MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Sulfolobus islandicus REY15A chromosome

Total Repeats: 2191

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017276	GTCAC	2	10	202	211	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_017276	GATAA	2	10	1085	1094	60 %	20 %	20 %	0 %	385774743
3	NC_017276	AGAGG	2	10	1155	1164	40 %	0 %	60 %	0 %	385774743
4	NC_017276	TCCTT	2	10	3690	3699	0 %	60 %	0 %	40 %	385774747
5	NC_017276	CGTTA	2	10	3933	3942	20 %	40 %	20 %	20 %	385774747
6	NC_017276	CTGTG	2	10	4364	4373	0 %	40 %	40 %	20 %	385774748
7	NC_017276	GTAAT	2	10	4510	4519	40 %	40 %	20 %	0 %	385774748
8	NC_017276	GTTTT	2	10	4584	4593	0 %	80 %	20 %	0 %	385774748
9	NC_017276	CTAAA	2	10	4927	4936	60 %	20 %	0 %	20 %	385774749
10	NC_017276	CTTAT	2	10	5133	5142	20 %	60 %	0 %	20 %	385774749
11	NC_017276	TTAAA	2	10	5728	5737	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017276	ATGTT	2	10	5957	5966	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017276	TGTGA	2	10	5991	6000	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017276	TTTTC	2	10	6612	6621	0 %	80 %	0 %	20 %	385774750
15	NC_017276	TAATT	2	10	6699	6708	40 %	60 %	0 %	0 %	385774750
16	NC_017276	TCTTA	2	10	7007	7016	20 %	60 %	0 %	20 %	385774751
17	NC_017276	ATATA	2	10	8062	8071	60 %	40 %	0 %	0 %	385774753
18	NC_017276	GAAAT	2	10	9648	9657	60 %	20 %	20 %	0 %	385774754
19	NC_017276	TTATA	2	10	10003	10012	40 %	60 %	0 %	0 %	385774755
20	NC_017276	TCTTT	2	10	12980	12989	0 %	80 %	0 %	20 %	385774757
21	NC_017276	TACAC	2	10	13491	13500	40 %	20 %	0 %	40 %	385774757
22	NC_017276	CCATG	2	10	17060	17069	20 %	20 %	20 %	40 %	385774760
23	NC_017276	TTTCC	2	10	17164	17173	0 %	60 %	0 %	40 %	385774760
24	NC_017276	TAATT	2	10	17383	17392	40 %	60 %	0 %	0 %	385774760
25	NC_017276	TGGCT	2	10	21021	21030	0 %	40 %	40 %	20 %	385774763
26	NC_017276	AAGAG	2	10	23999	24008	60 %	0 %	40 %	0 %	385774767
27	NC_017276	CTATG	2	10	25107	25116	20 %	40 %	20 %	20 %	385774769
28	NC_017276	GAAGA	2	10	26409	26418	60 %	0 %	40 %	0 %	385774770
29	NC_017276	TATTT	2	10	26765	26774	20 %	80 %	0 %	0 %	385774770
30	NC_017276	AAAAT	2	10	26997	27006	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017276	CTTTT	2	10	27485	27494	0 %	80 %	0 %	20 %	385774771
32	NC_017276	AGTTA	2	10	28208	28217	40 %	40 %	20 %	0 %	385774772
33	NC_017276	TATCA	2	10	29922	29931	40 %	40 %	0 %	20 %	385774774
34	NC_017276	TTTCC	2	10	30770	30779	0 %	60 %	0 %	40 %	385774774
35	NC_017276	ATATG	2	10	31790	31799	40 %	40 %	20 %	0 %	385774775
36	NC_017276	TGTGG	2	10	32099	32108	0 %	40 %	60 %	0 %	385774776
37	NC_017276	CTTCT	2	10	33424	33433	0 %	60 %	0 %	40 %	385774777
38	NC_017276	GAAGG	2	10	34896	34905	40 %	0 %	60 %	0 %	385774779
39	NC_017276	ATTTT	2	10	36011	36020	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017276	CATAC	2	10	37107	37116	40 %	20 %	0 %	40 %	385774783
41	NC_017276	ATTAG	2	10	38245	38254	40 %	40 %	20 %	0 %	385774785
42	NC_017276	CTTTT	2	10	38272	38281	0 %	80 %	0 %	20 %	385774785
43	NC_017276	TGGTG	2	10	38879	38888	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017276	TTTTA	2	10	39064	39073	20 %	80 %	0 %	0 %	385774786
45	NC_017276	ATTAT	2	10	39241	39250	40 %	60 %	0 %	0 %	385774786
46	NC_017276	TACCT	2	10	41032	41041	20 %	40 %	0 %	40 %	385774788
47	NC_017276	AAGGA	2	10	41067	41076	60 %	0 %	40 %	0 %	385774788
48	NC_017276	ATTTG	2	10	42241	42250	20 %	60 %	20 %	0 %	385774790
49	NC_017276	AAGAT	2	10	44859	44868	60 %	20 %	20 %	0 %	385774794
