MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017276	ATGAGG	2	12	936	947	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385774743
2	NC_017276	GTATTG	2	12	1830	1841	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385774743
3	NC_017276	AATTGC	2	12	2930	2941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385774745
4	NC_017276	CCTCTG	2	12	4348	4359	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385774748
5	NC_017276	ATTGAT	2	12	4856	4867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385774749
6	NC_017276	TAGTCT	2	12	5167	5178	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385774749
7	NC_017276	TACAAA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_017276	CAATGG	2	12	8239	8250	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385774753
9	NC_017276	TATTCG	2	12	13375	13386	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385774757
10	NC_017276	TGGTAT	2	12	17652	17663	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017276	GTATTT	2	12	17924	17935	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385774761
12	NC_017276	CTATTC	2	12	18103	18114	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385774761
13	NC_017276	GTCACT	2	12	25811	25822	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385774769
14	NC_017276	TCCTCT	2	12	29409	29420	0 %	50 %	0 %	50 %	385774773
15	NC_017276	TTGATT	2	12	31453	31464	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385774775
16	NC_017276	AGTGCA	2	12	31546	31557	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385774775
17	NC_017276	CTTTTC	2	12	32570	32581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017276	ACGTCT	2	12	34721	34732	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385774779
19	NC_017276	TTTATC	2	12	36402	36413	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385774781
20	NC_017276	TCAGCT	2	12	38036	38047	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385774784
21	NC_017276	TATTTA	2	12	38098	38109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017276	AAGAAA	2	12	39733	39744	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385774786
23	NC_017276	CATTGG	2	12	40051	40062	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385774787
24	NC_017276	CTTAAA	2	12	43904	43915	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385774792
25	NC_017276	ATATTC	2	12	43954	43965	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385774792
26	NC_017276	GGTGAG	2	12	45146	45157	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385774794
27	NC_017276	CTTTCT	2	12	47372	47383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385774796
28	NC_017276	TCTAGT	2	12	47968	47979	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_017276	GTTTTC	2	12	49882	49893	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385774799
30	NC_017276	TAAAAT	2	12	49957	49968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774799
31	NC_017276	TCTAAT	2	12	54002	54013	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385774803
32	NC_017276	TCTTTT	2	12	54187	54198	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385774803
33	NC_017276	CCTCGT	2	12	55451	55462	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	385774804
34	NC_017276	TATTTC	2	12	56139	56150	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385774804
35	NC_017276	CTTAAT	2	12	59178	59189	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385774807
36	NC_017276	GAGCTG	2	12	59680	59691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385774807
37	NC_017276	TGATGC	2	12	59936	59947	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385774807
38	NC_017276	AAATGT	2	12	60087	60098	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385774807
39	NC_017276	ATAGTC	2	12	64865	64876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385774812
40	NC_017276	CTAGTA	2	12	65673	65684	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385774813
41	NC_017276	AATAAA	2	12	71884	71895	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017276	CCGATA	2	12	75986	75997	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385774828
43	NC_017276	TTTCAT	2	12	78544	78555	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385774831
44	NC_017276	TAGCAT	2	12	82393	82404	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385774835
45	NC_017276	ACTTTT	2	12	90084	90095	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385774842
46	NC_017276	AATGTA	2	12	90462	90473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385774842
47	NC_017276	AGTTAA	2	12	90646	90657	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017276	CTCATT	2	12	96178	96189	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385774849
49	NC_017276	AAAGCC	2	12	96892	96903	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385774850
50	NC_017276	AGGGGT	2	12	100698	100709	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385774854
51	NC_017276	CTCATA	2	12	101956	101967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385774855
52	NC_017276	TTATGA	2	12	103879	103890	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385774858
53	NC_017276	TCTCTA	2	12	106875	106886	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385774860
54	NC_017276	GTATTA	2	12	109209	109220	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385774863
55	NC_017276	CCAATA	2	12	109559	109570	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385774864
56	NC_017276	TATGCT	2	12	110223	110234	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385774864
57	NC_017276	TATTGT	2	12	110461	110472	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385774865
