	NC_017278	CGGT	2	8	17100	17107	0 %	25 %	50 %	25 %	384438418
34	NC_017278	GGGC	2	8	17275	17282	0 %	0 %	75 %	25 %	384438418
35	NC_017278	AGGG	2	8	17908	17915	25 %	0 %	75 %	0 %	384438419
36	NC_017278	GCGG	2	8	18030	18037	0 %	0 %	75 %	25 %	384438419
37	NC_017278	CCCG	2	8	18894	18901	0 %	0 %	25 %	75 %	384438420
38	NC_017278	TCCC	2	8	19843	19850	0 %	25 %	0 %	75 %	384438420
39	NC_017278	CGCT	2	8	21511	21518	0 %	25 %	25 %	50 %	384438423
40	NC_017278	GCCC	2	8	21615	21622	0 %	0 %	25 %	75 %	384438423
41	NC_017278	GCCG	2	8	21833	21840	0 %	0 %	50 %	50 %	384438423
42	NC_017278	GCGG	2	8	22305	22312	0 %	0 %	75 %	25 %	384438424
43	NC_017278	GGCC	2	8	22885	22892	0 %	0 %	50 %	50 %	384438425
44	NC_017278	GTGG	2	8	23302	23309	0 %	25 %	75 %	0 %	384438425
45	NC_017278	CGGG	2	8	24639	24646	0 %	0 %	75 %	25 %	384438427
46	NC_017278	CCGC	2	8	24794	24801	0 %	0 %	25 %	75 %	384438427
47	NC_017278	CCAC	2	8	24949	24956	25 %	0 %	0 %	75 %	384438427
48	NC_017278	ACCA	2	8	25508	25515	50 %	0 %	0 %	50 %	384438428
49	NC_017278	GCGG	2	8	26085	26092	0 %	0 %	75 %	25 %	384438429
50	NC_017278	CCTC	2	8	26471	26478	0 %	25 %	0 %	75 %	384438429
51	NC_017278	GCGG	2	8	27154	27161	0 %	0 %	75 %	25 %	384438430
52	NC_017278	GGGC	2	8	27480	27487	0 %	0 %	75 %	25 %	384438430
53	NC_017278	GAGG	2	8	28316	28323	25 %	0 %	75 %	0 %	384438431
54	NC_017278	CGCC	2	8	29156	29163	0 %	0 %	25 %	75 %	384438433
55	NC_017278	CCAC	2	8	29254	29261	25 %	0 %	0 %	75 %	384438433
56	NC_017278	GGAC	2	8	29353	29360	25 %	0 %	50 %	25 %	384438433
57	NC_017278	AGGC	2	8	29780	29787	25 %	0 %	50 %	25 %	384438434
58	NC_017278	AGCC	2	8	30247	30254	25 %	0 %	25 %	50 %	384438435
59	NC_017278	CCCG	2	8	30319	30326	0 %	0 %	25 %	75 %	384438435
60	NC_017278	AAGG	2	8	31069	31076	50 %	0 %	50 %	0 %	384438435
61	NC_017278	GCTG	2	8	32197	32204	0 %	25 %	50 %	25 %	384438436
62	NC_017278	CTCC	2	8	32366	32373	0 %	25 %	0 %	75 %	384438436
63	NC_017278	CCTT	2	8	33444	33451	0 %	50 %	0 %	50 %	384438438
64	NC_017278	GCGG	2	8	33579	33586	0 %	0 %	75 %	25 %	384438439
65	NC_017278	CGCC	2	8	33609	33616	0 %	0 %	25 %	75 %	384438439
66	NC_017278	GCGG	2	8	34026	34033	0 %	0 %	75 %	25 %	384438439
67	NC_017278	CCCA	2	8	34554	34561	25 %	0 %	0 %	75 %	384438441
68	NC_017278	CTCC	2	8	36039	36046	0 %	25 %	0 %	75 %	384438442
69	NC_017278	CCTT	2	8	36109	36116	0 %	50 %	0 %	50 %	384438442
70	NC_017278	CCTC	2	8	38132	38139	0 %	25 %	0 %	75 %	384438442
71	NC_017278	GGCA	2	8	38159	38166	25 %	0 %	50 %	25 %	384438442
72	NC_017278	GGCG	2	8	39012	39019	0 %	0 %	75 %	25 %	384438443
73	NC_017278	CACC	2	8	39225	39232	25 %	0 %	0 %	75 %	384438443
74	NC_017278	AGGC	2	8	41679	41686	25 %	0 %	50 %	25 %	384438445
75	NC_017278	AGGC	2	8	41782	41789	25 %	0 %	50 %	25 %	384438445
76	NC_017278	GGGC	2	8	41919	41926	0 %	0 %	75 %	25 %	384438446
77	NC_017278	GGGT	2	8	42390	42397	0 %	25 %	75 %	0 %	384438446
78	NC_017278	GAAG	2	8	43293	43300	50 %	0 %	50 %	0 %	384438447
79	NC_017278	CCCA	2	8	43451	43458	25 %	0 %	0 %	75 %	384438447
80	NC_017278	CCCT	2	8	43662	43669	0 %	25 %	0 %	75 %	384438447
81	NC_017278	GGCC	2	8	43787	43794	0 %	0 %	50 %	50 %	384438447
82	NC_017278	CCAG	2	8	44389	44396	25 %	0 %	25 %	50 %	384438449
83	NC_017278	GCCC	2	8	44963	44970	0 %	0 %	25 %	75 %	384438449
84	NC_017278	CCGC	2	8	46184	46191	0 %	0 %	25 %	75 %	384438450
85	NC_017278	CTGG	2	8	46206	46213	0 %	25 %	50 %	25 %	384438450
86	NC_017278	CCTG	2	8	48079	48086	0 %	25 %	25 %	50 %	384438451
