MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Sulfolobus islandicus HVE10/4 chromosome

Total Repeats: 164

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017275	TACAAA	2	12	5587	5598	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_017275	TGGTAT	2	12	17654	17665	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017275	CTTTTC	2	12	32572	32583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017275	TATTTA	2	12	38100	38111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017275	TCTAGT	2	12	47970	47981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_017275	AATAAA	2	12	71887	71898	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017275	AGTTAA	2	12	90649	90660	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017275	TTACCA	2	12	116109	116120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_017275	GTATGA	2	12	116164	116175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017275	AAAATA	2	12	130014	130025	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017275	AATATT	2	12	174766	174777	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017275	GTAAGC	2	12	225310	225321	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_017275	TTACAT	2	12	227485	227496	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_017275	CATCCC	2	12	302703	302714	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_017275	AGGGGT	2	12	302926	302937	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017275	CTCATA	2	12	304189	304200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017275	CTCATT	2	12	307936	307947	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017275	AAAAGA	2	12	323585	323596	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017275	CTTTTC	2	12	346273	346284	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017275	TCTGAT	2	12	356435	356446	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_017275	ATTATA	2	12	356555	356566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017275	TGGAGG	2	12	360595	360606	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017275	AGCGCC	2	12	361370	361381	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_017275	AATAAA	2	12	361519	361530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017275	AATTAT	2	12	370837	370848	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017275	TATAGT	2	12	372439	372450	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017275	ATATTA	2	12	374712	374723	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017275	CATCCC	2	12	378063	378074	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_017275	CTCATA	2	12	378326	378337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_017275	TAGAAG	2	12	381638	381649	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017275	TTTATA	2	12	435885	435896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017275	CAAGAA	2	12	440741	440752	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_017275	TTATAT	2	12	441898	441909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017275	AAAAGT	2	12	445612	445623	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017275	CTCATA	2	12	455645	455656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_017275	AATTTT	2	12	457093	457104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017275	ACTTTC	2	12	469148	469159	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_017275	ACTTAT	2	12	485996	486007	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_017275	TTGGAT	2	12	487523	487534	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017275	CTCATA	2	12	503172	503183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_017275	ATGATA	2	12	503225	503236	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017275	AAATAT	2	12	519272	519283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017275	CGTTTT	2	12	523254	523265	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_017275	GTATGA	2	12	524241	524252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017275	ATAAGT	2	12	541919	541930	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017275	AGAACC	2	12	544680	544691	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017275	CTATGG	2	12	544875	544886	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_017275	AAGAGG	2	12	546594	546605	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017275	TAGATT	2	12	547005	547016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017275	AATACA	2	12	550064	550075	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_017275	CCGAGG	2	12	552400	552411	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017275	ACTTAT	2	12	554877	554888	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_017275	ATAAGT	2	12	563357	563368	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017275	AATTTT	2	12	572862	572873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017275	ACTTAT	2	12	573300	573311	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_017275	AATTTT	2	12	576902	576913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017275	TATTTT	2	12	578312	578323	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017275	ATATTA	2	12	580666	580677	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017275	TTGGAA	2	12	597720	597731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017275	AAACAT	2	12	620286	620297	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_017275	ATATAA	2	12	622042	622053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017275	TACATC	2	12	669488	669499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_017275	GTTTTT	2	12	684939	684950	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017275	ATGAAA	2	12	701286	701297	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017275	CTATAA	2	12	713722	713733	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_017275	CATCCC	2	12	721627	721638	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_017275	CTCATA	2	12	723109	723120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_017275	AATTTT	2	12	727451	727462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017275	TAGTTT	2	12	740057	740068	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017275	TTAGTT	2	12	740656	740667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017275	TTAGTT	2	12	741783	741794	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017275	TTAGTT	2	12	741842	741853	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_017275	TTAGTT	2	12	741961	741972	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017275	TAGTTT	2	12	742020	742031	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017275	TTATCA	2	12	753090	753101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_017275	ACTTCC	2	12	763206	763217	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017275	ATAATT	2	12	766665	766676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017275	TCACTA	2	12	777467	777478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_017275	CATCTC	2	12	798919	798930	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_017275	AAATTT	2	12	820435	820446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017275	TATTTA	2	12	827451	827462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017275	GTATGA	2	12	827674	827685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017275	ATACTA	2	12	843106	843117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_017275	AAATGG	2	12	858070	858081	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_017275	GTTAAG	2	12	858451	858462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017275	CTTCTC	2	12	863356	863367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
