MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus sp. CCB_US3_UF1 chromosome

Total Repeats: 1550

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017278	CTA	3	9	1615	1623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017278	TAG	3	9	1657	1665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017278	AGG	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017278	GGC	2	6	2856	2861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017278	AGG	2	6	2866	2871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017278	GGA	2	6	9256	9261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017278	TAC	2	6	13330	13335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_017278	AGG	2	6	26835	26840	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017278	GAC	2	6	31751	31756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_017278	CCT	2	6	40372	40377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_017278	TTA	2	6	40743	40748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017278	CCT	2	6	44221	44226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_017278	CCT	2	6	44244	44249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_017278	GAG	2	6	44253	44258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017278	GAG	2	6	48618	48623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017278	CCA	2	6	56473	56478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_017278	CAC	2	6	56555	56560	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_017278	GGC	2	6	56562	56567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017278	GCC	2	6	56627	56632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_017278	CAC	2	6	56633	56638	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_017278	GTG	2	6	56748	56753	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017278	CCT	2	6	56795	56800	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_017278	CCA	2	6	56925	56930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_017278	GAA	2	6	57909	57914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017278	GCT	2	6	58042	58047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017278	GGC	2	6	58110	58115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017278	GGA	2	6	58192	58197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017278	GTT	2	6	58541	58546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017278	CAA	2	6	58579	58584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017278	TCT	2	6	58619	58624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017278	CTG	2	6	59089	59094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017278	CTA	2	6	59149	59154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_017278	CCT	2	6	59192	59197	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_017278	CTG	2	6	59220	59225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017278	CCT	2	6	59375	59380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_017278	TAA	2	6	59413	59418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017278	GAA	2	6	59458	59463	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017278	TCT	2	6	59583	59588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_017278	TCC	2	6	59832	59837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_017278	TCC	2	6	61593	61598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_017278	AGG	2	6	61690	61695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017278	CTC	2	6	61793	61798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_017278	TAC	2	6	61812	61817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017278	CCT	2	6	63200	63205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017278	CCT	2	6	65156	65161	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_017278	TTC	2	6	65182	65187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017278	CTT	2	6	65201	65206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_017278	TAG	2	6	65354	65359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017278	TTC	2	6	65485	65490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_017278	AGT	2	6	67102	67107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017278	GGA	2	6	67392	67397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017278	TCC	2	6	67427	67432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017278	ACC	2	6	67538	67543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_017278	AGG	2	6	67588	67593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017278	AGG	2	6	74286	74291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017278	TCC	2	6	83084	83089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_017278	CTA	2	6	83484	83489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_017278	TCC	2	6	83588	83593	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_017278	CTA	2	6	83838	83843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_017278	ACC	2	6	83846	83851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_017278	GAG	2	6	83872	83877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017278	GTC	2	6	83934	83939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017278	CCT	2	6	84220	84225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_017278	CCT	2	6	86187	86192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_017278	ACG	2	6	86213	86218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017278	GCC	2	6	86283	86288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017278	AAG	2	6	86404	86409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017278	CCT	2	6	86472	86477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_017278	GCA	2	6	86528	86533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017278	TTC	2	6	86539	86544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017278	ATC	2	6	87971	87976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017278	GCC	2	6	88013	88018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017278	GCG	2	6	88087	88092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017278	TGA	2	6	88333	88338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017278	CTC	2	6	88347	88352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_017278	GGT	2	6	90484	90489	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017278	CCG	2	6	90516	90521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_017278	GCA	2	6	90622	90627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017278	TTC	2	6	90636	90641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_017278	CTG	2	6	90969	90974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_017278	GAG	2	6	91187	91192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017278	GCC	2	6	91196	91201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_017278	CTA	2	6	97760	97765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_017278	TAG	2	6	97829	97834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017278	TCC	2	6	102379	102384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017278	GAG	2	6	102468	102473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017278	AGG	2	6	102506	102511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017278	ACC	2	6	106302	106307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_017278	AGG	2	6	111755	111760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017278	CCG	2	6	114706	114711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_017278	AGG	2	6	121183	121188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017278	ACC	2	6	130354	130359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017278	GGT	2	6	130408	130413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017278	CCA	2	6	130463	130468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017278	GGC	2	6	130582	130587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017278	GAG	2	6	130591	130596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017278	GCC	2	6	130671	130676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_017278	GGA	2	6	130702	130707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017278	GAC	2	6	131772	131777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_017278	CTC	2	6	131787	131792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017278	TGG	2	6	131820	131825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017278	ACC	2	6	133507	133512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_017278	TTG	3	9	133559	133567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017278	CCT	2	6	133676	133681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_017278	TGC	2	6	133710	133715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_017278	GGC	2	6	142028	142033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017278	GTC	2	6	144732	144737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017278	TGC	2	6	144800	144805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017278	CAA	2	6	146212	146217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017278	GCT	2	6	146219	146224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017278	CGG	2	6	146242	146247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_017278	GTG	2	6	146248	146253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017278	GCC	2	6	146309	146314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_017278	GGC	2	6	146318	146323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017278	GCC	2	6	146373	146378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_017278	GGT	2	6	146388	146393	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017278	GTA	2	6	147867	147872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017278	GAG	3	9	151199	151207	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017278	TTC	2	6	151595	151600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_017278	CGA	2	6	152435	152440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_017278	ATC	2	6	152476	152481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017278	GGA	2	6	152510	152515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017278	ACA	3	9	155001	155009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017278	GTG	2	6	155041	155046	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017278	TGG	2	6	155070	155075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017278	GCG	2	6	155388	155393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017278	CCT	2	6	155505	155510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_017278	GGT	2	6	155520	155525	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017278	TGG	2	6	155549	155554	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017278	CTG	2	6	155560	155565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017278	CTT	2	6	155592	155597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017278	TGG	2	6	155630	155635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017278	CTT	2	6	155706	155711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017278	GAG	2	6	155764	155769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017278	GGA	2	6	155929	155934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017278	CTC	2	6	160437	160442	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_017278	AAG	2	6	171173	171178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017278	TTG	2	6	171404	171409	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017278	TGC	2	6	171533	171538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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