58	NC_017276	TTACAA	2	12	112068	112079	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385774867
59	NC_017276	AGTATT	2	12	113726	113737	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385774868
60	NC_017276	GTTATA	2	12	115328	115339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385774871
61	NC_017276	GTATGA	2	12	116149	116160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017276	TAAACA	2	12	117262	117273	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385774873
63	NC_017276	TAGAGA	2	12	117412	117423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385774873
64	NC_017276	CACATC	2	12	124419	124430	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385774880
65	NC_017276	TAAGAG	2	12	125663	125674	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385774882
66	NC_017276	CTATCC	2	12	125767	125778	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385774882
67	NC_017276	GTAATT	2	12	127635	127646	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385774884
68	NC_017276	TGGTAT	2	12	129283	129294	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385774886
69	NC_017276	AAAATA	2	12	129999	130010	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017276	GCTAAA	2	12	132592	132603	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385774892
71	NC_017276	TTAGCT	2	12	137194	137205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385774896
72	NC_017276	TAGGAA	2	12	139727	139738	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385774898
73	NC_017276	TGGTAA	2	12	141421	141432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385774900
74	NC_017276	GGTAGT	2	12	149428	149439	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	385774909
75	NC_017276	CTAGAG	2	12	150020	150031	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385774910
76	NC_017276	CATCTT	2	12	153756	153767	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385774915
77	NC_017276	ATAAGG	2	12	159336	159347	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385774921
78	NC_017276	ACTTTT	2	12	166201	166212	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385774928
79	NC_017276	TAAGGA	2	12	172082	172093	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385774934
80	NC_017276	TTCCTC	2	12	174188	174199	0 %	50 %	0 %	50 %	385774937
81	NC_017276	AATATT	2	12	174490	174501	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017276	TTAGTT	2	12	177581	177592	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385774943
83	NC_017276	CAAATA	2	12	179392	179403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385774947
84	NC_017276	GGAGAA	2	12	185141	185152	50 %	0 %	50 %	0 %	385774952
85	NC_017276	TTGCCA	2	12	185316	185327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385774952
86	NC_017276	ATTCTC	2	12	188251	188262	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385774955
87	NC_017276	CAAAGG	2	12	190489	190500	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385774957
88	NC_017276	GGCTAA	2	12	190822	190833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385774957
89	NC_017276	TTCTAT	2	12	191156	191167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385774958
90	NC_017276	TGAGGA	2	12	192387	192398	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385774959
91	NC_017276	AATGGT	2	12	192795	192806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385774959
92	NC_017276	ACTTTT	2	12	194941	194952	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385774963
93	NC_017276	GAATAA	2	12	198094	198105	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385774969
94	NC_017276	TAATTC	2	12	203884	203895	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385774975
95	NC_017276	TCTATA	2	12	203967	203978	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385774975
96	NC_017276	CACTGC	2	12	206432	206443	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385774978
97	NC_017276	AGGTTT	2	12	206913	206924	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385774979
98	NC_017276	CCAAAT	2	12	209115	209126	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385774981
99	NC_017276	TTCCAG	2	12	209542	209553	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385774981
100	NC_017276	AATTAA	2	12	214514	214525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385774988
101	NC_017276	AGTTTT	2	12	217121	217132	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385774991
102	NC_017276	TTTACC	2	12	220096	220107	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385774993
103	NC_017276	TATTTT	2	12	220660	220671	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385774994
104	NC_017276	CAGAAG	2	12	221951	221962	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385774995
105	NC_017276	TTGGCT	2	12	224763	224774	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385774997
106	NC_017276	GCTGGA	2	12	225765	225776	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385774998
107	NC_017276	GCTATT	2	12	227194	227205	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385774999
108	NC_017276	GTAAGC	2	12	227583	227594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017276	TTACAT	2	12	229758	229769	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_017276	GTAATC	2	12	235629	235640	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385775008
111	NC_017276	GAAGAG	2	12	237379	237390	50 %	0 %	50 %	0 %	385775010
112	NC_017276	AATTAA	2	12	237392	237403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385775010
113	NC_017276	AACAAT	2	12	240714	240725	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385775014
114	NC_017276	TACCCA	2	12	242449	242460	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	385775017