50	NC_017276	TGAAT	2	10	44881	44890	40 %	40 %	20 %	0 %	385774794
51	NC_017276	TCTTT	2	10	46666	46675	0 %	80 %	0 %	20 %	385774796
52	NC_017276	TTTCT	2	10	46913	46922	0 %	80 %	0 %	20 %	385774796
53	NC_017276	TATAG	2	10	47700	47709	40 %	40 %	20 %	0 %	385774796
54	NC_017276	AAAGT	2	10	49683	49692	60 %	20 %	20 %	0 %	385774799
55	NC_017276	GATAA	2	10	51663	51672	60 %	20 %	20 %	0 %	385774801
56	NC_017276	TCTTT	2	10	53292	53301	0 %	80 %	0 %	20 %	385774803
57	NC_017276	ATTTA	2	10	54610	54619	40 %	60 %	0 %	0 %	385774803
58	NC_017276	TTTCT	2	10	54662	54671	0 %	80 %	0 %	20 %	385774803
59	NC_017276	TACCT	2	10	57092	57101	20 %	40 %	0 %	40 %	385774805
60	NC_017276	CTGTA	2	10	57351	57360	20 %	40 %	20 %	20 %	385774805
61	NC_017276	ATTTA	2	10	57605	57614	40 %	60 %	0 %	0 %	385774805
62	NC_017276	CATTT	2	10	58267	58276	20 %	60 %	0 %	20 %	385774806
63	NC_017276	TAAAT	2	10	60149	60158	60 %	40 %	0 %	0 %	385774807
64	NC_017276	TAATT	2	10	60863	60872	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017276	CAACA	2	10	60966	60975	60 %	0 %	0 %	40 %	385774809
66	NC_017276	AGCTA	2	10	62750	62759	40 %	20 %	20 %	20 %	385774810
67	NC_017276	ATCCC	2	10	64811	64820	20 %	20 %	0 %	60 %	385774812
68	NC_017276	TTAAT	2	10	65191	65200	40 %	60 %	0 %	0 %	385774812
69	NC_017276	AAGCC	2	10	66447	66456	40 %	0 %	20 %	40 %	385774814
70	NC_017276	GTTTT	2	10	71900	71909	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017276	AGGAT	2	10	72482	72491	40 %	20 %	40 %	0 %	385774824
72	NC_017276	ATTGA	2	10	73181	73190	40 %	40 %	20 %	0 %	385774825
73	NC_017276	GGAAT	2	10	74942	74951	40 %	20 %	40 %	0 %	385774827
74	NC_017276	ACTTT	2	10	76443	76452	20 %	60 %	0 %	20 %	385774829
75	NC_017276	CTTAT	2	10	77916	77925	20 %	60 %	0 %	20 %	385774831
76	NC_017276	TCTTT	2	10	78460	78469	0 %	80 %	0 %	20 %	385774831
77	NC_017276	ATGTG	2	10	78900	78909	20 %	40 %	40 %	0 %	385774831
78	NC_017276	TTGAG	2	10	78939	78948	20 %	40 %	40 %	0 %	385774831
79	NC_017276	CTCTT	2	10	79848	79857	0 %	60 %	0 %	40 %	385774832
80	NC_017276	TCAGC	2	10	80549	80558	20 %	20 %	20 %	40 %	385774833
81	NC_017276	ATATG	2	10	82030	82039	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017276	AGATT	2	10	88859	88868	40 %	40 %	20 %	0 %	385774841
83	NC_017276	TAGCA	2	10	89264	89273	40 %	20 %	20 %	20 %	385774842
84	NC_017276	ATATT	2	10	89755	89764	40 %	60 %	0 %	0 %	385774842
85	NC_017276	TTTAA	2	10	91781	91790	40 %	60 %	0 %	0 %	385774843
86	NC_017276	CTAAT	2	10	92482	92491	40 %	40 %	0 %	20 %	385774844
87	NC_017276	AATTA	2	10	92777	92786	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017276	CTTTA	2	10	92813	92822	20 %	60 %	0 %	20 %	385774845
89	NC_017276	TTAAG	2	10	94220	94229	40 %	40 %	20 %	0 %	385774847
90	NC_017276	ACGAT	2	10	94364	94373	40 %	20 %	20 %	20 %	385774847
91	NC_017276	AACGT	2	10	94414	94423	40 %	20 %	20 %	20 %	385774847
92	NC_017276	AGTCT	2	10	95940	95949	20 %	40 %	20 %	20 %	385774849
93	NC_017276	AGTTA	2	10	96747	96756	40 %	40 %	20 %	0 %	385774850
94	NC_017276	TCCAT	2	10	96980	96989	20 %	40 %	0 %	40 %	385774850
95	NC_017276	CTATC	2	10	97355	97364	20 %	40 %	0 %	40 %	385774851
96	NC_017276	TTTAG	2	10	97777	97786	20 %	60 %	20 %	0 %	385774851
97	NC_017276	TTTCT	2	10	97936	97945	0 %	80 %	0 %	20 %	385774851
98	NC_017276	CCAAT	2	10	99417	99426	40 %	20 %	0 %	40 %	385774853
99	NC_017276	TAAGT	2	10	99653	99662	40 %	40 %	20 %	0 %	385774853
100	NC_017276	AAGTA	2	10	101060	101069	60 %	20 %	20 %	0 %	385774854