87	NC_017278	GGCC	2	8	48550	48557	0 %	0 %	50 %	50 %	384438451
88	NC_017278	CGGG	2	8	48890	48897	0 %	0 %	75 %	25 %	384438452
89	NC_017278	TGGC	2	8	49633	49640	0 %	25 %	50 %	25 %	384438452
90	NC_017278	CGCC	2	8	49697	49704	0 %	0 %	25 %	75 %	384438452
91	NC_017278	CGCC	2	8	49871	49878	0 %	0 %	25 %	75 %	384438452
92	NC_017278	CACC	2	8	50560	50567	25 %	0 %	0 %	75 %	384438453
93	NC_017278	AGGC	2	8	51321	51328	25 %	0 %	50 %	25 %	384438453
94	NC_017278	CGGG	2	8	51345	51352	0 %	0 %	75 %	25 %	384438453
95	NC_017278	AGGG	2	8	52206	52213	25 %	0 %	75 %	0 %	384438453
96	NC_017278	CACC	2	8	52290	52297	25 %	0 %	0 %	75 %	384438454
97	NC_017278	CCGC	2	8	52523	52530	0 %	0 %	25 %	75 %	384438454
98	NC_017278	GGGC	2	8	54257	54264	0 %	0 %	75 %	25 %	384438455
99	NC_017278	TGGC	2	8	55218	55225	0 %	25 %	50 %	25 %	384438455
100	NC_017278	CCTA	2	8	55495	55502	25 %	25 %	0 %	50 %	384438455
101	NC_017278	GAGG	2	8	55946	55953	25 %	0 %	75 %	0 %	384438456
102	NC_017278	AGCC	2	8	57122	57129	25 %	0 %	25 %	50 %	384438457
103	NC_017278	TCAG	2	8	57472	57479	25 %	25 %	25 %	25 %	384438458
104	NC_017278	CGTC	2	8	60357	60364	0 %	25 %	25 %	50 %	384438459
105	NC_017278	CTTC	2	8	60413	60420	0 %	50 %	0 %	50 %	384438459
106	NC_017278	AGCT	2	8	60707	60714	25 %	25 %	25 %	25 %	384438459
107	NC_017278	CAGG	2	8	61248	61255	25 %	0 %	50 %	25 %	384438459
108	NC_017278	GCTC	2	8	61293	61300	0 %	25 %	25 %	50 %	384438459
109	NC_017278	AGGC	2	8	62335	62342	25 %	0 %	50 %	25 %	384438460
110	NC_017278	AGCT	2	8	62347	62354	25 %	25 %	25 %	25 %	384438460
111	NC_017278	AGCC	2	8	62911	62918	25 %	0 %	25 %	50 %	384438460
112	NC_017278	GGAG	2	8	62919	62926	25 %	0 %	75 %	0 %	384438460
113	NC_017278	CCAC	2	8	63132	63139	25 %	0 %	0 %	75 %	384438460
114	NC_017278	ACAG	2	8	63268	63275	50 %	0 %	25 %	25 %	384438461
115	NC_017278	TCCT	2	8	63370	63377	0 %	50 %	0 %	50 %	384438461
116	NC_017278	CCCG	2	8	63481	63488	0 %	0 %	25 %	75 %	384438461
117	NC_017278	CCAG	2	8	63992	63999	25 %	0 %	25 %	50 %	384438461
118	NC_017278	AAAG	2	8	64502	64509	75 %	0 %	25 %	0 %	384438461
119	NC_017278	GAAG	2	8	64530	64537	50 %	0 %	50 %	0 %	384438461
120	NC_017278	CCGT	2	8	66112	66119	0 %	25 %	25 %	50 %	384438462
121	NC_017278	CAGG	2	8	66225	66232	25 %	0 %	50 %	25 %	384438462
122	NC_017278	CGTC	2	8	66245	66252	0 %	25 %	25 %	50 %	384438462
123	NC_017278	CCGC	2	8	67702	67709	0 %	0 %	25 %	75 %	384438464
124	NC_017278	AGCC	2	8	67751	67758	25 %	0 %	25 %	50 %	384438464
125	NC_017278	CTTC	2	8	67973	67980	0 %	50 %	0 %	50 %	384438464
126	NC_017278	CACG	2	8	68432	68439	25 %	0 %	25 %	50 %	384438464
127	NC_017278	CGGG	2	8	68580	68587	0 %	0 %	75 %	25 %	384438464
128	NC_017278	AGGA	2	8	68953	68960	50 %	0 %	50 %	0 %	384438465
129	NC_017278	GGGC	2	8	69139	69146	0 %	0 %	75 %	25 %	384438465
130	NC_017278	ACCC	2	8	70032	70039	25 %	0 %	0 %	75 %	384438465
131	NC_017278	TTGT	2	8	70507	70514	0 %	75 %	25 %	0 %	384438465
132	NC_017278	CCGC	2	8	70515	70522	0 %	0 %	25 %	75 %	384438465
133	NC_017278	CAGG	2	8	70863	70870	25 %	0 %	50 %	25 %	384438465
134	NC_017278	AGGA	2	8	72590	72597	50 %	0 %	50 %	0 %	384438465
135	NC_017278	CCAG	2	8	73658	73665	25 %	0 %	25 %	50 %	384438465
136	NC_017278	GCCA	2	8	74506	74513	25 %	0 %	25 %	50 %	384438466
137	NC_017278	GAGG	2	8	74698	74705	25 %	0 %	75 %	0 %	384438466
138	NC_017278	TGGA	2	8	75683	75690	25 %	25 %	50 %	0 %	384438466
139	NC_017278	AGGT	2	8	75789	75796	25 %	25 %	50 %	0 %	384438466
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