115	NC_017276	CCTATA	2	12	242688	242699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385775017
116	NC_017276	TTCTTT	2	12	244478	244489	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385775019
117	NC_017276	ATATTA	2	12	250220	250231	50 %	50 %	0 %	0 %	385775023
118	NC_017276	GTTATA	2	12	252091	252102	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385775025
119	NC_017276	CTTCAA	2	12	252785	252796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385775025
120	NC_017276	AAGTTG	2	12	256085	256096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385775030
121	NC_017276	TTCTAT	2	12	267761	267772	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385775041
122	NC_017276	AATAGG	2	12	268087	268098	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385775041
123	NC_017276	AGTTAC	2	12	271112	271123	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385775045
124	NC_017276	TTTTTA	2	12	276749	276760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385775049
125	NC_017276	TTCATG	2	12	279380	279391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385775053
126	NC_017276	CTAATG	2	12	279742	279753	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385775054
127	NC_017276	AAGAGA	2	12	284234	284245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385775057
128	NC_017276	TACCGT	2	12	284515	284526	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385775058
129	NC_017276	TTACTG	2	12	286039	286050	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385775059
130	NC_017276	TTAATC	2	12	289445	289456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385775063
131	NC_017276	GAGTAG	2	12	295860	295871	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385775070
132	NC_017276	AGGTTA	2	12	300001	300012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385775075
133	NC_017276	CATCCC	2	12	309148	309159	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_017276	CTCATA	2	12	309411	309422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_017276	TAATTC	2	12	310045	310056	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385775083
136	NC_017276	CTCATT	2	12	313158	313169	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_017276	GCAATT	2	12	316917	316928	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385775091
138	NC_017276	ATGAAA	2	12	317474	317485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385775091
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140	NC_017276	AAAAGA	2	12	327604	327615	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017276	GTTGTC	2	12	328067	328078	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385775102
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146	NC_017276	TAGAAG	2	12	341949	341960	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017276	GGGTGA	2	12	342547	342558	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	385775116
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151	NC_017276	AAGGCT	2	12	353567	353578	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385775129
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158	NC_017276	ACTTAT	2	12	367678	367689	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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162	NC_017276	GAAATA	2	12	392063	392074	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385775162
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174	NC_017276	TTGGCT	2	12	431116	431127	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385775203
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219	NC_017276	AATTAA	2	12	561387	561398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385775316
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223	NC_017276	AGCTAA	2	12	575164	575175	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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228	NC_017276	ATATTA	2	12	587175	587186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
229	NC_017276	ATTCAT	2	12	587346	587357	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385775336
230	NC_017276	ATTTTC	2	12	588016	588027	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
231	NC_017276	AGCCAA	2	12	592952	592963	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385775342
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233	NC_017276	TCCTTG	2	12	601441	601452	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385775350
234	NC_017276	GAATTG	2	12	605900	605911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385775359
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236	NC_017276	ATTCTC	2	12	610573	610584	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385775365
237	NC_017276	ACTTCC	2	12	611039	611050	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	385775366
238	NC_017276	GATGTA	2	12	620907	620918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
239	NC_017276	TTCCCT	2	12	622447	622458	0 %	50 %	0 %	50 %	385775379
240	NC_017276	AAAGGA	2	12	625162	625173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385775381
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342	NC_017276	AAGAGG	2	12	883327	883338	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
343	NC_017276	AAATGG	2	12	886684	886695	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385775636
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350	NC_017276	CTAATG	2	12	904975	904986	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385775650
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352	NC_017276	TTACAA	2	12	911372	911383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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