101	NC_017276	CAACT	2	10	101875	101884	40 %	20 %	0 %	40 %	385774855
102	NC_017276	TTATC	2	10	102655	102664	20 %	60 %	0 %	20 %	385774856
103	NC_017276	AAATA	2	10	104804	104813	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017276	ATATC	2	10	105159	105168	40 %	40 %	0 %	20 %	385774859
105	NC_017276	TAAGA	2	10	106555	106564	60 %	20 %	20 %	0 %	385774860
106	NC_017276	TTATC	2	10	106585	106594	20 %	60 %	0 %	20 %	385774860
107	NC_017276	TGATA	2	10	109890	109899	40 %	40 %	20 %	0 %	385774864
108	NC_017276	CTTTT	2	10	111246	111255	0 %	80 %	0 %	20 %	385774865
109	NC_017276	ATATT	2	10	111467	111476	40 %	60 %	0 %	0 %	385774866
110	NC_017276	TTTCC	2	10	112274	112283	0 %	60 %	0 %	40 %	385774867
111	NC_017276	GCTTT	2	10	113101	113110	0 %	60 %	20 %	20 %	385774867
112	NC_017276	CTATG	2	10	113348	113357	20 %	40 %	20 %	20 %	385774867
113	NC_017276	ATTTT	2	10	113960	113969	20 %	80 %	0 %	0 %	385774869
114	NC_017276	AGTGC	2	10	114413	114422	20 %	20 %	40 %	20 %	385774869
115	NC_017276	ACATT	2	10	114832	114841	40 %	40 %	0 %	20 %	385774870
116	NC_017276	TACAT	2	10	114991	115000	40 %	40 %	0 %	20 %	385774870
117	NC_017276	CATGC	2	10	115920	115929	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_017276	CACTA	2	10	116724	116733	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
119	NC_017276	GAGAT	2	10	118422	118431	40 %	20 %	40 %	0 %	385774874
120	NC_017276	CTTCA	2	10	118964	118973	20 %	40 %	0 %	40 %	385774875
121	NC_017276	TTTCC	2	10	119449	119458	0 %	60 %	0 %	40 %	385774875
122	NC_017276	AAATT	2	10	121071	121080	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017276	GATTA	2	10	121529	121538	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017276	GTAGT	2	10	121932	121941	20 %	40 %	40 %	0 %	385774878
125	NC_017276	TGGGT	2	10	122121	122130	0 %	40 %	60 %	0 %	385774878
126	NC_017276	TAGAA	2	10	123248	123257	60 %	20 %	20 %	0 %	385774879
127	NC_017276	AATTT	2	10	123501	123510	40 %	60 %	0 %	0 %	385774879
128	NC_017276	AAAGA	2	10	124948	124957	80 %	0 %	20 %	0 %	385774881
129	NC_017276	TATCT	2	10	128078	128087	20 %	60 %	0 %	20 %	385774885
130	NC_017276	ATATA	2	10	129614	129623	60 %	40 %	0 %	0 %	385774887
131	NC_017276	AGTAA	2	10	129782	129791	60 %	20 %	20 %	0 %	385774887
132	NC_017276	AAGCG	2	10	130117	130126	40 %	0 %	40 %	20 %	385774888
133	NC_017276	ATTTC	2	10	131849	131858	20 %	60 %	0 %	20 %	385774891
134	NC_017276	GAAAA	2	10	134470	134479	80 %	0 %	20 %	0 %	385774893
135	NC_017276	AAGGT	2	10	134857	134866	40 %	20 %	40 %	0 %	385774893
136	NC_017276	AAATA	2	10	135117	135126	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017276	CTTAA	2	10	139078	139087	40 %	40 %	0 %	20 %	385774898
138	NC_017276	GAGTC	2	10	143158	143167	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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383	NC_017276	CCCTC	2	10	434082	434091	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
384	NC_017276	TTATT	2	10	435590	435599	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
385	NC_017276	AGCTT	2	10	436720	436729	20 %	40 %	20 %	20 %	385775208
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395	NC_017276	GAGTA	2	10	450010	450019	40 %	20 %	40 %	0 %	385775220
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401	NC_017276	ATCAC	2	10	457129	457138	40 %	20 %	0 %	40 %	385775223
402	NC_017276	AACTG	2	10	457189	457198	40 %	20 %	20 %	20 %	385775223
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