87	NC_017275	GGTAAA	2	12	870447	870458	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017275	TAGTAT	2	12	892460	892471	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017275	ATTGAA	2	12	894608	894619	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017275	TTATAT	2	12	918866	918877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017275	AAGAGG	2	12	966415	966426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017275	TAGGGA	2	12	967362	967373	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017275	AGTGTA	2	12	970573	970584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017275	AATTTT	2	12	981611	981622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017275	TAGGGA	2	12	982653	982664	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017275	ATAAGT	2	12	983586	983597	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017275	GATGAA	2	12	987802	987813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017275	AAATAT	2	12	1005199	1005210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017275	ACTTAT	2	12	1013813	1013824	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_017275	AAGAGG	2	12	1015820	1015831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017275	TAATAC	2	12	1044513	1044524	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_017275	TTACAA	2	12	1047944	1047955	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_017275	AAAACA	2	12	1073007	1073018	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_017275	GTAAGC	2	12	1128137	1128148	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_017275	AAAGTA	2	12	1145726	1145737	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017275	TAAAGA	2	12	1198157	1198168	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017275	ACTCTT	2	12	1208701	1208712	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_017275	ACTTAT	2	12	1377060	1377071	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_017275	TTATGA	2	12	1387684	1387695	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017275	CTTTTT	2	12	1411567	1411578	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_017275	AATTTT	2	12	1419746	1419757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017275	GTATGA	2	12	1421201	1421212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017275	TTACCT	2	12	1523626	1523637	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_017275	AAGAGA	2	12	1528205	1528216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017275	TCTAAG	2	12	1528522	1528533	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_017275	TACAAA	2	12	1557699	1557710	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_017275	TAAAAA	2	12	1582834	1582845	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017275	TATAAA	2	12	1787615	1787626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017275	ATATTA	2	12	1797375	1797386	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017275	CCTCTT	2	12	1799804	1799815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_017275	AATATA	2	12	1899978	1899989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017275	ATTTAT	2	12	1899993	1900004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017275	ACTATC	2	12	1923844	1923855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017275	ACCTTT	2	12	1950375	1950386	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_017275	GATAAA	2	12	2025185	2025196	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017275	TTAGCT	2	12	2025266	2025277	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_017275	ATATTA	2	12	2026008	2026019	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017275	TAACAT	2	12	2061251	2061262	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_017275	TTAATT	2	12	2076519	2076530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_017275	TCCTTT	2	12	2109554	2109565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_017275	TTTATG	2	12	2137825	2137836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_017275	ATCTTC	2	12	2171172	2171183	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_017275	TACAAA	2	12	2179119	2179130	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_017275	TATTTT	2	12	2187811	2187822	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017275	TTCCTT	2	12	2232295	2232306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_017275	ATCATA	2	12	2238933	2238944	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_017275	TTATTT	2	12	2242832	2242843	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017275	AAAAAG	2	12	2255469	2255480	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017275	ATAAGT	2	12	2265684	2265695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017275	ATAAAA	2	12	2321786	2321797	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017275	TAAAAT	2	12	2321809	2321820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017275	AAAAAG	2	12	2338403	2338414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017275	AGTTTA	2	12	2349277	2349288	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017275	TTTTAA	2	12	2353746	2353757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017275	TTACGT	2	12	2362042	2362053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_017275	ATAAGT	2	12	2381750	2381761	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017275	AACATG	2	12	2386063	2386074	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_017275	AAAAGA	2	12	2388287	2388298	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_017275	ATAAAA	2	12	2453890	2453901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_017275	TAATAT	2	12	2456095	2456106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_017275	TAAAAA	2	12	2483164	2483175	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_017275	GTATGA	2	12	2484657	2484668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017275	AATATT	2	12	2491341	2491352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017275	CATCCC	2	12	2493090	2493101	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
155	NC_017275	ATATTT	2	12	2513756	2513767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_017275	TATATG	2	12	2524839	2524850	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
157	NC_017275	AAAGAT	2	12	2543148	2543159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_017275	ATAATT	2	12	2543968	2543979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_017275	GCAGAT	2	12	2585218	2585229	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
160	NC_017275	TAAATT	2	12	2588277	2588288	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_017275	TCTTTT	2	12	2589069	2589080	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
162	NC_017275	TAAACA	2	12	2601564	2601575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
163	NC_017275	AAAAAT	2	12	2611163	2611174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_017275	ATAAGT	2	12	2621684	2621695	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.